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公开(公告)号：CN118830508A
公开(公告)日：2024-10-25
申请号：CN202411314546.4
申请日：2024-09-20
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种新米虾全时期胚胎离体培养的简易方法，包括以下步骤或由以下步骤组成：步骤S1：制备成虾养殖水；步骤S2：制备胚胎孵化培养水；步骤S3：组装离体孵化装置；步骤S4：对抱卵的新米虾成虾进行胚胎的剥离；步骤S5：在孵化器中进行新米虾离体胚胎的全时期孵化；步骤S6：对染菌的新米虾离体胚胎进行胰蛋白酶溶液处理。本发明新米虾胚胎离体培养方法不受胚胎发育时期的限制，适用性广泛，可直接应用于锯齿新米虾离体胚胎发育的各个时期，也同样适用于其他新米虾的胚胎离体培养。同时，当胚胎染菌时，利用胰蛋白酶溶液进行吹打，能够挽救染菌的新米虾离体胚胎，有效减少菌丝黏连，使得新米虾离体胚胎能够正常发育孵化出仔虾。
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公开(公告)号：CN116343924A
公开(公告)日：2023-06-27
申请号：CN202310323911.7
申请日：2023-03-29
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种海洋无脊椎动物CUT&Tag实验测序数据分析方法。本发明通过将高通量测序后的Raw Data进行质量控制，获得高质量的Clean Data，将Clean Data比对到参考基因组获得详细的比对信息，过滤片段长度，保留长度为10‑700bp的片段，评估比对上的片段大小分布，利用文件格式转化来评估重复样品再现性，利用MACS2软件进行Peak Calling，并进行可视化分析。针对杂合率高、重复序列及结构变异多的无脊椎动物基因组(以侏儒蛤和凡纳滨对虾基因组为例)，本发明提供了一整套CUT&Tag技术的高通量测序分析流程方法，可快速实现大样本量的CUT&Tag数据分析，促进海洋无脊椎动物表观遗传学领域的发展。
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公开(公告)号：CN115948582A
公开(公告)日：2023-04-11
申请号：CN202211341770.3
申请日：2022-11-02
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/63
Abstract: 本发明提供一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法及应用，包括：(1)取急性肝胰腺坏死病致病质粒中，长度1665bp的pirAB序列作为检测靶基因，设计并筛选RT‑ERA引物组和RT‑ERA荧光型探针；(2)以待测样品的基因组DNA为模板，用设计的RT‑ERA引物组和探针，在33℃‑42℃下恒温RT‑ERA扩增，RT‑ERA扩增产物，检测荧光信号强度，根据15min内的扩增曲线的荧光信号值，判断扩增结果；本发明利用实时定量酶促重组扩增技术RT‑ERA建立AHPND检测体系，可在33℃‑42℃下高效扩增，20min内即可得到检测结果，具有较高的特异性且检出限大大降低，操作更加简便。
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公开(公告)号：CN117106698B
公开(公告)日：2024-01-26
申请号：CN202311377572.7
申请日：2023-10-24
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明涉及海洋鱼类肝、鳃组织细胞核的提取方法，属于细胞核提取技术领域。本发明解决的技术问题是提供一种海洋鱼类肝、鳃组织细胞核的提取方法。该方法包括以下步骤：S1、组织裂解：取海洋鱼类的组织，加入NE1裂解液中破碎并裂解，得到浑浊液；S2、细胞核释放：用细胞筛将S1步骤得到的浑浊液过滤，滤液离心，得到沉淀；S3、细胞核洗涤：用洗涤缓冲液洗涤S2步骤得到的沉淀，得到海洋鱼类组织细胞核。本发明方法，能够在较短时间内从海洋鱼类肝组织或鳃组织中成功分离提取大量较为纯净的完整的细胞核，且操作过程简单，无需特殊仪器设备，利用离心机及显微镜等常见实验室仪器即可完成细胞核提取过程，整个过程用时短，具有较强的实用性。
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公开(公告)号：CN115820936B
公开(公告)日：2023-12-19
申请号：CN202211367931.6
申请日：2022-11-03
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明提供一种基于ERA技术的十足目虹彩病毒1可视化快速检测方法及检测用引物和探针。本发明以十足目虹彩病毒1的ATP酶基因作为检测靶基因，设计合成引物和探针，并进行ERA检测，根据ERA扩增产物的荧光信号即可判断检测结果。本发明实验操作简单，耗时短速度快，检测灵敏度和特异性高，灵敏度可达1.0×100copies/μL，且结果可视化。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113789391A
公开(公告)日：2021-12-14
申请号：CN202110824311.X
申请日：2021-07-07
Applicant: 中国海洋大学 , 中国海洋大学三亚海洋研究院
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6806 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种仿刺参育种全基因组50KSNP芯片及应用，包括(1)仿刺参全基因组范围的50kSNP芯片的开发：通过构建仿刺参样品群体，全基因组范围的SNP分型，对仿刺参50KSNP标记筛选，HD‑marker高密度芯片的设计和开发探针的设计进而获得48K位点的液相芯片池；(2)测试芯片的准确性和分型效果，通过DNA样品质量检测，HD‑Marker芯片检测并对结果进行分析确保其具有较高的准确性和较好的分型效果，本芯片可应用于仿刺参全基因组育种芯片在不同群体仿刺参的遗传背景分析、仿刺参性状关联分析。
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公开(公告)号：CN113684280A
公开(公告)日：2021-11-23
申请号：CN202110768559.9
申请日：2021-07-07
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6837 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种仿刺参抗高温育种低密度12KSNP芯片及应用，包括(1)仿刺参全基因组范围的12KSNP芯片的开发：通过构件仿刺参抗高温群体，全基因组范围的SNP分型，对仿刺参12KSNP标记筛选，HD‑marker高密度芯片的设计和开发探针的设计进而获得12K位点的液相芯片池；(2)测试芯片的准确性和分型效果；本芯片可应用于仿刺参抗高温性状分子育种中的不同地理群体遗传背景分析、抗高温性状遗传力估计的应用以及抗高温性状的全基因组选择育种值分析(GS)。
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公开(公告)号：CN119920316A
公开(公告)日：2025-05-02
申请号：CN202510408809.6
申请日：2025-04-02
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种基于表观注释信息筛选分子标记进行全基因组选择育种的方法，包括以下步骤：步骤A：对凡纳滨对虾育种群体进行生长性状的表型测定和基因组测序，获得表型数据和SNP分型数据；步骤B：利用表型数据和SNP分型数据进行GS分析，通过主流育种模型预测育种群体的基因组育种值，筛选出最优育种模型；步骤C：利用最优育种模型结合关键组蛋白修饰区域通过ChromHMM分析进行染色质状态的分类，筛选出具有关键组蛋白修饰区域的功能性SNPs。这些SNPs具有较强功能关联性，用于不同地域群体，能够在相同的预测准确性下，利用更少的SNPs数量，为养殖动物的生长性状遗传解析提供更精确的分子标记，显著提升遗传育种值估计的准确性及跨群体效果，加速育种进程。
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公开(公告)号：CN118830508B
公开(公告)日：2024-12-10
申请号：CN202411314546.4
申请日：2024-09-20
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种新米虾全时期胚胎离体培养的简易方法，包括以下步骤或由以下步骤组成：步骤S1：制备成虾养殖水；步骤S2：制备胚胎孵化培养水；步骤S3：组装离体孵化装置；步骤S4：对抱卵的新米虾成虾进行胚胎的剥离；步骤S5：在孵化器中进行新米虾离体胚胎的全时期孵化；步骤S6：对染菌的新米虾离体胚胎进行胰蛋白酶溶液处理。本发明新米虾胚胎离体培养方法不受胚胎发育时期的限制，适用性广泛，可直接应用于锯齿新米虾离体胚胎发育的各个时期，也同样适用于其他新米虾的胚胎离体培养。同时，当胚胎染菌时，利用胰蛋白酶溶液进行吹打，能够挽救染菌的新米虾离体胚胎，有效减少菌丝黏连，使得新米虾离体胚胎能够正常发育孵化出仔虾。
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公开(公告)号：CN116287165A
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202310295064.8
申请日：2023-03-24
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及海洋无脊椎动物表观遗传学领域，尤其涉及利用CUT&Tag技术进行海洋无脊椎动物蛋白质与基因组DNA互作研究的实验方法，以侏儒蛤和凡纳滨对虾胚胎为例，包括以下步骤：S1、催产；S2、受精和培养受精卵；S3、配制试剂；S4、解离单细胞或提取细胞核；S5、细胞或细胞核计数；S6、处理ConA beads；S7、细胞(细胞核)和ConA beads孵育；S8、一抗孵育；S9、二抗孵育；S10、高活性PA/G‑Tn5转座酶孵育；S11、片段化；S12、DNA提取；S13、测序文库的扩增；S14、扩增产物纯化；S15、测序。本发明中，针对侏儒蛤细胞渗透压调整了单细胞解离及CUT&Tag实验溶液渗透压，针对凡纳滨对虾早期胚胎细胞易破裂、难以解离单细胞特点采用了提取细胞核进行CUT&Tag实验策略，使CUT&Tag技术可应用于海洋无脊椎动物，促进海洋无脊椎动物表观遗传学领域的发展，为贝类和虾类的高效生产提供理论依据。
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