本发明提供了一种发动机冷却结构及系统和冷却方法，本发明的发动机冷却结构包括构造于发动机的缸盖中的缸盖燃烧室冷却水套，对应于排气歧管构造于所述缸盖中的缸盖排气水套，以及构造于所述发动机的缸体中的缸体水套，和设于所述发动机上的具有模块水腔与缸体节温器的节温器模块。而且本发明所述的发动机冷却结构通过使冷却液先流经缸盖冷却燃烧室，可保证对高热效率发动机缸盖燃烧室的冷却效果，同时，通过缸体节温器的设置，也可在冷却时于缸体节温器开启前，使缸体水套内零流量，从而能够使得缸体快速升温，实现降低摩擦损失与提升燃烧效率的效果，以可提升高热效率发动机的性能。