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公开(公告)号：CN116286991A
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202310097328.9
申请日：2023-02-10
Applicant: 中国农业科学院农业基因组研究所
Abstract: 本发明公开了一种全基因组增强子筛选系统，该系统包括MAE‑seq增强子筛选载体、待筛选片段构成的质粒文库、转染质粒文库并抽提gDNA进行PCR扩增后测序获得的input文库、转染质粒文库经荧光分选后再抽提gDNA并进行PCR扩增后测序获得的output文库以及可过滤掉output文库中假阳性数据的统计学过滤模型。由此，可以通过仅对待筛选的基因片段构建质粒文库、荧光分选、高通量测序及过滤模型过滤即可实现高效稳定的全基因组增强子筛选。本系统适用于适合物种，且不用构建转录组文库，通过荧光表达富集直观高效，还没有覆盖范围不均匀、过度分散且被测序偏差混淆的问题，是相对于现有技术STARR‑seq操作更便捷，成本更低，且稳定、高效的增强子筛选系统。
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公开(公告)号：CN115995268A
公开(公告)日：2023-04-21
申请号：CN202211183742.3
申请日：2022-09-27
Applicant: 深圳市中医院
Abstract: 本发明为一种痰瘀痹阻症痛风患者宏基因组库构建方法，基于用药前患者微生物宏基因组数据、用药后患者微生物宏基因组数据以及对照微生物宏基因组数据筛选得到差异数据录入宏基因数据库效果。该方法解决了现有方案中不容易发现一致的趋势，不能更精确、显著的表征的问题。本发明通过比较痛风患者用药前后和健康对照，发现筛选了体现病症的一致趋势，是更加有参考价值，更精确、明显的表征。
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公开(公告)号：CN115349128A
公开(公告)日：2022-11-15
申请号：CN202180023963.1
申请日：2021-02-12
Applicant: 齐默尔根公司
Inventor： O·刘 , E·阿基瓦 , T·H·艾尔斯 , U·加姆 , S·加内什 , S·L·B·亨德里克斯 , W·W·黄 , J·H·金 , A·内克尔曼 , S·奥滕-帕比 , C·佩利坎 , D·斯坎内尔 , Z·塞尔贝尔 , J·肖克 , M·W·斯内登 , 杨晓
Abstract: 本公开提供了用于鉴定编码天然产物的多基因簇(MGC)的方法和系统。在一些实施例中，本公开还教示了用于产生适于MGC搜索生物信息工具和技术的经测序且经组装的宏基因组文库的方法。
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公开(公告)号：CN115206438A
公开(公告)日：2022-10-18
申请号：CN202210589967.2
申请日：2022-05-26
Applicant: 上海合全药业股份有限公司
Abstract: 本发明涉及酶的定向进化数据的存储方法、装置及存储介质，检索方法、装置及存储介质，以及存储酶的定向进化数据的计算机可读存储介质。该存储方法包括以下步骤：获取目标酶的定向进化数据；对所述定向进化数据进行结构化处理；检索信息字段与所述目标酶的至少一个关系字段相符的至少一个关联酶，以构建所述目标酶的关联集；根据所述目标酶及各所述关联酶的关系字段以及信息字段，分别定义所述目标酶及各所述关联酶的数据存储节点，并分别确定各所述数据存储节点之间的关联关系，以构建关于所述目标酶的数据关系结构体；以及将关于所述目标酶的数据关系结构体存储到存储器。
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公开(公告)号：CN114736968B
公开(公告)日：2022-09-27
申请号：CN202210665014.X
申请日：2022-06-13
Applicant: 南京世和医疗器械有限公司
Abstract: 本发明涉及血浆游离DNA甲基化标志物在肺癌早筛中的用途以及肺癌早筛装置，属于基因诊断技术领域。本研究通过肺癌血浆cfDNA来研究肺癌和健康人的甲基化差异，并筛选出具有明显差异的甲基化区域，然后通过广义线性模型的方法，首次筛选出29个最佳的差异性甲基化区域(Differentially Methylated Region，DMR)并建立肺癌甲基化风险预测模型，适用于对早期肺癌进行风险预测评估，适用于高危人群肺癌的筛查与诊断。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114774515A
公开(公告)日：2022-07-22
申请号：CN202210298474.3
申请日：2022-03-24
Applicant: 北京安智因生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6883 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12N15/11 , G16B20/50 , G16B25/20 , G16B35/10 , G16B35/20 , G16B50/10 , G16B50/30
Abstract: 本申请涉及基因检测领域，具体提供一种检测多囊肾疾病基因突变的捕获探针、试剂盒及其检测方法，本申请具有捕获效率高、假阳性率低、准确率高、操作简单、节约成本等诸多优势。
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公开(公告)号：CN114426982A
公开(公告)日：2022-05-03
申请号：CN202210160708.8
申请日：2022-02-22
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N15/74 , C12N15/65 , C40B50/06 , C40B40/02 , C12N1/21 , C12N15/54 , G16B35/20 , G16B35/10 , G16B25/20 , G16B30/10 , C12R1/63
Abstract: 本发明公开了一种细胞代谢重编程的方法及其应用，属于基因工程领域，本发明利用细胞代谢网络的敏感节点对代谢网络进行重编程，主要包括基于CRISPRi的双基因组合敲弱、细胞高通量筛选和基于幸存率的基因交互作用分析三部分，本发明提供了一个新颖的、简单高效的、成本低廉的智能代谢重编程方法，可广泛用于操作细胞代谢网络。
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公开(公告)号：CN110706741B
公开(公告)日：2021-08-03
申请号：CN201910793341.1
申请日：2019-08-27
Applicant: 浙江工业大学
Abstract: 一种基于序列小生境的多模态蛋白质结构预测方法，在蒙特卡洛框架下，首先，使用原始的能量函数进行第一轮搜索；然后，根据每次运行后得到的构象信息构造一个用于下一次运行的能量函数，避免构象反复陷入相同的能量陷阱，不仅能够缓解能量函数不精确的问题，而且可以增强采样能力，提高采样效率，从而提升预测精度。本发明提供一种预测精度较高的基于序列小生境的多模态蛋白质结构预测方法。
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公开(公告)号：CN112820417A
公开(公告)日：2021-05-18
申请号：CN202110114643.9
申请日：2021-01-26
Applicant: 四川大学
Abstract: 本发明公开一种基于转录组学的前列腺癌药物组合预测的方法，包括以下步骤：收集基因表达数据、计算疾病差异表达基因、计算药物扰动转录特征、衡量药物相似性以及逆转疾病特征的正交性、根据OS值排序预测药物组合；本发明可以快速有效的为目标肿瘤预测潜在的协同作用药物组合，为后续实验缩小测试范围，节约大量的时间和成本，并且若能对患者的疾病组织进行RNA测序，那么该预测方法有潜力以患者特异性的方式预测治疗患者疾病的潜在药物组合，另外，该预测方法仅需要基因表达数据作为输入，数据便于获取，而药物扰动前后的基因表达数据反映了药物治疗所产生的生物学反应，可以为识别药物作用机制和预测协同药物组合提供线索。
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公开(公告)号：CN110246539A
公开(公告)日：2019-09-17
申请号：CN201910300069.9
申请日：2019-04-15
Applicant: 成都益安博生物技术有限公司
Abstract: 本发明公开了一种评估受试者免疫力水平的方法和装置，包括从受试者样本中分离淋巴细胞，提取淋巴细胞的RNA并进行逆转录，利用特异性引物获得BCR和/或TCR可变区多核苷酸，对所述多核苷酸进行测序获得序列信息，计算BCR和/或TCR可变区序列的D50值，从而判断受试者的免疫力水平。
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