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公开(公告)号：CN115019892A
公开(公告)日：2022-09-06
申请号：CN202210662702.0
申请日：2022-06-13
申请人： 郑州大学第一附属医院
摘要： 本发明公开了一种环境微生物群宏基因组测序中序列覆盖度的置信测定方法，该方法首先对参考基因组进行随机化区域划分，然后将测序序列和基因组进行比对，对覆盖到的随机区域进行占比统计得到随机覆盖度，最后基于随机覆盖度数据进行概率置信测定。本发明能够用于矫正环境微生物群组宏基因组测序中的假阳性问题，为环境微生物检测的可靠度提供了高置信参考。
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公开(公告)号：CN118447925A
公开(公告)日：2024-08-06
申请号：CN202311233554.1
申请日：2023-09-22
申请人： 郑州大学第一附属医院
摘要： 本发明提供了一种环境宏基因组的基因组组成构建方法，该方法是在宏基因组数据分析中，在序列唯一比对和多重比对完成后，根据唯一比对结果计算每个物种的唯一风度系数unico{specy}；然后根据每个物种的唯一风度系数unico{specy}和多重比对结果，计算每个多重比对序列被分配到该物种的权重multi{specy}，最后将每个物种的唯一风度系数unico{specy}及该物种对应的所有权重multi{specy}合并起来计算得到每个物种的基因组丰度LNR{specy}。本发明用于减少宏基因组的物种假阳性。
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公开(公告)号：CN118212971A
公开(公告)日：2024-06-18
申请号：CN202410321971.X
申请日：2024-03-20
申请人： 郑州大学第一附属医院
摘要： 本发明公开了一种环境宏基因组进化特征置信度的构建算法，该算法包含如下步骤：A、构建基线数据；B、PGR抽样比对；C、SGR比对；D、整合构建系统发育树；E、基于双交叉变量进行迭代奖励计算得到环境宏基因组进化特征的置信度值。本发明基于双交叉变量进行迭代奖励计算，进而得到环境宏基因组进化特征的置信度值，解决了由于宏基因组深度不够造成的参考基因组覆盖度不足等问题。
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公开(公告)号：CN115245563A
公开(公告)日：2022-10-28
申请号：CN202210002573.2
申请日：2022-01-05
申请人： 郑州大学第一附属医院
摘要： 本发明公开了一种用于抑制肿瘤细胞的m6A去甲基化酶FTO磁性颗粒的制备装置及方法，通过设有的制备设备来获得修饰的四氧化三铁纳米粒子，减少了反应过程中的繁琐步骤，有利于反应过程的控制，同时可以避免反应过程中外界因素的干扰，防止外界空气进入设备中造成粒子的氧化，有利于制备更加稳定且纯度较高、粒径均匀的优质磁性纳米粒子，同时选用PEG为反应溶剂，PVP为修饰剂，并严格控制反应过程中的反应温度、修饰剂的添加量和添加的修饰剂的等级类别，可以制备处尺寸适中、形状规则、分散性较好，且胶体稳定性高的修饰磁性四氧化三铁纳米粒子，为后续蛋白分子的依附提供了良好的基础，使得吸附的蛋白分子不易从纳米颗粒表面脱落。
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公开(公告)号：CN115019892B
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202210662702.0
申请日：2022-06-13
申请人： 郑州大学第一附属医院
摘要： 本发明公开了一种环境微生物群宏基因组测序中序列覆盖度的置信测定方法，该方法首先对参考基因组进行随机化区域划分，然后将测序序列和基因组进行比对，对覆盖到的随机区域进行占比统计得到随机覆盖度，最后基于随机覆盖度数据进行概率置信测定。本发明能够用于矫正环境微生物群组宏基因组测序中的假阳性问题，为环境微生物检测的可靠度提供了高置信参考。
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公开(公告)号：CN118366544A
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202410321968.8
申请日：2024-03-20
申请人： 郑州大学第一附属医院
摘要： 本发明公开了一种不同标本基因组拷贝数突变一致性数据模型及其应用，首先构建标准数据格式以对基准样本中的所有CNV模式进行全局深入表征，作为后续数据处理的全局一致性数据基线，然后在上述数据基线的基础上构建覆盖度算法将基准样本中的每一个CNV片段与查询样本中的所有CNV片段进行比较，同时允许基于算法变量的返回数值进行数据集分类表征，最后在上述数据分析和处理的基础上构建能够张开待测基因组内部精细结构进行数据汇总归纳处理并返回单一标量数值的一致性表征数据工具，得到可连续量化的一致性参数。本发明总体上构建了一种高效、准确且可重复的算法模型，能够全局化深入和精准的比较不同标本中的基因组拷贝数突变的一致性。
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