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公开(公告)号:CN106811460B
公开(公告)日:2020-11-27
申请号:CN201510857393.2
申请日:2015-11-30
IPC分类号: C12N15/10 , C40B50/06 , C40B40/06 , C12Q1/6869
摘要: 本发明提供一种用于低频突变检测的二代测序文库构建方法及试剂盒。本发明的低频突变检测方法能有效去除假阳性、提高目标DNA片段富集效率且测序数据浪费少。本发明的用于低频突变检测的二代测序文库构建方法包括得到平末端DNA片段、得到3'端加A的DNA片段、使用特定核苷酸序列得到加接头DNA片段以及使用特定核苷酸序列得到扩增产物等步骤。
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公开(公告)号:CN106702497B
公开(公告)日:2020-01-10
申请号:CN201510792461.1
申请日:2015-11-17
IPC分类号: C40B40/06 , C12Q1/6869
摘要: 本发明涉及用于孕妇外周血中游离DNA检测的试剂盒及建库方法。本发明的孕妇外周血中游离DNA检测的文库构建方法及试剂盒可用于孕妇外周血中游离DNA检测,例如产前诊断。所述构建测序用DNA文库的方法包括将平末端DNA片段中的至少一部分进行单3'端加A,得到单3'端加A的DNA片段的步骤;和将步骤B‑1中得到的单3'端加A的DNA片段进行平末端连接的步骤。
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公开(公告)号:CN105506084B
公开(公告)日:2019-02-15
申请号:CN201511001306.X
申请日:2015-12-28
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
摘要: 本发明提供一种快速高效地检测基因组DNA羟甲基化的方法及试剂盒。该方法包括:用限制性内切酶MspI酶切基因组DNA,得到酶切片段;在所述酶切片段的两端分别连接P5接头和P7接头,得到加接头的酶切片段;对所述加接头的酶切片段进行糖基化处理,使其中的羟甲基化碱基转化为糖基羟甲基化碱基,得到包含糖基羟甲基化碱基的酶切片段;将所述包含糖基羟甲基化碱基的酶切片段再次用限制性内切酶MspI酶切,得到二次酶切产物;对所述二次酶切产物进行PCR扩增,得到测序用DNA文库;以及,对所述测序用DNA文库进行二代测序。与传统的RRHP方法相比,该方法无需使用包含双脱氧核糖核苷酸的接头。
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公开(公告)号:CN108103168A
公开(公告)日:2018-06-01
申请号:CN201611061510.5
申请日:2016-11-23
摘要: 本发明涉及一种FFPE样本中DNA质量评估方法。总体而言,本发明通过核苷酸序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:8所示的引物对FFPE样本DNA进行PCR扩增,根据琼脂糖凝胶电泳结果有效评估DNA质量的等级,对FFPE样本的DNA质量准确分级。
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公开(公告)号:CN108103167A
公开(公告)日:2018-06-01
申请号:CN201611046670.2
申请日:2016-11-23
摘要: 本发明涉及一种FFPE样本DNA片段质量的检测试剂盒及方法。总体而言,本发明通过三对引物对FFPE样本DNA片段进行扩增,并将扩增产物利用琼脂糖凝胶电泳检测,根据琼脂糖凝胶电泳图判定FFPE样本DNA片段质量。
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公开(公告)号:CN108103052A
公开(公告)日:2018-06-01
申请号:CN201611050351.9
申请日:2016-11-24
IPC分类号: C12N15/10 , C40B50/06 , C12Q1/6844
摘要: 本发明提供一种提高基因组覆盖度的单细胞全基因组扩增及文库构建方法。本发明的单细胞基因组扩增方法,采用多重置换扩增方法对单细胞基因组进行扩增,其包括:使一组引物、DNA聚合酶和单细胞基因组在溶液中接触;以及对所述溶液进行扩增,使得进行所述单细胞基因组的扩增反应;其中,所述扩增的时间为0.5小时以上且2小时以下。
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公开(公告)号:CN107794293A
公开(公告)日:2018-03-13
申请号:CN201610800089.9
申请日:2016-08-31
IPC分类号: C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12N15/10
CPC分类号: C12Q1/6806 , C12N15/1093 , C40B50/06 , C12Q2565/519 , C12Q2523/308 , C12Q2563/131
摘要: 本发明提供一种基因捕获试剂盒。本发明的基因捕获试剂盒包括用于基因捕获的探针,所述用于基因捕获的探针包括针对目标基因的探针、以及针对内参基因的探针。根据本发明,在基于基因捕获测序的CNV检测中,即使在后期的数据处理中不使用背景数据库的情况下,也能够获得良好的检测结果。
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公开(公告)号:CN107794258A
公开(公告)日:2018-03-13
申请号:CN201611046449.7
申请日:2016-11-23
IPC分类号: C12N15/10 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
CPC分类号: C12N15/1093 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12Q2531/113 , C12Q2525/191 , C12Q2535/122
摘要: 本发明涉及一种DNA大片段文库的构建方法及其应用。本发明提供的DNA大片段文库的构建方法用于DNA大片段文库的构建,包括将DNA大片段的两端加上具有黏性末端的接头或者具有第一切割位点的接头,得到具有黏性末端的DNA大片段的步骤,以及将具有黏性末端的DNA大片段进行环化,得到环化DNA大片段的步骤。本发明通过对接头的进一步特殊设计,还可以为构建的大片段DNA文库提供质控点。
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公开(公告)号:CN104789466B
公开(公告)日:2018-03-13
申请号:CN201510228241.6
申请日:2015-05-06
IPC分类号: C12M1/34
摘要: 本发明公开了检测染色体非整倍性的试剂盒和装置。该装置包括测序数据检测模块以得到所有染色体的测序数据;第一覆盖度计算模块以得到各染色体的矫正前覆盖度;ZCNV值计算模块:用于计算各窗口的单一序列数量的ZCNV值;拷贝数异常片段查询模块以在测序数据中查询300Kb以上且其80%以上窗口的ZCNV值都≧4或≦‑4的片段;拷贝数异常片段确定模块以确定待测孕妇的拷贝数异常片段;α第一计算模块用于按式(1)计算参数α;α第二计算模块用于按式(2)计算参数α;矫正模块以对矫正前覆盖度矫正得到矫正后覆盖度;第二覆盖度计算模块以计算各染色体的Zaneu值;Zaneu值判断模块以判断Zaneu值是否≧3;染色体非整倍性确认模块以确定染色体具有非整倍性。该检测更准确。
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公开(公告)号:CN109321984B
公开(公告)日:2022-08-23
申请号:CN201710647896.6
申请日:2017-08-01
摘要: 本发明涉及一种测序用DNA文库。本发明的测序用DNA文库包括第一双链DNA分子,所述第一双链DNA分子包括第一DNA链,该第一DNA链从5'端起依次包括位于5'端的桥式引物DNA序列1、目的片段特异性扩增引物DNA序列1、待读取DNA序列S、目的片段特异性扩增引物DNA序列2的反向互补序列以及位于3'端的桥式引物DNA序列2的反向互补序列,所述桥式引物DNA序列1和所述桥式引物DNA序列2是测序芯片上的DNA序列,所述目的片段特异性扩增引物DNA序列1和所述目的片段特异性扩增引物DNA序列2用于对包含待读取DNA序列S的目的DNA片段进行特异性扩增的引物DNA序列。本发明的测序用DNA文库能够增加单轮测序反应中碱基读取复杂度,从而提高测序质量。
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