本发明提供了一种多轴向磁通电机串联安全冗余控制系统，包括检测模块、故障分析模块、通信模块、控制器、预热模块、冗余电源、电阻器、冗余电机和轴向磁通电机，冗余电源分别提供电力到预热模块和冗余电机。本发明通过预热模块向冗余电机绕组施加小电流，使冗余电机产生热量，逐渐升高温度，电阻器通电后对冗余电机进行间接加热，可以对冗余电机进行提前预热，控制器则控制冗余电机工作，由于冗余电机在响应之前已经预热，因此可以快速响应，解决了现有技术中冗余电机响应速度较慢的问题，而且由于冗余电机已经预热，进而可以大大减小负载的波动，从而提高系统的稳定性。