本发明公开了一种基于乌饭树树叶制备不同色调靛蓝色素的方法。所述方法以乌饭树树叶为原料，通过提取纯化乌饭树树叶中的色素并在葡萄糖苷酶的作用下与多种氨基酸反应制得不同色调的靛蓝色素。制备方法包括以下步骤：原料干燥制粉、配制酶缓冲液、水提预处理、过滤、乌饭树树叶色素粗提物提纯、干燥浓缩、酶解转蓝、成品。利用本发明获得的天然靛蓝色素，产品质量稳定安全性好，且有较好的营养价值。根据所添加的氨基酸的种类及用量，可制得不同色调的靛蓝色素。