公开(公告)号：US20100173322A1

公开(公告)日：2010-07-08

申请号：US12074876

申请日：2008-03-06

申请人： Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Albrecht Moritz ,  Kimberly Lee ,  Erik Spek ,  Charles Farnsworth ,  Francesco Boccalatte

发明人： Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Albrecht Moritz ,  Kimberly Lee ,  Erik Spek ,  Charles Farnsworth ,  Francesco Boccalatte

IPC分类号： G01N33/53 ,  C07K16/18 ,  G01N33/566

CPC分类号： C07K16/3061 ,  C07K2317/34 ,  G01N33/6842 ,  G01N33/6848

摘要： The invention discloses nearly 219 novel phosphorylation sites identified in signal transduction proteins and pathways underlying Anaplastic Large Cell Lymphoma (ALCL) involving the NPM-ALK translocation/fusion, and provides phosphorylation-site specific antibodies and heavy-isotope labeled peptides (AQUA peptides) for the selective detection and quantification of these phosphorylated sites/proteins, as well as methods of using the reagents for such purpose.

摘要翻译： 本发明公开了在信号转导蛋白中鉴定的近219个新的磷酸化位点和涉及NPM-ALK易位/融合的间变性大细胞淋巴瘤（ALCL）的途径，并且提供磷酸化位点特异性抗体和重同位素标记肽（AQUA肽），用于 这些磷酸化位点/蛋白质的选择性检测和定量，以及用于这些目的的试剂的方法。

公开(公告)号：US20070148711A1

公开(公告)日：2007-06-28

申请号：US11174051

申请日：2005-07-01

申请人： Klarisa Rikova ,  Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Katherine Crosby ,  Qingfu Zeng ,  Kimberly Lee

发明人： Klarisa Rikova ,  Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Katherine Crosby ,  Qingfu Zeng ,  Kimberly Lee

IPC分类号： G01N33/574 ,  A61K31/506

CPC分类号： A61K31/506 ,  G01N33/57423 ,  G01N33/6893 ,  G01N2333/71

摘要： The invention discloses a previously unidentified subset of mammalian non-small cell lung carcinomas (NSCLC) in which platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGFRα) is expressed and is driving the disease, and provides methods for identifying a mammalian NSCLC tumor that belongs to a subset of NSCLC tumors in which PDGFRα is expressed, and for identifying a NSCLC tumor that is likely to respond to a PDGFRα-inhibiting therapeutic. The invention also provides methods for inhibiting the progression of a mammalian NSCLC tumor in which PDGFRα is expressed, and for determining whether a compound inhibits the progression of a PDGFRα-expressing mammalian NSCLC tumor.

摘要翻译： 本发明公开了一种以前未确定的哺乳动物非小细胞肺癌（NSCLC）的子集，其中血小板衍生生长因子受体α（PDGFRalpha）被表达并正在驱动该疾病，并且提供了鉴定属于哺乳动物的NSCLC肿瘤的方法 其中PDGFRα被表达的NSCLC肿瘤的子集，并用于鉴定可能对PDGFRα抑制性治疗反应的NSCLC肿瘤。 本发明还提供抑制其中表达PDGFRα的哺乳动物NSCLC肿瘤进展的方法，以及用于确定化合物是否抑制表达PDGFRα的哺乳动物NSCLC肿瘤的进展的方法。

公开(公告)号：US07932044B2

公开(公告)日：2011-04-26

申请号：US11174051

申请日：2005-07-01

申请人： Klarisa Rikova ,  Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Katherine Crosby ,  Qingfu Zeng ,  Kimberly Lee

发明人： Klarisa Rikova ,  Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Katherine Crosby ,  Qingfu Zeng ,  Kimberly Lee

IPC分类号： G01N33/53 ,  G01N33/574 ,  C12Q1/68

CPC分类号： A61K31/506 ,  G01N33/57423 ,  G01N33/6893 ,  G01N2333/71

摘要： The invention discloses a previously unidentified subset of mammalian non-small cell lung carcinomas (NSCLC) in which platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGFRα) is expressed and is driving the disease, and provides methods for identifying a mammalian NSCLC tumor that belongs to a subset of NSCLC tumors in which PDGFRα is expressed, and for identifying a NSCLC tumor that is likely to respond to a PDGFRα-inhibiting therapeutic. The invention also provides methods for inhibiting the progression of a mammalian NSCLC tumor in which PDGFRα is expressed, and for determining whether a compound inhibits the progression of a PDGFRα-expressing mammalian NSCLC tumor.

摘要翻译： 本发明公开了一种以前未确认的哺乳动物非小细胞肺癌（NSCLC）的亚群，其中血小板衍生生长因子受体α（PDGFRα）被表达并正在驱动该疾病，并且提供了鉴定哺乳动物NSCLC肿瘤属于 其中表达PDGFRα的NSCLC肿瘤的子集，以及用于鉴定可能对PDGFRα抑制性治疗反应的NSCLC肿瘤。 本发明还提供抑制其中表达PDGFRα的哺乳动物NSCLC肿瘤进展的方法，以及用于确定化合物是否抑制表达PDGFRα的哺乳动物NSCLC肿瘤进展的方法。

公开(公告)号：US20110195447A1

公开(公告)日：2011-08-11

申请号：US12982490

申请日：2010-12-30

申请人： Klarisa Rikova ,  Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Katherine Crosby ,  Qingfu Zeng ,  Kimberly Lee

发明人： Klarisa Rikova ,  Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Katherine Crosby ,  Qingfu Zeng ,  Kimberly Lee

IPC分类号： C12Q1/18

CPC分类号： A61K31/506 ,  G01N33/57423 ,  G01N33/6893 ,  G01N2333/71

摘要： The invention discloses a previously unidentified subset of mammalian non-small cell lung carcinomas (NSCLC) in which platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGFRα) is expressed and is driving the disease, and provides methods for identifying a mammalian NSCLC tumor that belongs to a subset of NSCLC tumors in which PDGFRα is expressed, and for identifying a NSCLC tumor that is likely to respond to a PDGFRα-inhibiting therapeutic. The invention also provides methods for inhibiting the progression of a mammalian NSCLC tumor in which PDGFRα is expressed, and for determining whether a compound inhibits the progression of a PDGFRα-expressing mammalian NSCLC tumor.

摘要翻译： 本发明公开了一种以前未确认的哺乳动物非小细胞肺癌（NSCLC）的亚群，其中血小板衍生生长因子受体α（PDGFRα）被表达并正在驱动该疾病，并且提供了鉴定哺乳动物NSCLC肿瘤属于 其中表达PDGFRα的NSCLC肿瘤的子集，以及用于鉴定可能对PDGFRα抑制性治疗反应的NSCLC肿瘤。 本发明还提供抑制其中表达PDGFRα的哺乳动物NSCLC肿瘤进展的方法，以及用于确定化合物是否抑制表达PDGFRα的哺乳动物NSCLC肿瘤进展的方法。

公开(公告)号：US20110059463A1

公开(公告)日：2011-03-10

申请号：US12832974

申请日：2010-07-08

申请人： Albrecht Moritz ,  Jing Zhou ,  Anthony Possemato ,  Matthew Stokes ,  Ailan Guo ,  Charles Farnsworth ,  Klarisa Rikova ,  Jian Yu

发明人： Albrecht Moritz ,  Jing Zhou ,  Anthony Possemato ,  Matthew Stokes ,  Ailan Guo ,  Charles Farnsworth ,  Klarisa Rikova ,  Jian Yu

IPC分类号： G01N33/566 ,  C07K16/18

CPC分类号： G01N33/6854 ,  C07K16/44 ,  G01N2440/14

摘要： The invention discloses 726 novel phosphorylation sites identified in carcinoma and leukemia, peptides (including AQUA peptides) comprising a phosphorylation site of the invention, antibodies that specifically bind to a novel phosphorylation site of the invention, and diagnostic and therapeutic uses of the above.

摘要翻译： 本发明公开了在癌和白血病中鉴定的726个新的磷酸化位点，包含本发明的磷酸化位点的肽（包括AQUA肽），特异性结合本发明的新的磷酸化位点的抗体，以及上述的诊断和治疗用途。

公开(公告)号：US20110045603A1

公开(公告)日：2011-02-24

申请号：US12763886

申请日：2010-04-20

申请人： Ailan Guo ,  Albrecht Moritz ,  Anthony Possemato ,  Ting-Lei Gu ,  Jian Yu ,  Charles Lawrence Farnsworth ,  Corinne Michaud ,  Hong Ren ,  Jessica Ann Cherry ,  Jing Zhou ,  Valerie Lee Goss ,  Erik Spek ,  Yu Li ,  Meghan Ann Tucker ,  John Edward Rush, II ,  Matthew Stokes ,  Klarisa Rikova

发明人： Ailan Guo ,  Albrecht Moritz ,  Anthony Possemato ,  Ting-Lei Gu ,  Jian Yu ,  Charles Lawrence Farnsworth ,  Corinne Michaud ,  Hong Ren ,  Jessica Ann Cherry ,  Jing Zhou ,  Valerie Lee Goss ,  Erik Spek ,  Yu Li ,  Meghan Ann Tucker ,  John Edward Rush, II ,  Matthew Stokes ,  Klarisa Rikova

IPC分类号： G01N33/53 ,  C07K16/18

CPC分类号： C07K16/18 ,  C07K14/47 ,  C07K16/44 ,  G01N33/6842

摘要： The invention discloses 990 novel phosphorylation sites identified in carcinoma and leukemia, peptides (including AQUA peptides) comprising a phosphorylation site of the invention, antibodies specifically bind to a novel phosphorylation site of the invention, and diagnostic and therapeutic uses of the above.

摘要翻译： 本发明公开了在癌和白血病中鉴定的990个新的磷酸化位点，包含本发明的磷酸化位点的肽（包括AQUA肽），特异性结合本发明的新的磷酸化位点的抗体，以及上述的诊断和治疗用途。

公开(公告)号：US08466160B2

公开(公告)日：2013-06-18

申请号：US12982490

申请日：2010-12-30

申请人： Klarisa Rikova ,  Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Katherine Eleanor Crosby ,  Qingfu Zeng ,  Kimberly A Lee

发明人： Klarisa Rikova ,  Roberto Polakiewicz ,  Ailan Guo ,  Katherine Eleanor Crosby ,  Qingfu Zeng ,  Kimberly A Lee

IPC分类号： A01N43/54 ,  G01N33/574 ,  C12Q1/68

CPC分类号： A61K31/506 ,  G01N33/57423 ,  G01N33/6893 ,  G01N2333/71

摘要： The invention discloses a previously unidentified subset of mammalian non-small cell lung carcinomas (NSCLC) in which platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGFRα) is expressed and is driving the disease, and provides methods for identifying a mammalian NSCLC tumor that belongs to a subset of NSCLC tumors in which PDGFRα is expressed, and for identifying a NSCLC tumor that is likely to respond to a PDGFRα-inhibiting therapeutic. The invention also provides methods for inhibiting the progression of a mammalian NSCLC tumor in which PDGFRα is expressed, and for determining whether a compound inhibits the progression of a PDGFRα-expressing mammalian NSCLC tumor.

摘要翻译： 本发明公开了一种以前未确定的哺乳动物非小细胞肺癌（NSCLC）的子集，其中血小板衍生生长因子受体α（PDGFRalpha）被表达并正在驱动该疾病，并且提供了鉴定属于哺乳动物的NSCLC肿瘤的方法 其中PDGFRα被表达的NSCLC肿瘤的子集，并用于鉴定可能对PDGFRα抑制性治疗反应的NSCLC肿瘤。 本发明还提供抑制其中表达PDGFRα的哺乳动物NSCLC肿瘤进展的方法，以及用于确定化合物是否抑制表达PDGFRα的哺乳动物NSCLC肿瘤的进展的方法。

公开(公告)号：US20090203034A1

公开(公告)日：2009-08-13

申请号：US12227318

申请日：2007-05-11

申请人： Ailan Guo ,  Roberto Polakiewicz ,  Kimberly Lee

发明人： Ailan Guo ,  Roberto Polakiewicz ,  Kimberly Lee

IPC分类号： G01N33/53 ,  C12Q1/48 ,  G01N33/536 ,  C07K16/18 ,  C07K14/47 ,  C07K7/06 ,  C07K7/08 ,  C12N5/16

CPC分类号： G01N33/6848 ,  C07K16/44 ,  G01N33/6842 ,  G01N33/6872 ,  G01N2800/2871

摘要： The invention discloses 99 novel phosphorylation sites identified in signal transduction proteins and pathways underlying human Brain Ischemia, and provides phosphorylation-site specific antibodies and heavy-isotope labeled peptides (AQUA peptides) for the selective detection and quantification of these phosphorylated sites/proteins, as well as methods of using the reagents for such purpose. Among the phosphorylation sites identified are sites occurring in the following protein types: protein kinases, adaptor/scaffold proteins, adhesion proteins, G proteins/GTPase/Guanine nucleotide exchange factors, Calcium binding proteins, cytoskeletal proteins, Channel proteins, Chaperone proteins, Helicases, Motor proteins, Translation proteins, RNA binding proteins, Ubiquitin conjugating system proteins, vesicle proteins and Receptor proteins.

摘要翻译： 本发明公开了在信号转导蛋白中识别的99个新的磷酸化位点和人类脑缺血的基因，并提供磷酸化位点特异性抗体和重同位素标记肽（AQUA肽），用于选择性检测和定量这些磷酸化位点/蛋白质，如 以及使用试剂用于此目的的方法。 鉴定的磷酸化位点之间是以下蛋白质类型中发生的位点：蛋白激酶，衔接/支架蛋白，粘附蛋白，G蛋白/ GTP酶/鸟嘌呤核苷酸交换因子，钙结合蛋白，细胞骨架蛋白，通道蛋白，伴侣蛋白，Helicases， 运动蛋白，翻译蛋白，RNA结合蛋白，泛素缀合系统蛋白，囊泡蛋白和受体蛋白。

公开(公告)号：US20090298093A1

公开(公告)日：2009-12-03

申请号：US12226800

申请日：2007-04-27

申请人： Roberto Polakiewicz ,  Kimberly Lee ,  Ailan Guo ,  Matthew Stokes

发明人： Roberto Polakiewicz ,  Kimberly Lee ,  Ailan Guo ,  Matthew Stokes

IPC分类号： G01N33/573 ,  C12Q1/48 ,  C07K16/40

CPC分类号： C07K16/44 ,  C07B59/008

摘要： The invention discloses nearly 300 novel phosphorylation sites identified in signal transduction proteins and pathways underlying human ATM/ATR kinase signaling pathways, and provides phosphorylation-site specific antibodies and heavy-isotope labeled peptides (AQUA peptides) for the selective detection, profiling and quantification of these phosphorylated sites/proteins, as well as methods of using the reagents for such purpose. Among the phosphorylation sites identified are sites occurring in the following protein types: DNA repair proteins, Adaptor/Scaffold proteins, Cell cycle regulation proteins, G Protein/GTPase Activating/Guanine Nucleotide Exchange Factor proteins, DNA binding proteins, DNA replication proteins, Kinases, Disease associated proteins proteins, Methyltransferase, Ubiquitin conjugating proteins, Proteases, Phosphatases, and Transcription proteins.

摘要翻译： 本发明公开了在信号转导蛋白中识别的近300个新的磷酸化位点和人类ATM / ATR激酶信号通路下的途径，并提供磷酸化位点特异性抗体和重同位素标记肽（AQUA肽）用于选择性检测，分析和定量 这些磷酸化位点/蛋白质，以及使用试剂用于此目的的方法。 鉴定的磷酸化位点是发生在以下蛋白质类型中的位点：DNA修复蛋白，适配器/支架蛋白，细胞周期调节蛋白，G蛋白/ GTP酶激活/鸟嘌呤核苷酸交换因子蛋白，DNA结合蛋白，DNA复制蛋白，激酶， 疾病相关蛋白质蛋白，甲基转移酶，泛素缀合蛋白，蛋白酶，磷酸酶和转录蛋白。

公开(公告)号：US20090081659A1

公开(公告)日：2009-03-26

申请号：US12075065

申请日：2008-03-07

申请人： Peter Hornbeck ,  Ailan Guo ,  Albrecht Moritz ,  John Rush ,  Charles Farnsworth ,  Matthew Stokes ,  Anthony Passemato

发明人： Peter Hornbeck ,  Ailan Guo ,  Albrecht Moritz ,  John Rush ,  Charles Farnsworth ,  Matthew Stokes ,  Anthony Passemato

IPC分类号： G01N33/574 ,  C07K16/18 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C07K16/18 ,  C07K16/22 ,  C07K16/30 ,  C07K16/40 ,  C07K2317/34

摘要： The invention discloses 364 novel phosphorylation sites identified in carcinoma, peptides (including AQUA peptides) comprising a phosphorylation site of the invention, antibodies specifically bind to a novel phosphorylation site of the invention, and diagnostic and therapeutic uses of the above.

摘要翻译： 本发明公开了在癌中鉴定的364个新的磷酸化位点，包含本发明的磷酸化位点的肽（包括AQUA肽），特异性结合本发明的新的磷酸化位点的抗体，以及上述的诊断和治疗用途。