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公开(公告)号：JP5649018B2
公开(公告)日：2015-01-07
申请号：JP2006182062
申请日：2006-06-30
申请人： タグシクス・バイオ株式会社 , 独立行政法人理化学研究所
IPC分类号： C12N15/09 , C07H21/00 , C07H21/02 , C07H21/04 , C12Q1/68 , G01N21/78 , G01N33/53 , G01N33/542
CPC分类号： C12Q1/6816 , C12Q1/6844 , Y10T436/143333 , C12Q2563/107 , C12Q2525/101 , C12Q2525/117
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公开(公告)号：JP5424414B2
公开(公告)日：2014-02-26
申请号：JP2010505950
申请日：2009-03-31
申请人： 独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社
IPC分类号： C12N15/09 , A61K31/7115 , C07H21/04 , C12Q1/68
CPC分类号： C07H21/04 , C12Q1/6806 , C12Q1/6844 , C12Q1/6853 , C12Q1/6869 , C12Q2525/101 , C12Q2525/117
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公开(公告)号：JPWO2011132801A1
公开(公告)日：2013-07-18
申请号：JP2012511735
申请日：2011-04-21
申请人： 独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社
IPC分类号： C12Q1/68 , C07H19/044 , G01N33/53 , G01N33/542
CPC分类号： G01N21/6486 , C07H19/044 , C12Q1/6818 , C12Q2525/117
摘要： 本発明は、消光性ならびに蛍光性の核酸塩基類似体とその応用を提供することを目的とする。本発明の消光剤は、式I【化1】[式Iにおいて、R1は及びR2はリボース、デオキシリボース、水素、水酸基、SH基、ハロゲン、置換又は未置換の、炭素数2ないし10のアルキル基、アルケニル基又はアルキニル基、窒素原子または硫黄原子を含む、1又は複数の5員ヘテロ環、1又は複数の6員ヘテロ環、1又は複数の複素環ヘテロ環、1又は複数の芳香族環、糖、糖鎖、アミノ酸、ペプチド、リンカーを介して結合した蛍光性分子からなる群から独立に選択される基である]。で示す2−ニトロピロール構造を有することを特徴とする。
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公开(公告)号：JPWO2009123216A1
公开(公告)日：2011-07-28
申请号：JP2010505950
申请日：2009-03-31
申请人： 独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社
IPC分类号： C12N15/09 , A61K31/7115 , C07H21/04 , C12Q1/68
CPC分类号： C07H21/04 , C12Q1/6806 , C12Q1/6844 , C12Q1/6853 , C12Q1/6869 , C12Q2525/101 , C12Q2525/117
摘要： 本発明は、高選択・高効率で複製が可能なDs(5−アミノ−7−(2−チエニル)−3H−イミダゾ[4,5−b]ピリジン−3−イル基)−Pa誘導体(4位にπ電子系の置換基を結合した2−ニトロ−1H−ピロール−1−イル基)の人工塩基対、および当該人工塩基対を含む核酸の複製方法に関する。本発明はまた、機能性置換基を結合した人工塩基を核酸の複製反応によりDNA中に導入する方法に関する。本発明はさらに、核酸プールの中から人工塩基対を含む核酸を複製し、選択的に回収する方法に関する。本発明は、さらにまた、人工塩基を含む核酸の高効率かつ高選択的な複製を実現するためのDNA中の人工塩基近傍の天然型塩基の配列を決定する方法に関する。
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公开(公告)号：JPWO2013058306A1
公开(公告)日：2015-04-02
申请号：JP2013539680
申请日：2012-10-18
申请人： 独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社
IPC分类号： C12N15/09 , A61K31/713 , A61K48/00 , A61P43/00 , C12N15/113 , C12N15/115
CPC分类号： C12N15/1137 , C12N15/111 , C12N2310/3519 , C12N2310/531 , C12N2310/532 , C12N2310/533 , C12N2320/51
摘要： 機能性核酸の塩基配列を含む一本鎖又は二本鎖の核酸断片の核酸分解酵素に対する分解耐性能を簡便かつ低コストで強化、向上させることを課題とする。一本鎖核酸断片又は二本鎖核酸断片の少なくとも一の3′末端に、(A)2〜5個の任意のヌクレオチドからなる核酸領域、(B)gna又はgnna(ここで、各nは、独立に、g、t、a若しくはc、塩基類似体又は修飾塩基のいずれかである)の塩基配列からなる核酸領域、及び(C)前記(A)の核酸領域に相補的な塩基配列からなる核酸領域からなり、それらが5′末端側から3′末端側に向かって順番に連結されたヘアピン型DNAを連結し、かつ一本鎖核酸断片又は二本鎖核酸断片の少なくとも一の3′末端から2つのヌクレオチドの少なくとも1つが修飾されている核酸断片を提供する。
摘要翻译： 增强，以对核酸酶的单链或双核酸片段链的，包括功能性核酸以简单和低成本的碱基序列降解能力电阻，它是改善的对象。 单链核酸片段链或双链的核酸片段中的至少一个3“末端，（A）由2至5的任何核苷酸，（B）或GNA Gnna（其中每个n是核酸区域， 独立地，选自G，T，A，或c，碱基类似物，或由IS的核苷酸序列的）任何经修饰的碱基的核酸区域，和（C），以的核酸区域互补的核苷酸序列的（a）中 它由核酸区域，至少一个3“端5朝向前端，以便连接所述连接的发夹DNA”末端至3“侧，将单链核酸片段或双链核酸片段 至少两个核苷酸的一个规定，已被修饰的核酸片段。
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公开(公告)号：JPWO2013024763A1
公开(公告)日：2015-03-05
申请号：JP2013528982
申请日：2012-08-08
申请人： 独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社
IPC分类号： C12N15/115 , A61K31/7088 , A61K31/711 , A61K31/713 , A61P43/00 , C12N15/09 , C12Q1/68 , G01N33/53
CPC分类号： G01N33/543 , A61K31/7105 , C12N15/1048 , C12N15/115 , C12N2310/16 , C12N2320/13 , C12N2320/30 , C12N2330/30 , C12Q1/6834 , G01N33/5308 , G01N2333/47 , G01N2333/4703
摘要： 標的物質との特異性及び結合性が高い核酸アプタマー、特にDNAアプタマーを効率的、かつ簡便に製造する方法を開発し、提供することを目的とする。一本鎖核酸ライブラリーと標的物質とを溶液中で混合して、一本鎖核酸と標的物質の複合体を形成させる複合体形成工程、前工程後の溶液と固相担体を混合して、標的物質及び/又は固相担体に吸着させた結合子を介して複合体を固相担体に固定化する固定化工程、固相担体に固定化された複合体を溶液から回収する回収工程、複合体中の一本鎖核酸を回収後、核酸増幅法によって増幅させる増幅工程、及び増幅工程で得られた二本鎖核酸を一本鎖化した後、分子内立体構造を形成させる一本鎖核酸調製工程を含む核酸アプタマーの製造方法を提供する。
摘要翻译： 特异性和结合高核酸适体与靶物质，开发了特别有效的DNA适体，以及用于方便地产生，其目的在于提供一种方法。 的单链核酸文库和靶物质的溶液混合时，复合物形成步骤，以形成单链核酸和靶物质的复合体，溶液和固体支持物上一步骤之后的混合物， 目标物质和/或通过吸附到固定化的回收以从该溶液中，该复合固体支持复合物的回收步骤，固相载体组合子固定在固体支持复合物的定影步骤 回收在体内的单链核酸，经过单链在扩增步骤和扩增核酸扩增方法的扩增步骤中获得的双链核酸后，单链核酸，以形成分子内构象 提供一种制造核酸适体，其包括制备步骤的方法。
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公开(公告)号：JPWO2013073602A1
公开(公告)日：2015-04-02
申请号：JP2013544308
申请日：2012-11-15
申请人： 独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社
IPC分类号： C12N15/115 , A61K31/7088 , A61P27/02 , A61P37/02 , A61P43/00 , C12N9/00 , C12N15/09 , C12P19/34 , C12Q1/68 , C40B40/06
CPC分类号： C12N15/115 , A61K48/00 , C12N15/1048 , C12N15/111 , C12N15/113 , C12N2310/12 , C12N2310/16 , C12N2310/33 , C12N2310/331 , C12N2320/13 , C12Q1/6869 , G01N33/5308 , C12Q2525/101 , C12Q2525/205
摘要： 従来法で得られる核酸アプタマーよりも標的物質との特異性及び結合性が高い核酸アプタマー、特にDNAアプタマーを効率的に製造する方法を開発し、提供することを目的とする。天然型ヌクレオチドと人工塩基対合可能な人工塩基を有する非天然型ヌクレオチドとを含み、かつ転写又は複製可能な核酸アプタマーを提供する。また、一本鎖核酸ライブラリーから選択される非天然型ヌクレオチド含有一本鎖核酸分子の塩基配列を決定する方法を提供する。
摘要翻译： 开发特异性和结合高核酸适体比由传统方法中，特定的方法有效地制造的DNA适体，以及提供获得的核酸适体的靶物质。 以及具有非天然核苷酸天然核苷酸和人工碱基配对假肢碱基，以提供用于转录或复制的核酸适体。 还提供了用于确定从一个单链核酸文库中选择的非天然核苷酸含有单链核酸分子的核苷酸序列的方法。
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公开(公告)号：JPWO2011132672A1
公开(公告)日：2013-07-18
申请号：JP2012511666
申请日：2011-04-19
申请人： 独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社
IPC分类号： C07H21/02 , C07H21/04 , C12N15/09 , C12N15/113
CPC分类号： C12N15/111 , A61K31/7088 , A61K31/7105 , A61K31/711 , C12N2310/531 , C12N2320/51
摘要： 機能性核酸の塩基配列を含む一本鎖又は二本鎖の核酸断片の核酸分解酵素に対する分解耐性能を簡便かつ低コストで強化、向上させることを課題とする。前記一本鎖核酸断片又は二本鎖核酸断片の少なくとも一の末端に、(A)2〜5個の任意のヌクレオチドからなる核酸領域、(B)gna又はgnna(ここで、各nは、独立に、g、t、a若しくはc、塩基類似体又は修飾塩基のいずれかである)の塩基配列からなる核酸領域、及び(C)前記(A)の核酸領域に相補的な塩基配列からなる核酸領域からなり、それらが5’末端側から3’末端側に向かって順番に連結されたヘアピン型DNAを連結する。
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公开(公告)号：JPWO2011043491A1
公开(公告)日：2013-03-04
申请号：JP2011535487
申请日：2010-10-06
申请人： 独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社
IPC分类号： C07H19/173 , C07D471/04 , C07D473/32 , C07H19/20 , C07H19/23
CPC分类号： C07D471/04 , C07D473/32 , C07H19/173 , C07H19/23 , C09K11/06 , C09K2211/1074
摘要： 本発明は、新規蛍光性核酸人工塩基であって、プリン塩基、2−デアザプリン塩基、2,7−デアザプリン塩基の6位(プリン環の6位)に複素環分子を2つ以上縮重した官能基を有する人工塩基に関する。本発明はまた、該人工塩基を含む化合物およびその誘導体、ならびに該人工塩基を含むヌクレオチドが組み込まれた核酸に関する。本発明はさらに該核酸を調製する方法に関する。本発明の人工塩基は優れた蛍光特性を有するほか、ユニバーサル塩基としても優れた性質を有する。
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公开(公告)号：JPWO2011043385A1
公开(公告)日：2013-03-04
申请号：JP2011535429
申请日：2010-10-06
申请人： 独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社
CPC分类号： C07H21/02 , C07H21/04 , C12Q1/6827 , C12Q1/6832 , C12Q2527/107 , C12Q2525/117
摘要： 本発明は、二本鎖核酸であって、少なくとも一方の核酸が、自己相補的な塩基対を形成する人工塩基、またはいずれの天然型塩基とも同程度の熱安定性で塩基対を形成する人工塩基、を有する、前記二本鎖核酸を提供する。本発明はまた、自己相補的な塩基対を形成する人工塩基、またはいずれの天然型塩基とも同程度の熱安定性で塩基対を形成する人工塩基を有する第一の核酸を第二の核酸とハイブリダイズさせる方法、および、該核酸をSNP検出、DNAチップ、DNA/RNAコンピューティング、インビトロ翻訳系への適用、に利用する方法を提供する。本発明はまた、人工塩基を核酸に導入することにより、当該核酸のハイブリダイゼーションについての熱力学的安定性を操作する方法を提供する。
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