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公开(公告)号：CN108998550A
公开(公告)日：2018-12-14
申请号：CN201810785798.3
申请日：2018-07-17
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 石家庄博瑞迪生物技术有限公司
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11 , C40B40/06
摘要： 本发明提供用于水稻基因分型的SNP分子标记及其应用。所述分子标记选自1200个SNP标记中的至少一个，它们的信息如表1所示。利用本发明的SNP分子标记及其组合可以对水稻种质资源进行分子标记指纹分析，对水稻杂交群体后代进行基因型鉴定，对水稻品种真实性进行鉴定，对水稻育种材料遗传背景进行分析和筛选、对农艺性状进行关联分析，具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN108998550B
公开(公告)日：2021-09-03
申请号：CN201810785798.3
申请日：2018-07-17
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 石家庄博瑞迪生物技术有限公司
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11 , C40B40/06
摘要： 本发明提供用于水稻基因分型的SNP分子标记及其应用。所述分子标记选自1200个SNP标记中的至少一个，它们的信息如表1所示。利用本发明的SNP分子标记及其组合可以对水稻种质资源进行分子标记指纹分析，对水稻杂交群体后代进行基因型鉴定，对水稻品种真实性进行鉴定，对水稻育种材料遗传背景进行分析和筛选、对农艺性状进行关联分析，具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN109727642B
公开(公告)日：2021-03-23
申请号：CN201910060405.7
申请日：2019-01-22
申请人： 隆平农业发展股份有限公司 , 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 中信科技发展有限公司 , 长沙百奥云数据科技有限公司
IPC分类号： G16B25/00
摘要： 本发明实施例提供基于随机森林模型的全基因组预测方法及装置，所述方法包括：获取待预测的杂交种的基因型数据；根据预先建立的随机森林模型和所述杂交种的基因型数据，对杂交组合后代的表型数据进行预测，得到表型数据的预测结果；结合育种资源和规模，根据所述表型数据的预测结果，选择具有高产潜力的候选杂交组合。利用本发明提供的预测方法可根据亲本基因型推测杂种的基因型，从而对其表型数据进行预测，进而推荐具有高产潜力的杂交组合。
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公开(公告)号：CN109727640B
公开(公告)日：2021-03-02
申请号：CN201910060401.9
申请日：2019-01-22
申请人： 隆平农业发展股份有限公司 , 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 中信科技发展有限公司 , 长沙百奥云数据科技有限公司
IPC分类号： G16B25/00
摘要： 本发明实施例提供基于自动机器学习技术的全基因组预测方法及装置，所述方法包括：获取待预测的杂交种的基因型数据；根据预先建立的自动机器学习预测模型和所述杂交种的基因型数据，对杂交组合后代的表型数据进行预测，得到表型数据预测结果；结合育种资源和规模，根据所述表型数据预测结果，选择具有高产潜力的候选杂交组合。利用本发明提供的预测方法可根据亲本基因型推测杂种的基因型，从而对其表型数据进行预测，进而推荐具有高产潜力的杂交组合。
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公开(公告)号：CN108060261B
公开(公告)日：2021-01-15
申请号：CN201810089343.8
申请日：2018-01-30
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及分子生物学与生物信息学领域，具体公开了一种对玉米SNP标记组合进行捕获测序的方法及其应用。本发明通过筛选可覆盖玉米10条染色体的904个SNP标记，并通过两步PCR完成捕获过程，所采用的建库方法可以兼容Illumina HiseqX二代测序平台，采用2*150测序模式，对捕获片段进行高通量测序，其成本是现有捕获测序技术四分之一。相对于其它SNP标记基因型分型技术，例如芯片检测和单个SNP位点检测的KASP技术，本发明的检测成本是其十分之一甚至更低，在实际育种过程中具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号：CN109609676B
公开(公告)日：2021-12-14
申请号：CN201811593497.7
申请日：2018-12-25
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明提供与玉米抗灰斑病主效QTL‑qRgls1共分离的SNP标记及应用。所述SNP标记选自标记SNP1‑SNP3中的至少一个，所述标记SNP1‑SNP3的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:5‑7所示。本发明还提供用于检测所述SNP标记的KASP引物。利用本发明提供的SNP标记及其KASP引物能够高效且低成本地鉴定出玉米灰斑病抗性材料，可实现对玉米灰斑病抗病基因的高通量检测。
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公开(公告)号：CN108004236B
公开(公告)日：2020-11-06
申请号：CN201711458417.2
申请日：2017-12-28
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司
IPC分类号： C12N15/11 , C12Q1/6895 , C12Q1/6858
摘要： 本发明涉及分子生物学，具体公开了一种玉米茎腐病抗病分子育种方法及其应用。本发明提供的与玉米茎腐病抗性相关的KASP分子标记可用于茎腐病抗病分子育种和玉米种质资源分析，同时具有成本相对较低和应用灵活性高的特点，可实现高通量检测。所述分子标记为JFB‑3，JFB‑4，JFB‑5，JFB‑6，JFB‑7，JFB‑8或JFB‑9，可由SEQ ID NO.8～28所示的引物分组扩增得到。
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公开(公告)号：CN109536633A
公开(公告)日：2019-03-29
申请号：CN201811593457.2
申请日：2018-12-25
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明提供与玉米抗灰斑病主效QTL-qRgls2共分离的SNP标记及应用。所述SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示；其中，第679位碱基为多态性位点，该处碱基为A或G。本发明还提供用于检测所述SNP标记的KASP引物。利用本发明提供的SNP标记及其KASP引物能够高效且低成本地鉴定出玉米灰斑病抗性材料，可实现对玉米灰斑病抗病基因的高通量检测。
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公开(公告)号：CN108004236A
公开(公告)日：2018-05-08
申请号：CN201711458417.2
申请日：2017-12-28
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司
IPC分类号： C12N15/11 , C12Q1/6895 , C12Q1/6858
CPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156 , C12Q2531/113 , C12Q2563/107
摘要： 本发明涉及分子生物学，具体公开了一种玉米茎腐病抗病分子育种方法及其应用。本发明提供的与玉米茎腐病抗性相关的KASP分子标记可用于茎腐病抗病分子育种和玉米种质资源分析，同时具有成本相对较低和应用灵活性高的特点，可实现高通量检测。所述分子标记为JFB-3，JFB-4，JFB-5，JFB-6，JFB-7，JFB-8或JFB-9，可由SEQ ID NO.8～28所示的引物分组扩增得到。
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公开(公告)号：CN107502661A
公开(公告)日：2017-12-22
申请号：CN201710758666.7
申请日：2017-08-29
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 安徽隆平高科种业有限公司
CPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
摘要： 本发明涉及分子生物学，具体公开了与玉米茎腐病抗性相关的SNP分子标记组合及其应用。本发明利用测序数据和多年多点的表型数据进行关联分析，得到与玉米茎腐病相关的SNP位点，进一步开发开发了11个与玉米茎腐病抗性相关的SNP分子标记，并通过分子标记组合检测的方法提高检测准确率，在环境因素影响较小的情况下准确率可达90％以上。本发明还鉴定出与茎腐病抗病相关的染色体区段，为进一步的基因克隆和利用提供基础。利用本发明所开发的分子标记进行辅助育种，可以实现抗性的快速鉴定，减少田间测试成本，从而节约育种成本、加快育种进程。
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