公开(公告)号：WO2015160848A1

公开(公告)日：2015-10-22

申请号：PCT/US2015/025817

申请日：2015-04-14

申请人： INDUSTRIAL MICROBES, INC.

发明人： HELMAN, Noah ,  CLARKE, Elizabeth ,  GREENFIELD, Derek

IPC分类号： C12N1/00

CPC分类号： C12P7/46 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/0014 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/88 ,  C12N9/90 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01224 ,  C12Y101/02007 ,  C12Y101/03013 ,  C12Y101/99037 ,  C12Y102/01002 ,  C12Y102/01046 ,  C12Y111/01006 ,  C12Y114/13025 ,  C12Y202/01003 ,  C12Y401/01043 ,  C12Y503/01027

摘要： Provided herein are non-naturally occurring microbial organisms comprising a methane-oxidizing metabolic pathway. The invention additionally comprises non-naturally occurring microbial organisms comprising pathways for the production of chemicals. The invention additionally provides methods for using said organisms for the production of chemicals.

摘要翻译： 本文提供了包含甲烷氧化代谢途径的非天然存在的微生物生物。 本发明还包括非天然存在的微生物，其包含用于生产化学品的途径。 本发明另外提供了使用所述生物体来生产化学品的方法。

公开(公告)号：WO2015103002A1

公开(公告)日：2015-07-09

申请号：PCT/US2014/071924

申请日：2014-12-22

申请人： BUTAMAX ADVANCED BIOFUELS LLC

发明人： VAN DYK, Tina K. ,  XUE, Zhixiong ,  YADAV, Narendra S. ,  ZHANG, Hongxiang

IPC分类号： C12N15/81

CPC分类号： C12P7/16 ,  C10L1/02 ,  C10L2200/0469 ,  C10L2290/26 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0071 ,  C12N9/1007 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/1029 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/81 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y114/19001 ,  C12Y114/19006 ,  C12Y201/01079 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y401/01009 ,  C12Y401/01072 ,  Y02E50/10

摘要： Provided herein are recombinant yeast cells comprising an engineered pyruvate utilizing biosynthetic pathway and further comprising a cell membrane with an altered lipid profile. In some embodiments the recombinant yeast cell has an increased tolerance to butanol as compared to a recombinant yeast cell that does not comprise an altered lipid profile. In some embodiments the altered lipid profile comprises an increase in the concentration of cyclopropane fatty acid as compared to a microorganism that lacks the cell membrane with an altered lipid profile. In some embodiments the altered lipid profile comprises an increase in the fatty acid concentration ratio.

摘要翻译： 本文提供了重组酵母细胞，其包含利用生物合成途径的工程丙酮酸，并且还包含具有改变的脂质分布的细胞膜。 在一些实施方案中，与不包含改变的脂质分布的重组酵母细胞相比，重组酵母细胞对丁醇的耐受性增加。 在一些实施方案中，与缺乏具有改变的脂质谱的细胞膜的微生物相比，改变的脂质谱包括环丙烷脂肪酸的浓度增加。 在一些实施方案中，改变的脂质分布包括脂肪酸浓度比的增加。

公开(公告)号：WO2015048243A1

公开(公告)日：2015-04-02

申请号：PCT/US2014/057386

申请日：2014-09-25

申请人： E. I. DU PONT DE NEMOURS AND COMPANY

发明人： YANG, Jianjun

IPC分类号： C12N1/22 ,  C12P7/10

CPC分类号： C12N9/0006 ,  C12N1/22 ,  C12N9/0008 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/1205 ,  C12N9/90 ,  C12N9/92 ,  C12N15/00 ,  C12N15/52 ,  C12N15/74 ,  C12P7/10 ,  Y02E50/16

摘要： Synthetic, derivative promoters for expression of chimeric genes in Zymomonas , Zymobacter , and related bacteria were created. The promoters have a C to T change in the nucleotide at position 90 of the Z . mobilis glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene promoter. Promoters with this change have higher expression as compared to the native promoter from which they are derived and are useful for genetic engineering for expressing coding regions or regulatory RNA to obtain high levels of expressed proteins or regulatory RNAs.

摘要翻译： 创建了在发酵单胞菌，酵母菌属和相关细菌中表达嵌合基因的合成的衍生启动子。 启动子在运动发酵单胞菌甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因启动子的第90位的核苷酸中具有C-T变化。 与其衍生的天然启动子相比，具有该变化的启动子具有更高的表达，并且可用于表达编码区或调节RNA的基因工程以获得高水平的表达蛋白或调节性RNA。

公开(公告)号：WO2015032911A1

公开(公告)日：2015-03-12

申请号：PCT/EP2014/068967

申请日：2014-09-05

申请人： DANMARKS TEKNISKE UNIVERSITET

发明人： ZHU, Jiangfeng ,  JENSEN, Niels, Bjerg ,  CHEN, Xiao ,  FÖRSTER, Jochen ,  BORODINA, Irina

IPC分类号： C12N9/02 ,  C12N9/10 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12P13/22 ,  C12P17/10 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21

CPC分类号： C12P17/10 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0028 ,  C12N9/0071 ,  C12N9/1007 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/1029 ,  C12N9/1085 ,  C12N9/1096 ,  C12N9/1205 ,  C12N9/1294 ,  C12N9/78 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12P13/227 ,  C12Y101/01153 ,  C12Y105/01034 ,  C12Y114/16004 ,  C12Y201/01004 ,  C12Y202/01001 ,  C12Y203/01005 ,  C12Y203/01087 ,  C12Y205/01054 ,  C12Y206/01057 ,  C12Y207/01001 ,  C12Y207/09002 ,  C12Y305/04016 ,  C12Y401/01028 ,  C12Y402/01096 ,  C12Y402/03012

摘要： Recombinant microbial cells and methods for producing 5HTP, melatonin and related compounds using such cells are described. More specifically, the recombinant microbial cell may comprise exogenous genes encoding one or more of an L-tryptophan hydroxylase, a 5- hydroxy-L-tryptophan decarboxylyase, a serotonin acetyltransferase, an acetylserotonin O- methyltransferase; and means for providing tetrahydrobiopterin (THB), and can be further genetically modified to enrich one or more of tryptophan, S-adenosyl-L-methinonine and acetyl coenzyme A. Related sequences and vectors for use in preparing such recombinant microbial cells are also described.

摘要翻译： 描述了重组微生物细胞以及使用这种细胞产生5HTP，褪黑激素和相关化合物的方法。 更具体地，重组微生物细胞可以包含编码一种或多种L-色氨酸羟化酶，5-羟基-L-色氨酸脱羧酶，5-羟色胺乙酰转移酶，乙酰肌醇O-甲基转移酶的外源基因; 和用于提供四氢生物蝶呤（THB）的方法，并且可以进一步进行基因修饰以富集一个或多个色氨酸，S-腺苷-L-亚甲基内酯和乙酰辅酶A.还描述了用于制备这种重组微生物细胞的相关序列和载体 。

公开(公告)号：WO2015021058A2

公开(公告)日：2015-02-12

申请号：PCT/US2014/049805

申请日：2014-08-05

申请人： GREENLIGHT BIOSCIENCES, INC.

发明人： BLAKE, William, Jeremy ,  CUNNINGHAM, Drew, S.

IPC分类号： C12Q1/37

CPC分类号： C12N9/92 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/1029 ,  C12Y202/01001 ,  C12Y203/01008 ,  C12Y503/01009

摘要： Various aspects and embodiments herein relate to recombinant proteins with at least one protease recognition sequence that can be inactivated by a cognate protease and methods of preparing such proteins. In some embodiments, recombinant phosphoglucose isomerase (Pgi) proteins are provided. In other embodiments, recombinant phosphotransacetylase (Pta) proteins are provided. In yet other embodiments, recombinant transketolase A (TktA) proteins are provided.

摘要翻译： 本文的各个方面和实施方案涉及具有至少一种能够被同源蛋白酶灭活的蛋白酶识别序列的重组蛋白质和制备此类蛋白质的方法。 在一些实施方案中，提供了重组磷酸葡萄糖异构酶（Pgi）蛋白。 在其它实施方案中，提供了重组磷酸转乙酰酶（Pta）蛋白。 在其它实施方案中，提供重组转酮醇酶A（TktA）蛋白质。

公开(公告)号：WO2014208970A1

公开(公告)日：2014-12-31

申请号：PCT/KR2014/005555

申请日：2014-06-24

申请人： 백광산업 주식회사

发明人： 최종수 ,  권영덕 ,  김영호 ,  전도연 ,  이지영 ,  이정이

IPC分类号： C12N15/11 ,  C12N15/52 ,  C12N15/77 ,  C12P13/08

CPC分类号： C12P13/08 ,  C12N9/1022 ,  C12Y202/01001

摘要： 본 발명은 라이신 생성에 이용될 수 있는 재조합 미생물 및 이와 관련된 탄소 대사 메커니즘에 관한 것으로, 구체적으로는 코리네박테리움 속 미생물에서의 오탄당 대사에 관여하는 트랜스케톨라아제(transketolase) 유전자 클러스터(tkt-tal-zwf-opcA-devB)의 발현을 조절하는 개량된 프로모터 변이체 및 이의 용도에 관한 것이다.

摘要翻译： 本发明涉及能够用于赖氨酸生产的重组微生物和与其相关的碳代谢机制，特别涉及用于控制转酮酶基因簇（tkt-tal-zwf-opcA-devB）表达的改良启动子突变体 ）涉及棒状杆菌中微生物的戊糖代谢及其用途。

公开(公告)号：WO2014152434A2

公开(公告)日：2014-09-25

申请号：PCT/US2014/027337

申请日：2014-03-14

申请人： GENOMATICA, INC.

发明人： BURGARD, Anthony, P. ,  OSTERHOUT, Robin, E. ,  PHARKYA, Priti ,  ANDRAE, Stefan ,  LIS, Ewa, T. ,  RISSO, Carla ,  TRAWICK, John, D.

IPC分类号： A61B17/70

CPC分类号： C12N15/63 ,  C07C1/24 ,  C07C11/167 ,  C07C31/207 ,  C07C33/025 ,  C07K14/195 ,  C09D147/00 ,  C09J147/00 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/88 ,  C12N9/90 ,  C12N15/52 ,  C12P5/026 ,  C12P7/04 ,  C12P7/18 ,  Y02E50/343

摘要： Provided herein are non-naturally occurring microbial organisms having a FaldFP, a FAP and/or metabolic modifications which can further include a MMP, a MOP, a hydrogenase and/or a CODH. These microbial organisms can further include a butadiene, 13BDO, CrotOH, MVC or 3-buten-1-ol pathway. Additionally provided are methods of using such microbial organisms to produce butadiene, 13BDO, CrotOH, MVC or 3-buten-1-ol.

摘要翻译： 本文提供了具有FaldFP，FAP和/或可进一步包含MMP，MOP，氢化酶和/或CODH的代谢修饰的非天然存在的微生物生物体。 这些微生物可以进一步包括丁二烯，13BDO，CrotOH，MVC或3-丁烯-1-醇途径。 另外提供了使用这些微生物生产丁二烯，13BDO，CrotOH，MVC或3-丁烯-1-醇的方法。

公开(公告)号：WO2014052920A2

公开(公告)日：2014-04-03

申请号：PCT/US2013/062459

申请日：2013-09-27

申请人： THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA

发明人： ATSUMI, Shota ,  OLIVER, John, W. K. ,  MACHADO, Iara, M.P.

IPC分类号： C12N1/21

CPC分类号： C12P7/26 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/88 ,  C12P7/18 ,  C12Y101/98 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y401/01005 ,  Y02P20/52

摘要： The present disclosure provides recombinant cyanobacteria having acetolactate synthase activity and acetolactate decarboxylase activity, as well as recombinant cyanobacteria having acetolactate synthase activity, acetolactate decarboxylase activity, and secondary alcohol dehydrogenase activity. Methods for the production of the recombinant cyanobacteria, as well as methods for use thereof for production of acetoin and 2,3- butanediol from carbon dioxide and light are also provided.

摘要翻译： 本公开提供具有乙酰乳酸合酶活性和乙酰乳酸脱羧酶活性的重组蓝细菌，以及具有乙酰乳酸合酶活性，乙酰乳酸脱羧酶活性和仲醇脱氢酶活性的重组蓝细菌。 还提供了用于生产重组蓝细菌的方法，以及其用于从二氧化碳和光产生乙偶姻和2,3-丁二醇的方法。

公开(公告)号：WO2014027021A1

公开(公告)日：2014-02-20

申请号：PCT/EP2013/066984

申请日：2013-08-14

申请人： VIB VZW ,  UNIVERSITEIT GENT

发明人： BOERJAN, Wout ,  VANHOLME, Ruben ,  SUNDIN, Lisa

IPC分类号： C12N15/82 ,  A01H5/00

CPC分类号： C12N15/8255 ,  C12N9/1022 ,  C12Y202/01002

摘要： The invention generally relates to the field of molecular biology, specifically the field of agricultural biology. In particular, the invention relates to means and methods for modifying the lignin flu and composition in plants. In particular the invention provides chimeric genes comprising transaldolase sequences which can be used in the context of the present invention.

摘要翻译： 本发明一般涉及分子生物学领域，特别是农业生物学领域。 特别地，本发明涉及用于改变植物中木质素流感和组成的方法和方法。 特别地，本发明提供了可用于本发明上下文中的转醛醇酶序列的嵌合基因。

公开(公告)号：WO2013115659A3

公开(公告)日：2013-10-03

申请号：PCT/NZ2013000012

申请日：2013-01-31

申请人： LANZATECH NEW ZEALAND LTD ,  KOEPKE MICHAEL ,  NAGARAJU SHILPA ,  CHEN WENDY

发明人： KOEPKE MICHAEL ,  NAGARAJU SHILPA ,  CHEN WENDY

IPC分类号： C12N1/21 ,  C12N15/52 ,  C12N15/53 ,  C12N15/74 ,  C12P7/06 ,  C12P7/40

CPC分类号： C12P7/065 ,  C12N1/20 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/1022 ,  C12N9/88 ,  C12N15/00 ,  C12N15/52 ,  C12N15/74 ,  C12N2510/02 ,  C12P7/40 ,  C12P7/42 ,  C12P7/46 ,  C12P7/48 ,  C12P7/50 ,  C12P7/56 ,  C12P13/06 ,  C12P13/08 ,  C12Y101/01004 ,  C12Y202/01006 ,  C12Y401/01005 ,  Y02E50/17

摘要： The invention relates to methods for the production of chemical compounds, particularly but not exclusively ethanol, by microbial fermentation. Also described are genetically modified micro-organisms capable of using carbon monoxide to produce one or more products, particularly but not exclusively ethanol as a main product, and producing a reduced amount or substantially no 2,3-butanediol and/or a precursor thereof.

摘要翻译： 本发明涉及通过微生物发酵来生产化学化合物，特别是但不限于乙醇的方法。 还描述了能够使用一氧化碳来产生一种或多种产品的遗传修饰的微生物，特别是但不限于乙醇作为主要产品，并且产生减少量或基本上不产生2,3-丁二醇和/或其前体。