本发明提供一种基于多源测绘数据的通防管线勘测方法及系统，该方法包括：获取目标区域的正射影像图和激光点云数据；基于正射影像图，得到目标区域的所有通防管线及其每个通防管线的距离及长度，生成第一数据集；基于激光点云数据，得到每个通防管线节点的地标高度及每个通防管线对应的悬高数据，生成第二数据集；获取每个通防管线的种类及属性，生成第三数据集；将第一数据集、第二数据集和第三数据集输入到移动勘测系统中整合，生成目标区域的通防管线图。本发明具有勘测效率高、偶然误差小、可实时查证、且可以高精度的测量通防管线的高度、悬高等信息；此外，通过更新多源测绘数据，可实现数据的动态更新，满足勘测周期内各阶段的数据需要。