公开(公告)号：US20100183651A1

公开(公告)日：2010-07-22

申请号：US12593962

申请日：2008-03-26

申请人： Adam C. Finnefrock ,  Danilo R. Casimiro ,  Jon H. Condra ,  John W. Shiver ,  Andrew J. Bett

发明人： Adam C. Finnefrock ,  Danilo R. Casimiro ,  Jon H. Condra ,  John W. Shiver ,  Andrew J. Bett

IPC分类号： A61K39/21 ,  A61K39/00 ,  C12N7/01 ,  C12N5/00 ,  C12N15/63 ,  C07K7/06 ,  C07K7/08 ,  C07K14/005 ,  C07H21/04

CPC分类号： C07K14/005 ,  A61K39/00 ,  A61K39/12 ,  A61K39/21 ,  A61K2039/5256 ,  A61K2039/53 ,  A61K2039/54 ,  A61K2039/545 ,  A61K2039/57 ,  C07K16/1045 ,  C12N2710/10343 ,  C12N2740/16222 ,  C12N2740/16234 ,  C12N2740/16322 ,  C12N2740/16334 ,  G16B30/00

摘要： A novel method for generating vaccine sequences is disclosed herein that preserves contiguous epitope length stretches of amino acids or nucleotides from an input pool of sequences. The method generates continuous, stepwise epitope consensus that together provides for a single globally optimized sequence. The end sequences are designed to maximize overlap between any potential epitope length sequence extract from a natural antigen sequence. The disclosed method, thus, allows one to maximize the number of potential natural epitopes that are mimicked in a resultant vaccine sequence. Various representative HIV vaccine sequences have been generated and are disclosed herein.

摘要翻译： 本文公开了一种用于产生疫苗序列的新方法，其从输入的序列库中保留氨基酸或核苷酸的连续表位长度的延伸。 该方法产生连续的逐步表位一致性，共同提供单个全局优化的序列。 设计末端序列以使来自天然抗原序列的任何潜在表位长度序列提取物之间的重叠最大化。 因此，所公开的方法允许最大化在所得疫苗序列中模拟的潜在天然表位的数量。 已经产生了各种代表性的HIV疫苗序列，并在此公开。