公开(公告)号：JP4382676B2

公开(公告)日：2009-12-16

申请号：JP2004571572

申请日：2003-05-09

申请人： 岩手県

发明人： ペーター ヴィンター ,  ギュンター カール ,  デトレフ クリューガー ,  ステファニー ライヒ ,  良平 寺内 ,  英生 松村

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2539/103 ,  C12Q2525/204 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2545/114

公开(公告)号：JP2006508661A

公开(公告)日：2006-03-16

申请号：JP2004557057

申请日：2003-12-04

申请人： エージェンシー フォー サイエンス,テクノロジー アンド リサーチ

发明人： ウェイ，チアリン ,  ルアン，イージュン

IPC分类号： C12N15/09 ,  C07K14/00 ,  C12Q1/02 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q2539/103

摘要： 本発明者らは、遺伝子発現の事実を示す方法であって、 (a)ある遺伝子の末端転写配列を含む末端を有する相補的デオキシリボ核酸（cDNA）を用意する工程、(b)cDNAを、第1認識部位から離れた部位で核酸の切断を可能にする第1核酸開裂酵素、好ましくは制限エンドヌクレアーゼ、の該第1認識配列を含むリンカー配列に連結し、それによって連結核酸を形成する工程、(c)連結核酸を第1核酸開裂酵素で切断することにより、該遺伝子の末端転写配列を表すヌクレオチド配列タグを含む連結タグを付与する工程、および(d)連結タグまたはヌクレオチド配列タグの存在または同一性を検出することにより、遺伝子発現の事実を示すことを含む、上記方法を記載する。

公开(公告)号：JP2004097158A

公开(公告)日：2004-04-02

申请号：JP2002267163

申请日：2002-09-12

申请人： Kureha Chem Ind Co Ltd ,  Mikio Yamamoto ,  Naoki Yamamoto ,  呉羽化学工業株式会社 ,  山本 三毅夫 ,  山本 直樹

发明人： YAMAMOTO MIKIO ,  YAMAMOTO NAOKI ,  HIROSE KUNITAKA ,  SAKAI JUN

IPC分类号： G01N33/53 ,  C12N15/09 ,  C12N15/10 ,  C12N15/66 ,  C12Q1/68 ,  G01N37/00

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12N15/1096 ,  C12N15/66 ,  C12Q1/6855 ,  C12Q2539/103 ,  C12Q2521/313

摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for producing a cDNA tag for the identification of an expression gene and provide a method for analyzing the expression of the gene. SOLUTION: The cDNA tag for the identification of an expression gene is produced by preparing one kind of type II restriction enzyme and three kinds of type IIS restriction enzymes and combining a linker X containing the recognition sequences of the 1st and the 2nd enzymes with a linker Y containing the recognition sequence of the 3rd enzyme by using the three kinds of type IIS restriction enzymes. The cDNA tag is used as it is or converted to a linked product by a linking procedure, etc., to efficiently analyze the expression gene. COPYRIGHT: (C)2004,JPO

公开(公告)号：JP2018064554A

公开(公告)日：2018-04-26

申请号：JP2017199639

申请日：2017-10-13

申请人： アボツト・モレキユラー・インコーポレイテツド ,  ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ アズ リプレゼンティッド バイ ザ シークレタリー デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ

发明人： オリ−ピー・カリオニーミ ,  ウエ・リチャード・ムラー ,  ガイド・サウター ,  ジュハ・コノネン ,  マーリット・バーランド

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00702 ,  B01J2219/00743 ,  B01L3/5085 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/156 ,  G01N1/08 ,  G01N1/2813 ,  G01N1/312 ,  G01N33/5005 ,  G01N33/54306 ,  G01N2001/282 ,  G01N2001/288 ,  G01N2001/368 ,  G02B21/34 ,  C12Q2543/10 ,  C12Q2539/103 ,  C12Q2537/157 ,  C12Q2565/501

摘要： 【課題】癌およびトリソミーのようなさまざまな遺伝障害のマーカーとなり得る遺伝子の増幅または欠失のような、ゲノムコピー数の変化を、高い解像度で迅速かつ正確に検出する方法の提供。 【解決手段】ドナー検体をレシピエントアレイ中の割り当てられた位置に設置し、アレイのコピーを提供し、バイオマーカーを用いて各コピーで異なる生物学的分析を行うことにより、組織または他の細胞検体の迅速な分子プロファイリングを行う。異なる生物学的分析の結果を比較して、各割り当て位置において、異なる生物学的分析の結果の間に相関があるかどうかが決定される。複数の平行した分子分析(遺伝分析および免疫学的分析を含む)による遺伝障害タイプの共通な分子的特徴が検出され、組織の生物学的特徴は、臨床または他の情報と相関させて、疾病の診断または治療に使用される。 【選択図】なし

公开(公告)号：JP5213202B2

公开(公告)日：2013-06-19

申请号：JP2000578492

申请日：1999-10-28

申请人： バイシス・インコーポレーテツド ,  ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ アズ リプレゼンティッド バイ ザ シークレタリー デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ

发明人： オリ−ピー カリオニーミ ,  ウエ リチャード ムラー ,  ガイド サウター ,  ジュハ コノネン ,  マーリット バーランド

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12Q1/68 ,  B01L3/00 ,  C12M1/00 ,  G01N1/08 ,  G01N1/28 ,  G01N1/31 ,  G01N1/36 ,  G01N33/50 ,  G01N33/543 ,  G02B21/34

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00702 ,  B01J2219/00743 ,  B01L3/5085 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/156 ,  G01N1/08 ,  G01N1/2813 ,  G01N1/312 ,  G01N33/5005 ,  G01N33/54306 ,  G01N2001/282 ,  G01N2001/288 ,  G01N2001/368 ,  G02B21/34 ,  C12Q2543/10 ,  C12Q2539/103 ,  C12Q2537/157 ,  C12Q2565/501

摘要： A method is disclosed for rapid molecular profiling of tissue or other cellular specimens by placing a donor specimen in an assigned location in a recipient array, providing copies of the array, and performing a different biological analysis of each copy. The results of the different biological analyses are compared to determine if there are correlations between the results of the different biological analyses at each assigned location. In some embodiments, the specimens may be tissue specimens from different tumors, which are subjected to multiple parallel molecular (including genetic and immunological) analyses. The results of the parallel analyses are then used to detect common molecular characteristics of the genetic disorder type, which can subsequently be used in the diagnosis or treatment of the disease. The biological characteristics of the tissue can be correlated with clinical or other information, to detect characteristics associated with the tissue, such as susceptibility or resistance to particular types of drug treatment. Other examples of suitable tissues which can be placed in the matrix include tissue from transgenic or model organisms, or cellular suspensions (such as cytological preparations or specimens of liquid malignancies or cell lines).

公开(公告)号：JP2004504059A

公开(公告)日：2004-02-12

申请号：JP2002513943

申请日：2001-07-23

申请人： グローバル ジェノミクス アクティエボラーグ

发明人： エルンフォルス，パトリック ,  バウレン，ゴラン ,  リンナルッソン，ステン

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/68 ,  G06F19/20 ,  G06F19/24

CPC分类号： G06F19/20 ,  C12N15/1096 ,  C12Q1/6809 ,  G06F19/24 ,  Y02A90/24 ,  C12Q2539/103

摘要： 試料中に存在するｍＲＮＡを同定するため、さらにｍＲＮＡの発現レベルを定量化するための方法である。 遺伝子のプロファイルの同定、及び／又は発現レベルが、試料中に発現されるｍＲＮＡ分子集団の特徴的な２つの固有なパターンを形成することにより創り出され、組み合わせアルゴリズムを用いてこれらパターンを分析する。 異なる条件下にて異なる細胞型、又は同一細胞型による遺伝子の発現を比較することができる。 外部因子、発生、疾患に対する罹病性を含め、種々の細胞処理及び状態を決定する際に重要な役割をはたす遺伝子が、この方法において同定することができる。

公开(公告)号：JP2017534248A

公开(公告)日：2017-11-24

申请号：JP2017511236

申请日：2015-08-25

申请人： ザ ジョンズ ホプキンズ ユニヴァーシティー ,  ザ ジョンズ ホプキンズ ユニヴァーシティー

发明人： ジュン ルオ ,  ジュン ルオ ,  エマニュエル エス アントナラキス ,  エマニュエル エス アントナラキス ,  チャンシュエ ル ,  チャンシュエ ル ,  ウィリアム アイザックス ,  ウィリアム アイザックス

IPC分类号： C12Q1/68 ,  A61K9/08 ,  A61K9/10 ,  A61K9/72 ,  A61K31/136 ,  A61K31/337 ,  A61K31/365 ,  A61K31/366 ,  A61K31/381 ,  A61K31/396 ,  A61K31/407 ,  A61K31/4164 ,  A61K31/4196 ,  A61K31/42 ,  A61K31/4418 ,  A61K31/47 ,  A61K31/472 ,  A61K31/473 ,  A61K31/4741 ,  A61K31/4745 ,  A61K31/505 ,  A61K31/519 ,  A61K31/53 ,  A61K31/569 ,  A61K31/704 ,  A61K35/74 ,  A61K38/20 ,  A61P13/08 ,  A61P35/00 ,  G01N33/53 ,  G01N33/574

CPC分类号： C12Q1/686 ,  A61K31/00 ,  A61K39/00 ,  A61K39/0011 ,  A61K45/06 ,  A61K2039/6056 ,  A61K2300/00 ,  C12Q1/6853 ,  C12Q2521/107 ,  C12Q2539/103 ,  C12Q2545/114

摘要： 本明細書の開示は、前立腺がんに関連する生体分子及びバイオマーカーを検出するための、組成物ならびに方法である。本明細書の開示は、去勢抵抗性前立腺がんに関連する生体分子及びバイオマーカーを検出するための、組成物ならびに方法であって、ここでそのような生体分子及びバイオマーカーが、前立腺がん患者に対して効果的な治療計画を開発するために使用できる、アンドロゲン受容体スプライス変異体を含む。本明細書の開示は、エンザルタミド及びアビラテロンなどの薬剤に対する治療耐性を評価するための、アンドロゲン受容体スプライス変異体と関連する生体分子及びバイオマーカーの使用方法である。【選択図】図1A

公开(公告)号：JP2007028923A

公开(公告)日：2007-02-08

申请号：JP2005212960

申请日：2005-07-22

申请人： Kaken Geneqs:Kk ,  Post Genome Institute Co Ltd ,  Univ Of Tokyo ,  国立大学法人 東京大学 ,  株式会社カケンジェネックス ,  株式会社ポストゲノム研究所

发明人： HASHIMOTO SHINICHI ,  MATSUSHIMA TSUNAHARU ,  AMETANI AKIO ,  SAMEJIMA YUKIE ,  SHIMIZU KAYO

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12Q1/68 ,  G06F19/00 ,  G06F19/18 ,  G06F19/20

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2539/103 ,  C12Q2525/143

摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for producing a single strand gene tag group reflective of a kind and a ratio of quantity of a base sequence group at the mRNA 5' terminal extracted from a eukaryotic cell, to provide a method for measuring an expression level of a gene in the eukaryotic cell including a process for hybridizing a solid phase on which a DNA or a RNA containing a transcription starting site is immobilized with the single strand gene tag group, and to provide a method for preparing a gene expression profile by integrating obtained information on gene expression. SOLUTION: This single strand gene tag group reflective of the kind and the ratio of the quantity of the base sequence at the mRNA 5' terminal is produced by combining a method disclosed in a 5'SAGE method with a procedure for forming a double-stranded DNA into a single strand. Thus, it is found that the single strand gene tag group is effective for recognizing expression of a gene which targets an expression starting site, as a result of conducting hybridization with a DNA chip by using the tag group as a sample. Further, utilization of the single strand gene tag group makes it possible to conduct comprehensive expression analysis of a gene which targets various transcription starting sites. COPYRIGHT: (C)2007,JPO&INPIT

摘要翻译： 待解决的问题：提供一种反映从真核细胞提取的mRNA 5'末端的碱基序列组的种类和量的比例的单链基因标签组的制备方法，以提供一种方法 用于测量真核细胞中基因的表达水平，包括将含有转录起始位点的DNA或RNA固定在其上的固相与单链基因标签基团杂交的方法，以及提供制备 通过整合获得的基因表达信息来获得基因表达谱。 解决方案：通过将5'SAGE方法中公开的方法与形成一种或多种mRNA的方法相结合的方法来产生反映mRNA 5'末端的碱基序列的种类和量的比例的单链基因标签组 双链DNA变为单链。 因此，作为通过使用标签组作为样品与DNA芯片进行杂交的结果，发现单链基因标签组对于识别靶向表达起始位点的基因的表达是有效的。 此外，单链基因标签组的利用使得可以进行靶向各种转录起始位点的基因的全面表达分析。 版权所有（C）2007，JPO＆INPIT

公开(公告)号：JP2010162029A

公开(公告)日：2010-07-29

申请号：JP2010033200

申请日：2010-02-18

申请人： Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health & Human Services ,  Vysis Inc ,  ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ アズ リプレゼンティッド バイ ザ シークレタリー デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ ,  バイシス・インコーポレーテツド

发明人： KALLIONIEMI OLLI-P ,  MULLER UWE RICHARD ,  SAUTER GIUDO ,  KONONEN JUHA ,  BARLUND MAARIT

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12Q1/68 ,  B01L3/00 ,  C12M1/00 ,  G01N1/08 ,  G01N1/28 ,  G01N1/31 ,  G01N1/36 ,  G01N33/50 ,  G01N33/543 ,  G02B21/34

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00702 ,  B01J2219/00743 ,  B01L3/5085 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/156 ,  G01N1/08 ,  G01N1/2813 ,  G01N1/312 ,  G01N33/5005 ,  G01N33/54306 ,  G01N2001/282 ,  G01N2001/288 ,  G01N2001/368 ,  G02B21/34 ,  C12Q2543/10 ,  C12Q2539/103 ,  C12Q2537/157 ,  C12Q2565/501

摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for rapid molecular profiling of tissue or other cellular specimens by placing a donor specimen in an assigned location in a recipient array, providing copies of the array, and performing a biological analysis different in each copy. SOLUTION: There are provided a method for rapidly and accurately detecting with high resolution the change of the copy number of the gene applicable as a maker of various genetic disorders such as cancer and trisomy by combining two arrays of much different type, a method of detecting specific "target" region (nucleic acid sequence) on a genome, corresponding to a specific genetic disorder, and a method for screening and/or diagnosing specific genetic disorders by using a probe. A composition interacting with genomic target region to treat the genetic disorders and a method for treating genetic disorders by using the composition are also provided. COPYRIGHT: (C)2010,JPO&INPIT

摘要翻译： 要解决的问题：提供一种通过将供体样本放置在受体阵列中的指定位置来快速分子组织或其它细胞标本的方法，提供阵列的拷贝，并进行每个不同的生物分析 复制。 解决方案：提供一种方法，通过组合两种不同类型的阵列，以高分辨率快速和准确地检测可应用于各种遗传疾病如癌症和三体性的制造者的基因的拷贝数的变化， 检测对应于特定遗传病症的基因组上的特异性“靶”区域（核酸序列）的方法，以及通过使用探针筛选和/或诊断特定遗传病症的方法。 还提供了与基因组靶标区域相互作用以治疗遗传疾病的组合物和通过使用该组合物治疗遗传疾病的方法。 版权所有（C）2010，JPO＆INPIT

公开(公告)号：JP2007528193A

公开(公告)日：2007-10-11

申请号：JP2004571572

申请日：2003-05-09

申请人： 岩手県

发明人： ペーター ヴィンター ,  ギュンター カール ,  デトレフ クリューガー ,  ステファニー ライヒ ,  良平 寺内 ,  英生 松村

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2539/103 ,  C12Q2525/204 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2545/114

摘要： 【課題】ESTデータベースが存在しないような生物についても、正確で迅速な定量的遺伝子発現解析を可能にする。
【解決手段】発現遺伝子のcDNAから、25個を超えるヌクレオチドを含み、前記発現遺伝子を同定しうるタグを単離するためのIII型制限酵素の使用であって、前記タグの3'末端が前記III型制限酵素の切断部位によって規定され、前記タグの5'末端が前記発現遺伝子のcDNAの3'末端に最も近い他の制限酵素の切断部位によって規定されることを特徴とする使用。
【選択図】図１