公开(公告)号：WO2014051220A1

公开(公告)日：2014-04-03

申请号：PCT/KR2013/000496

申请日：2013-01-22

Applicant: 한국기초과학지원연구원

Inventor： 박건욱 ,  유종신 ,  김진영 ,  이주연 ,  이현경 ,  안현주 ,  김재한

IPC: G01N30/72 ,  G01N33/68 ,  C12Q1/34 ,  G06F17/10

CPC classification number: G06F19/16 ,  C12Q1/37 ,  G01N30/86 ,  G01N33/6848 ,  G01N2030/8813 ,  G01N2030/8831 ,  G01N2400/00 ,  G01N2440/38 ,  G01N2560/00 ,  G01N2570/00 ,  H01J49/0027 ,  H01J49/0036 ,  H01J49/004

Abstract: 본 발명은 고분해능 질량분석기로부터 얻은 질량 스펙트럼의 결과를 이용하여 일반 펩티드에 비해 상대적으로 낮은 감도 또는 농도로 존재하는 당펩티드를 효율적이고 정확히 동정 및 정량화하여, 질병 표지자(Biomarker)인 당펩티드를 발견하여 효과적으로 암을 예측, 진단할 수 있는 기술에 유용하게 사용될 수 있다.

Abstract translation: 本发明通过使用从高分辨率质谱仪获得的质谱结果，有效和准确地鉴定和定量与一般肽相比具有相对较低灵敏度或浓度的糖肽，因此可有效地用于能够有效地 通过检测作为生物标志物的糖肽来预测和诊断癌症。

公开(公告)号：WO2013181758A1

公开(公告)日：2013-12-12

申请号：PCT/CA2013/050430

申请日：2013-06-05

Applicant: MCMASTER UNIVERSITY

Inventor： MAGARVEY, Nathan ,  WYATT, Aubrey Bailey Morgan ,  JOHNSTON, Chad William ,  IBRAHIM, Ashraf ,  MA, Bin ,  YANG, Lian

IPC: C40B30/02 ,  C12M1/34 ,  C12Q1/68 ,  C40B20/08 ,  C40B60/12 ,  G01N1/28 ,  G01N33/483 ,  G06F19/00 ,  G06F19/10 ,  G06F19/18 ,  C40B30/08 ,  G01N30/86

CPC classification number: G06F19/703 ,  C40B20/08 ,  C40B30/02 ,  G01N30/7233 ,  G01N30/86 ,  G01N33/6848 ,  G06F19/16 ,  G06F19/18

Abstract: The present application is directed to methods and systems for identifying small molecule compounds in mixtures using a library comprising calculated structures and corresponding calculated mass spectral fragmentation patterns of known and/or hypothetical small molecule compounds that may be in the mixture and screening of a mass spectrum of the mixture using the library to identify matching fragmentation patterns. If a mass spectral fragmentation pattern present in the mass spectrum of the mixture matches a calculated fragmentation pattern of one of the known or hypothetical compounds this confirms the identity of a compound in the mixture as the known or hypothetical compound. The method represents a platform method that can be used for a multitude of purposes related to the screening and identification of compounds in mixtures. Therefore the methods and systems of the present application represent an approach that is uniquely capable of navigating chemical space and providing a understanding of desired families and pharmacophores.

Abstract translation: 本申请涉及使用包含可能在混合物中的已知和/或假设的小分子化合物的计算结构和相应计算的质谱断裂模式的文库来鉴定混合物中的小分子化合物的方法和系统，并且筛选质谱 的混合物使用库来识别匹配的碎片模式。 如果存在于混合物的质谱中的质谱裂解模式匹配已知或假定化合物之一的计算的断裂模式，则证实混合物中化合物的身份为已知或假设化合物。 该方法代表了可用于与混合物中化合物的筛选和鉴定相关的多种目的的平台方法。 因此，本申请的方法和系统代表了唯一能够导航化学空间并提供对期望的家族和药效团的理解的方法。

公开(公告)号：WO2013144790A1

公开(公告)日：2013-10-03

申请号：PCT/IB2013/052242

申请日：2013-03-21

Applicant: KONINKLIJKE PHILIPS N.V.

Inventor： NIJSEN, Tamara Mathea Elisabeth ,  D'ANGELO, Marina

IPC: G01N30/86 ,  G06K9/00 ,  H01J49/00

CPC classification number: G01N30/86 ,  G01N30/8617 ,  G01N30/8634 ,  G06K9/00503 ,  H01J49/0036

Abstract: This invention relates to a system for and a method of filtering at least a part of gas chromatography-mass spectrometry data, the method comprising: providing gas chromatography-mass spectrometry data (301) for a gas mixture comprising data representing one or more gas chromatography elution peaks obtained for at least one sample, and filtering the gas chromatography-mass spectrometry data (301) to reduce the amount of data, wherein the filtering comprises taking into account predetermined data representing one or more elution peaks previously determined to be false positives (305) and/or predetermined data representing one or elution peaks previously determined to be true positives (304). In this way, unreliable elution peaks are removed in an expedient manner reducing the amount of data e.g. used for a later alignment process speeding up the processing time and also improving the data quality. Fig.2

Abstract translation: 本发明涉及一种用于过滤气相色谱 - 质谱数据的至少一部分的系统和方法，所述方法包括：提供用于气体混合物的气相色谱 - 质谱数据（301），其包含表示一种或多种气相色谱 对至少一个样品获得的洗脱峰，并过滤气相色谱 - 质谱数据（301）以减少数据量，其中过滤包括考虑预先确定为假阳性的一个或多个洗脱峰的预定数据（ 305）和/或表示先前确定为真阳性的一个或洗脱峰的预定数据（304）。 以这种方式，以方便的方式去除不可靠的洗脱峰，从而减少数据量。 用于稍后的校准过程，加快了处理时间，并提高了数据质量。 图2

公开(公告)号：WO2012130923A1

公开(公告)日：2012-10-04

申请号：PCT/EP2012/055587

申请日：2012-03-29

Applicant: SIEMENS AKTIENGESELLSCHAFT ,  PROBST, Frank ,  STRAUCH, Piotr

Inventor： PROBST, Frank ,  STRAUCH, Piotr

IPC: G01N30/28 ,  G01N33/00 ,  G01N33/22

CPC classification number: G01N30/86 ,  G01N30/28 ,  G01N30/66 ,  G01N30/8634 ,  G01N33/005 ,  G01N2030/324 ,  G01N2030/342

Abstract: Verfahren zur chromatographischen Analyse eines Wasserstoff enthaltenden Gasgemischs (1), wobei in einem ersten Messdurchgang eine erste Dosis des Gasgemischs (1) mittels Helium als Trägergas (3) durch eine Trenneinrichtung (4) geleitet wird und die Konzentrationen interessierender getrennter Komponenten gemessen werden, wobei mittels eines Wärmeleitfähigkeitsdetektors (13) die Konzentration des Wasserstoffs in dem Gasgemisch (1) gemessen und der dabei erhaltene Messwert bis zu einem oberen Grenzwert im Bereich von 5 % bis 6 % übernommen wird, in einem zweiten Messdurchgang eine zweite Dosis desselben Gasgemischs (1) mittels desselben Trägergases (3) durch die Trenneinrichtung (4) geleitet wird, wobei im Unterschied zu dem ersten Messdurchgang die Dosis verringert, das Gasgemisch (1) volumetrisch verdünnt und/oder die Trägergasgeschwindigkeit verringert ist, und erneut mittels des Wärmeleitfähigkeitsdetektors (13) die Konzentration des Wasserstoffs in dem Gasgemisch (1) gemessen wird, und der aus dem ersten Messdurchgang übernommene Messwert mit dem in dem zweiten Messdurchgang erhaltenen Messwert verifiziert wird.

Abstract translation: 含氢气体混合物（1），其中所述混合物（1）气体的第一剂量通过在第一测量运行一个分离装置（4），和感兴趣的分离的组分的浓度使用氦气作为载气（3）进行的色谱分析的方法进行测定，其特征在于 通过热导检测器（13）氢的气体混合物中的浓度的装置（1）被测量，并且由此获得的测量值是最多为5％至6％的范围内的上限值以上，在第二测量通，相同的气体混合物的第二剂量（1） 用相同的载气（3）通过分离装置（4）通过，其特征在于，相比于第一测量通道减少了剂量稀释气体混合物（1）体积和/或载气速度由热导检测器的装置降低，然后再次（13） 在气体混合物中的氢浓度（1）测定 烯，并从所述第一测量通道获得的测量值被验证与所述第二测量通道测量值获得的产物。

公开(公告)号：WO2012084828A1

公开(公告)日：2012-06-28

申请号：PCT/EP2011/073243

申请日：2011-12-19

Applicant: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG ,  BELOUSOV, Anton ,  DAMS, Thomas ,  GERWAT, Benjamin

Inventor： BELOUSOV, Anton ,  DAMS, Thomas ,  GERWAT, Benjamin

IPC: G01N30/86 ,  G01N30/88 ,  C07K1/16

CPC classification number: G06F19/70 ,  C07K1/22 ,  G01N30/50 ,  G01N30/86 ,  G01N30/8665 ,  G01N30/88

Abstract: Herein is reported a method for determining whether a re-useable chromatography column packing, which is used at least for the second time in a purification step of a purification of a polypeptide, has reduced separation efficacy in said purification step of said purification of said polypeptide, comprising in particular the following steps: a) identifying and determining the experimental data of an inert change of at least one physicochemical parameter of a mobile phase passing through said re-useable chromatography column packing, b) determining the parameters of a function of formula (I) by fitting the experimental data of the inert change of the physicochemical parameter of the at least second use, c) determining the difference between the experimental data of the inert change of the physicochemical parameter of the at least second use and the function of formula (I) with the parameters determined in step b).

Abstract translation: 本文报道了用于确定在纯化多肽的纯化步骤中至少第二次使用的可再利用色谱柱填充是否在所述纯化所述多肽的纯化步骤中具有降低的分离功效的方法 特别地包括以下步骤：a）鉴定和确定通过所述可重复使用的色谱柱填充物的流动相的至少一个物理化学参数的惰性变化的实验数据，b）确定式 （I）通过拟合至少第二次使用的物理化学参数的惰性变化的实验数据，c）确定至少第二次使用的物理化学参数的惰性变化的实验数据与其功能的差异 式（I）与步骤b）中确定的参数。

公开(公告)号：WO2012004855A1

公开(公告)日：2012-01-12

申请号：PCT/JP2010/061442

申请日：2010-07-06

Applicant: 株式会社島津製作所 ,  山口 真一

Inventor： 山口　真一

IPC: G01N27/62

CPC classification number: G06F15/00 ,  G01N30/86 ,  G01N30/8675 ,  G04F13/00 ,  H01J49/0036 ,  H01J49/02

Abstract: 　ＬＣ／ＭＳ、ＧＣ／ＭＳ等で収集した複数の試料に対するデータについて、情報を欠損することなく且つ少ない負荷で２次元テーブルの形式に変換することにより、効率的に多変量解析処理を行えるようにする。複数の試料のＬＣ／ＭＳ測定データを取得し、それぞれ抽出イオンクロマトグラム（ＸＩＣ）を作成したならば（Ｓ１、Ｓ２）、保持時間ずれ修正や波形処理等を行った後に（Ｓ３、Ｓ４）、ＸＩＣ毎に信号強度値を並べた１次元テーブルを作成する。そして１つの試料の複数のＸＩＣの１次元テーブルをm/zの順に連結して長い１次元テーブルを作成し（Ｓ５）、複数の試料の１次元テーブルを他の次元方向に並べることで２次元テーブルを作成する（Ｓ６）。

Abstract translation: 通过LC / MS分析，GC / MS分析或其他分析收集的多个样本的数据被转换为二维表格，而不丢失信息和小负载，从而允许多变量分析过程有效 执行。 获得在多个样品上测量的LC / MS数据，并产生各自提取的离子色谱图（XIC）（步骤S1，S2）。 在执行保持时间偏移校正之后，执行波形处理等（步骤S3，S4），然后为每个XIC创建其中布置信号强度值的一维表。 随后，通过以一个m / z（步骤S5）的顺序链接一个样本的XIC的一维表来创建长的一维表，之后通过将一维 在另一维度方向上的多个样本的表格（步骤S6）。

公开(公告)号：WO2011155984A1

公开(公告)日：2011-12-15

申请号：PCT/US2011/001029

申请日：2011-06-07

Applicant: WATERS TECHNOLOGIES CORPORATION ,  DE CORRAL, Jose

Inventor： DE CORRAL, Jose

IPC: G01R23/165

CPC classification number: H01J49/0036 ,  G01N30/7233 ,  G01N30/86 ,  G01N30/8617 ,  G01N2030/8831 ,  G06F17/00

Abstract: Described are techniques for processing data. Sample analysis is performed generating scans of data. Each scan comprises a set of data elements each associating an ion intensity count with a plurality of dimensions including a retention time dimension and a mass to charge ratio dimension. The scans are analyzed to identify one or more ion peaks. Analyzing includes filtering a first plurality of the scans producing a first plurality of filtered output scans. The filtering including first filtering producing a first filtering output, wherein the first filtering includes executing a plurality of threads in parallel which apply a first filter to the first plurality of scans to produce the first filtering output. Each of the plurality of threads computes at least one filtered output point for at least one corresponding input point included in the plurality of scans. Analyzing includes detecting one or more peaks using the filtered output scans.

Abstract translation: 描述了用于处理数据的技术。 进行样本分析，生成数据扫描。 每个扫描包括一组数据元素，每个数据元素将离子强度计数与包括保留时间维度和质荷比维度的多个维度相关联。 分析扫描以识别一个或多个离子峰。 分析包括过滤产生第一多个经滤波的输出扫描的第一多个扫描。 所述过滤包括产生第一过滤输出的第一过滤，其中所述第一过滤包括并行执行多个线程，其将第一过滤器应用于所述第一多个扫描以产生所述第一过滤输出。 多个线程中的每一个针对包括在多个扫描中的至少一个对应输入点计算至少一个滤波输出点。 分析包括使用过滤的输出扫描检测一个或多个峰。

公开(公告)号：WO2011058883A1

公开(公告)日：2011-05-19

申请号：PCT/JP2010/069147

申请日：2010-10-28

Applicant: 株式会社日立ハイテクノロジーズ ,  吉岡 信二 ,  山下 博教

Inventor： 吉岡　信二 ,  山下　博教

IPC: G01N27/62 ,  G01N30/72 ,  G01N30/86

CPC classification number: G01N30/7233 ,  G01N30/86

Abstract: 　本発明は、液体クロマトグラフィー質量分析装置において、基準試料と比較対象試料のそれぞれのサンプルから得られるマススペクトルデータについて、基準試料と比較対象試料との類似性を容易に認識できるようにすると共に、不要なピークを表示させなくして、個々の分析結果を正確に認識できるようにする。このため、基準試料と比較対象試料のそれぞれのサンプルから得られるマススペクトルデータを、保持時間と質量電荷比を軸としたマップ上に、マススペクトルデータのイオンピーク強度を濃淡で表示する。さらに、指定された強度のピークのみを他と区別して表示させるとともに、そのピークのみを表示させるマップも設ける。

Abstract translation: 公开了一种液相色谱/质谱装置，其中对于分别从参考样品和待比较样品获得的质谱数据，可以容易地识别参考样品和待比较样品之间的相似性，并且在 可以通过不显示外部峰值来准确地识别分离分析结果。 结果，将分别从参考样品和待比较样品获得的质谱数据映射在保留时间和质荷比轴之间，其质谱图数据中的离子峰强度以灰度显示。 此外，指示强度的峰仅与其他峰分开显示，并且还提供仅显示那些峰的图。

公开(公告)号：WO2010149367A1

公开(公告)日：2010-12-29

申请号：PCT/EP2010/003813

申请日：2010-06-22

Applicant: F. HOFFMANN-LA ROCHE AG ,  BELOUSOV, Anton ,  DAMS.Thomas ,  GERWAT, Benjamin

Inventor： BELOUSOV, Anton ,  DAMS.Thomas ,  GERWAT, Benjamin

IPC: G01N30/50 ,  G01N30/86

CPC classification number: G01N30/86 ,  C07K1/16 ,  G01N30/50 ,  G01N30/88

Abstract: Herein is reported a method for determining whether a re-useable chromatography column packing, which is used at least for the second time in a purification step of a purification of a polypeptide, has reduced separation efficacy in said purification step of said purification of said polypeptide. The method comprises the following steps: a) identifying and determining the experimental data of an inert change of at least one physicochemical parameter of a mobile phase passing through said re-useable chromatography column packing, b) determining the parameters of a function of formula I by fitting the experimental data of the inert change of the physicochemical parameter of the at least second use, c) determining the difference between the experimental data of the inert change of the physicochemical parameter of the at least second use and the function of formula I with the parameters determined in step b), d) calculating the difference between the maximum value and the minimum value of the difference determined in step c) and normalizing said difference, e) determining reduced separation efficacy of said re-useable chromatography column packing when the absolute value of the difference calculated in step d) is more than 0.1, wherein the function of formula I is with the amplitude P1, the starting value AO, the mean value m, the standard deviation s, and wherein erf is the error function.

Abstract translation: 本文报道了用于确定在纯化多肽的纯化步骤中至少第二次使用的可再利用色谱柱填充是否在所述纯化所述多肽的纯化步骤中具有降低的分离功效的方法 。 该方法包括以下步骤：a）鉴定和确定通过所述可重复使用的色谱柱填充物的流动相的至少一个物理化学参数的惰性变化的实验数据，b）确定式I的函数的参数 通过拟合至少第二次使用的物理化学参数的惰性变化的实验数据，c）确定至少第二次使用的物理化学参数的惰性变化与式I的功能的实验数据之间的差异， 步骤b）中确定的参数，d）计算在步骤c）中确定的差异的最大值和最小值之间的差异，并且对所述差异进行归一化，e）确定当所述可再利用的色谱柱填充物的分离效率降低时 在步骤d）中计算的差的绝对值大于0.1，其中式I的函数与幅度相关 e P1，起始值AO，平均值m，标准偏差s，其中erf是误差函数。

公开(公告)号：WO2009070871A1

公开(公告)日：2009-06-11

申请号：PCT/CA2008/002083

申请日：2008-11-27

Applicant: MDS ANALYTICAL TECHNOLOGIES, A BUSINESS UNIT OF MDS INC. DOING BUSINESS THROUGH ITS SCIEX DIVISION ,  APPLIED BIOSYSTEMS INC. ,  BONNER, Ron, F. ,  BURTON, Lyle, L. ,  LE BLANC, Yves

Inventor： BONNER, Ron, F. ,  BURTON, Lyle, L. ,  LE BLANC, Yves

IPC: H01J49/26 ,  G01N27/00

CPC classification number: H01J49/004 ,  G01N30/7233 ,  G01N30/86 ,  H01J49/0027 ,  Y10T436/24

Abstract: Systems and methods for analyzing compounds in a sample. In one embodiment, the present technology is directed towards a method of analyzing a sample, comprising: emitting ions from the sample; selecting the emitted ions for a designated ion; fragmenting the designated ions; scanning for a plurality of designated ion fragments; determining a designated fragment chromatographic trace for each designated ion fragment; and generating a combined chromatographic trace corresponding to a non-linear combination of a plurality of designated fragment chromatographic traces.

Abstract translation: 用于分析样品中化合物的系统和方法。 在一个实施例中，本技术涉及分析样品的方法，包括：从样品中发射离子; 选择发射的离子指定的离子; 破碎指定的离子; 扫描多个指定的离子碎片; 确定每个指定离子片段的指定片段色谱痕迹; 以及产生对应于多个指定片段色谱痕迹的非线性组合的组合色谱图。