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公开(公告)号：CN115029345A
公开(公告)日：2022-09-09
申请号：CN202210435996.3
申请日：2022-04-24
Applicant: 上海科技大学 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: C12N15/113 , C12N9/22 , C12Q1/6816 , C12Q1/6844 , C12Q1/70 , C12Q1/6806 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种基于CRISPR的检测试剂盒及其应用。本发明的检测试剂盒包含基因编辑系统，所述基因编辑系统包括核酸酶和引导RNA；所述引导RNA的序列选自如SEQ ID NO:1～4所示的核苷酸序列中的一种或多种。本发明的试剂盒能够在缩短的反应时间、降低的反应温度内提高检测效率的同时降低检测限，操作无核酸抽提、免开盖，简便快速。
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公开(公告)号：CN114891908A
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202210731579.3
申请日：2022-06-25
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种用于预测屎肠球菌对抗生素药敏表型的特征基因组合、试剂盒及测序方法，预测屎肠球菌对链霉素药敏表型的特征基因为aad(6)，预测屎肠球菌对万古霉素药敏表型的特征基因为vanA和vanRB，预测屎肠球菌对替考拉宁药敏表型的特征基因为vanA，若基因检测结果为阴性，推测为敏感，若基因检测结果为阳性，推测为耐药。通过检测特征组合中的基因的存在与否判断屎肠球菌对链霉素、万古霉素、替考拉宁的药敏表型。本发明提供的特征组合预测药敏表型的准确率高，有利于临床开展对屎肠球菌相关感染的精准治疗。
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公开(公告)号：CN113257345B
公开(公告)日：2021-10-29
申请号：CN202110639770.0
申请日：2021-06-09
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明提供了一种利用基因序列信息预测药物最小抑菌浓度的方法，所述方法包括如下步骤：获取耐药菌的多个样本的基因组测序数据，并根据所述基因组测序数据生成耐药菌的SNP信息和/或核苷酸k‑mers计数信息；以至少一种碱基长度的平滑滑动窗口切割所述基因组测序数据，统计切割后所有碱基片段的出现频率，以至少一种碱基片段进行拼接，合并所得拼接结果与所对应的耐药菌的最小抑菌浓度，获得特征数据集；将所述耐药菌的样本随机分为训练集和测试集，采用特征数据集训练机器学习模型，并计算所述机器学习模型的预测精度。该方法预测准确度较高，可以缩短最小抑菌浓度的检测时间，对临床用药具有重要的指导意义。
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公开(公告)号：CN113257345A
公开(公告)日：2021-08-13
申请号：CN202110639770.0
申请日：2021-06-09
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明提供了一种利用基因序列信息预测药物最小抑菌浓度的方法，所述方法包括如下步骤：获取耐药菌的多个样本的基因组测序数据，并根据所述基因组测序数据生成耐药菌的SNP信息和/或核苷酸k‑mers计数信息；以至少一种碱基长度的平滑滑动窗口切割所述基因组测序数据，统计切割后所有碱基片段的出现频率，以至少一种碱基片段进行拼接，合并所得拼接结果与所对应的耐药菌的最小抑菌浓度，获得特征数据集；将所述耐药菌的样本随机分为训练集和测试集，采用特征数据集训练机器学习模型，并计算所述机器学习模型的预测精度。该方法预测准确度较高，可以缩短最小抑菌浓度的检测时间，对临床用药具有重要的指导意义。
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公开(公告)号：CN109833470A
公开(公告)日：2019-06-04
申请号：CN201711203010.5
申请日：2017-11-27
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明公开HtrA3蛋白在制备治疗非小细胞肺癌药物中的应用。本发明的优点在于：HtrA3在非小细胞肺癌发生发展中的生物学意义，以及它参与调控肿瘤侵袭转移的潜在机制目前未有报道，本发明为治疗非小细胞肺癌，尤其是TGF-β1相关通路活化状态的进展期非小细胞肺癌提供了新思路、新靶点。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN120041587A
公开(公告)日：2025-05-27
申请号：CN202311588804.3
申请日：2023-11-24
Applicant: 上海科技大学 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12N15/113 , C12N15/11 , C12R1/32
Abstract: 本发明公开了一种快速检测分枝杆菌的方法。所述方法包括使用用于检测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)的引物对，所述引物对包含上游引物和下游引物；所述上游引物包含如SEQ ID NO:1或2所示的核苷酸序列，所述下游引物包含如SEQ ID NO:3‑6任一项所示的核苷酸序列。本发明可以快速、准确、以高灵敏度检测生物样本中的MTB活菌的RNA，相比现有的NASBA试剂盒降低检测限达1000倍，降低了模板要求，为MTB的即时检测提供了更优选择。
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公开(公告)号：CN117562921A
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202311469570.0
申请日：2023-11-07
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明涉及一种钼纳米点，具体涉及一种钼纳米点在制备用于治疗急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征的药物中的应用。与现有技术相比，本发明解决现有技术中缺少作用机理明确、制备简单、具有临床转化意义的ALI/ARDS治疗药物。基于钼原子的强还原作用，实现了在肺组织部位清除过量的ROS，通过抑制NLRP3依赖性焦亡通路，发挥抗炎与抗氧化作用，从而改善肺组织损伤情况，有望作为一种安全、有效、具有临床转化意义的ALI/ARDS治疗药物。
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公开(公告)号：CN116948813A
公开(公告)日：2023-10-27
申请号：CN202210421140.0
申请日：2022-04-20
Applicant: 上海科技大学 , 明瑞达(苏州)人工智能科技有限公司 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 中国科学院上海技术物理研究所
IPC: C12M1/38 , C12M1/34 , C12M1/24 , C12M1/10 , C12M1/02 , C12M1/00 , C12Q1/6844 , C12Q1/70 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种CRISPR核酸检测系统及方法，CRISPR核酸检测系统包括荧光检测模组、试剂下压模组、加热模组、试管载具组、旋转模组和框架，旋转模组上设有至少4个检测工位，旋转模组与框架的底部基座相连接；试管载具组从上方套设、并可拆卸地固定于旋转模组的检测工位；加热模组包括至少3个加热单元，各加热单元、荧光检测模组依次固定环设在框架的底部基座，并与检测工位依次上下对应，试剂下压模组设于框架的上方，并与加热单元的设置位置上下对应。本发明的检测系统适用于CRISPR核酸的快速检测；并具有良好密封性。本发明的检测方法可满足多个步骤反应同时在不同试管进行，实现多通量的检测。
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公开(公告)号：CN116554348A
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202310461005.3
申请日：2023-04-03
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: C07K19/00 , A61K39/00 , A61P11/00 , C12N5/10 , C12N15/867
Abstract: 本发明是申请号为202310346352.1的分案申请。本发明涉及GPC3‑CAR‑T在治疗特发性肺纤维化中的应用。本发明在临床案例中证实了GPC3特发性肺纤维化患者的肺成纤维细胞中表达上调，在动物实验中证实了GPC3基因和蛋白在肺纤维化小鼠模型中上调，还制备了GPC3CAR‑T细胞，证实GPC3CAR‑T对原代肺纤维化细胞的杀伤作用，表明应用CART靶向GPC3可能是一种很有潜力的特发性肺纤维化治疗方式。
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公开(公告)号：CN221383769U
公开(公告)日：2024-07-23
申请号：CN202322665830.3
申请日：2023-10-07
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本实用新型提供一种经皮肺穿刺机器人从手操作实时监控装置及穿刺系统，包括：弓形支架，包括：第一弓形支架和第二弓形支架，第一弓形支架和第二弓形支架沿弓形轮廓在下部设有第一轨道，在中部设有第二轨道；横杆，两端分别位于两侧的第一轨道内，横杆在第一轨道内滑动；滑杆，两端分别位于两侧的第二轨道内，滑杆沿第二轨道移动；实时监控设备，设于滑杆上，用于实时获取手术区域的图像；显示器，与实时监控设备连接，显示器接收并显示实时监控设备发送的图像；控制装置，根据图像调节机器人的操作。本实用新型可以提供更准确、安全和可控的手术操作视野与环境，提高肺穿刺活检的精确度和准确度。
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