公开(公告)号：US20090125247A1

公开(公告)日：2009-05-14

申请号：US12192825

申请日：2008-08-15

申请人： JOFFRE BAKER ,  Robert Gray ,  Steven Shak ,  Joseph Sparano ,  Carl Yoshizawa

发明人： JOFFRE BAKER ,  Robert Gray ,  Steven Shak ,  Joseph Sparano ,  Carl Yoshizawa

IPC分类号： G01N33/48 ,  C12Q1/68 ,  G06F19/00

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/156

摘要： The present invention relates to genes, the expression levels of which are correlated with likelihood of breast cancer recurrence in patients after tumor resection and chemotherapy.

摘要翻译： 本发明涉及在肿瘤切除和化疗后患者的乳腺癌复发的可能性与其表达水平相关的基因。

公开(公告)号：US20050064455A1

公开(公告)日：2005-03-24

申请号：US10852797

申请日：2004-05-24

申请人： Joffre Baker ,  Kathy Miller ,  Steven Shak ,  George Sledge ,  Sharon Soule

发明人： Joffre Baker ,  Kathy Miller ,  Steven Shak ,  George Sledge ,  Sharon Soule

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/158

摘要： The invention provides sets of genes the expression of which predicts whether cancer patients are likely to have a beneficial treatment response to chemotherapy.

摘要翻译： 本发明提供了一组基因，其表达预测癌症患者是否可能对化学疗法有有益的治疗反应。

公开(公告)号：US20080176229A1

公开(公告)日：2008-07-24

申请号：US11755697

申请日：2007-05-30

申请人： David Agus ,  Steven Shak ,  Maureen Cronin ,  Joffre Baker

发明人： David Agus ,  Steven Shak ,  Maureen Cronin ,  Joffre Baker

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/574 ,  C40B40/08 ,  C12P19/34

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention concerns prognostic markers associated with cancer. In particular, the invention concerns prognostic methods based on the molecular characterization of gene expression in paraffin-embedded, fixed samples of cancer tissue, which allow a physician to predict whether a patient is likely to respond well to treatment with an EGFR inhibitor.

摘要翻译： 本发明涉及与癌症相关的预后标志物。 特别地，本发明涉及基于石蜡包埋的癌症组织固定样品中基因表达的分子表征的预后方法，其允许医师预测患者是否可能对EGFR抑制剂治疗反应良好。

公开(公告)号：US20050164218A1

公开(公告)日：2005-07-28

申请号：US10857715

申请日：2004-05-28

申请人： David Agus ,  Joffre Baker ,  Ron Natale ,  Steven Shak

发明人： David Agus ,  Joffre Baker ,  Ron Natale ,  Steven Shak

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention concerns prognostic markers associated with cancer. In particular, the invention concerns prognostic methods based on the molecular characterization of gene expression in paraffin-embedded, fixed samples of cancer tissue, which allow a physician to predict whether a patient is likely to respond well to treatment with an EGFR inhibitor.

摘要翻译： 本发明涉及与癌症相关的预后标志物。 特别地，本发明涉及基于石蜡包埋的癌症组织固定样品中基因表达的分子表征的预后方法，其允许医师预测患者是否可能对EGFR抑制剂治疗反应良好。

公开(公告)号：US20050048542A1

公开(公告)日：2005-03-03

申请号：US10883303

申请日：2004-06-30

申请人： Joffre Baker ,  John Bryant ,  Soonmyung Paik ,  Steven Shak

发明人： Joffre Baker ,  John Bryant ,  Soonmyung Paik ,  Steven Shak

IPC分类号： G01N33/48 ,  G01N33/50 ,  G01N33/574 ,  G06F19/20 ,  G06F19/24 ,  C12Q1/68 ,  G06F19/00

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/158 ,  G01N33/57415 ,  G01N33/57484 ,  G01N33/57492 ,  G06F19/20 ,  G06F19/24

摘要： The present invention provides a noninvasive, quantitative test for prognosis determination in cancer patients. The test relies on measurements of the tumor levels of certain messenger RNAs (mRNAs). These mRNA levels are inserted into a polynomial formula (algorithm) that yields a numerical recurrence score, which indicates recurrence risk.

摘要翻译： 本发明提供了癌症患者预后测定的无创定量试验。 测试依赖于某些信使RNA（mRNA）的肿瘤水平的测量。 将这些mRNA水平插入到产生数字复发评分的多项式公式（算法）中，其表示复发风险。

公开(公告)号：US20060286565A1

公开(公告)日：2006-12-21

申请号：US11345611

申请日：2006-01-31

申请人： Joffre Baker ,  John Bryant ,  Soonmyung Paik ,  Steven Shak

发明人： Joffre Baker ,  John Bryant ,  Soonmyung Paik ,  Steven Shak

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H21/04 ,  C12P19/34 ,  C12M1/34

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention provides gene sets the expression of which is important in the diagnosis and/or prognosis of cancer, in particular of breast cancer.

公开(公告)号：US20060166231A1

公开(公告)日：2006-07-27

申请号：US11267807

申请日：2005-11-04

申请人： Joffre Baker ,  John Bryant ,  Soonmyung Paik ,  Steven Shak

发明人： Joffre Baker ,  John Bryant ,  Soonmyung Paik ,  Steven Shak

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/574 ,  G06F19/00

CPC分类号： G01N33/57415 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/118 ,  G06F19/18 ,  G06F19/20

摘要： The present invention relates to quantitative molecular indicators that can guide clinical decisions in breast cancer, such as estrogen receptor (ESR1)-positive, lymph node-negative breast cancer. In particular, the invention concerns certain genes, the varied expression of which indicates the likelihood of recurrence of surgically resected breast cancer in patients who are not treated with a therapeutic agent in the adjuvant setting. In addition, the invention concerns the use of quantitative measurement of the expression of certain genes, including the ESR1 gene, that measure as a continuous variable, to determine (a) the likelihood of a beneficial response to the anti-estrogen therapeutic agent, such as tamoxifen; and (b) the potential magnitude of beneficial response to chemotherapy.

公开(公告)号：US20050260646A1

公开(公告)日：2005-11-24

申请号：US11102228

申请日：2005-04-07

申请人： Joffre Baker ,  Steven Shak ,  Luca Gianni

发明人： Joffre Baker ,  Steven Shak ,  Luca Gianni

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  Y10S435/96

摘要： The present invention provides sets of genes the expression of which is important in the prognosis of cancer. In particular, the invention provides gene expression information useful for predicting whether cancer patients are likely to have a beneficial treatment response to chemotherapy.FHIT; MTA1; ErbB4; FUS; BBC3; IGF1R; CD9; TP53BP1; MUC1; IGFBP5; rhoC; RALBP1; STAT3; ERK1; SGCB; DHPS; MGMT; CRIP2; ErbB3; RAP1GDS1; CCND1; PRKCD; Hepsin; AK055699; ZNF38; SEMA3F; COL1A1; BAG1; AKT1; COL1A2; Wnt.5a; PTPD1; RAB6C; GSTM1, BCL2, ESR1; or the corresponding expression product, is determined, said report includes a prediction that said subject has a decreased likelihood of response to chemotherapy.

摘要翻译： 本发明提供了一组基因，其表达在癌症的预后中是重要的。 特别地，本发明提供了可用于预测癌症患者是否可能对化学疗法有有益治疗反应的基因表达信息。 MTA1; ErbB4; FUS; BBC3; IGF1R; CD9; TP53BP1; MUC1; IGFBP5; rhoC; RALBP1; STAT3; ERK1; SGCB; DHPS; MGMT; CRIP2; ErbB3; RAP1GDS1; CCND1; PRKCD; 肝素 AK055699; ZNF38; SEMA3F; COL1A1; BAG1; AKT1; COL1A2; Wnt.5a; PTPD1; RAB6C; GSTM1，BCL2，ESR1; 或相应的表达产物，所述报告包括所述受试者具有降低的化疗反应可能性的预测。

公开(公告)号：US20050079518A1

公开(公告)日：2005-04-14

申请号：US10872063

申请日：2004-06-17

申请人： Joffre Baker ,  John Bryant ,  Soonmyung Paik ,  Steven Shak

发明人： Joffre Baker ,  John Bryant ,  Soonmyung Paik ,  Steven Shak

IPC分类号： A61B20060101 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention provides gene sets the expression of which is important in the diagnosis and/or prognosis of cancer, in particular of breast cancer.

摘要翻译： 本发明提供了基因组，其表达在癌症，特别是乳腺癌的诊断和/或预后中是重要的。

公开(公告)号：US09551034B2

公开(公告)日：2017-01-24

申请号：US12987023

申请日：2011-01-07

申请人： Wayne Cowens ,  Steven Shak ,  Audrey Goddard ,  Dejan Knezevic ,  Joffre Baker ,  Michael C. Kiefer ,  Tara Maddala ,  Frederick L. Baehner

发明人： Wayne Cowens ,  Steven Shak ,  Audrey Goddard ,  Dejan Knezevic ,  Joffre Baker ,  Michael C. Kiefer ,  Tara Maddala ,  Frederick L. Baehner

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/574

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/158 ,  G01N33/57438 ,  G06F19/00 ,  G06F19/10 ,  G06N7/005 ,  G16H50/20

摘要： The present disclosure provides gene and gene sets, the expression of which is important in the classification and/or prognosis of cancer, in particular of renal cell carcinoma.

摘要翻译： 本公开提供了基因和基因组，其表达在癌症，特别是肾细胞癌的分类和/或预后中是重要的。