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公开(公告)号：CN118398076A
公开(公告)日：2024-07-26
申请号：CN202410369605.1
申请日：2024-03-28
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司
摘要： 本申请涉及生信技术领域，具体提供一种基于LP‑WGS测序数据提取FDEM/FDBM特征并进行PCC系统降噪的肺癌早筛模型构建及其应用。通过对血浆样本cfDNA进行全基因组低深度测序，对肺癌和健康人cfDNA进行高通量测序，从测序结果中提取新特征，并通过PCC(Principal Component Correction，主成分校正)方法对新特征进行背景降噪提高癌症信号的信噪比，从而构建高敏感型的区分肺癌和健康人的机器学习模型，最终实现对肺癌患者的高精确性的识别。
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公开(公告)号：CN114334004B
公开(公告)日：2024-03-15
申请号：CN202111472221.5
申请日：2021-12-04
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
摘要： 本发明属于生信分析领域，具体涉及一种病原微生物测序数据快速比对鉴定方法及其应用，所述方法基于自研分类算法分组快速比对，通过复分类算法统计分析获得病原微生物鉴定和相对定量。
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公开(公告)号：CN116356056B
公开(公告)日：2023-12-15
申请号：CN202310373186.4
申请日：2023-04-07
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声诊断医疗器械有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
摘要： 本申请涉及生物技术领域，具体提供一种检测结核分枝杆菌耐药基因突变的引物、产品及应用，本申请能够在核酸质谱平台中同时完成多种治疗结核药物相关16基因53SNP位点的准确检测。
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公开(公告)号：CN115719616B
公开(公告)日：2023-09-29
申请号：CN202211486884.7
申请日：2022-11-24
申请人： 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
摘要： 本申请属于生信分析技术领域，具体涉及一种病原物种特异性序列的筛选方法及系统，本申请建立了一套便捷获取物种特异性序列的方法，可用于种/亚种/菌株型的特异性区域筛选，相较于传统方法，准确性高并且时间成本低，同时还能实现使用最少引物对即可覆盖最全目标物种。
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公开(公告)号：CN116312796A
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202310103910.1
申请日：2023-02-07
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司 , 江苏先声诊断技术有限公司
摘要： 本申请属于生信分析技术领域，具体涉及一种基于期望最大化算法(EM)的宏基因组丰度估计方法，包括基于宏基因组测序数据的比对信息，引入参考基因组唯一比对位置的比例量化物种参考基因组相似度对比对信息的影响，构建统计模型刻画观测到的唯一比对和多重比对出现的概率；采用EM求解所构建的统计模型，估计宏基因组中的物种丰度。本申请由于量化了物种参考基因组相似度的影响，因此能够在物种水平上提高宏基因组丰度估计的准确性，进而改善宏基因组物种鉴定的灵敏度和特异度。
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公开(公告)号：CN116287266A
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202310225516.5
申请日：2023-03-07
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声诊断医疗器械有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B20/30 , G16B45/00
摘要： 本申请涉及分子诊断技术领域，具体提供一种DNA复制晚期区域在泛癌种诊断中的应用。
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公开(公告)号：CN115719616A
公开(公告)日：2023-02-28
申请号：CN202211486884.7
申请日：2022-11-24
申请人： 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
摘要： 本申请属于生信分析技术领域，具体涉及一种病原物种特异性序列的筛选方法及系统，本申请建立了一套便捷获取物种特异性序列的方法，可用于种/亚种/菌株型的特异性区域筛选，相较于传统方法，准确性高并且时间成本低，同时还能实现使用最少引物对即可覆盖最全目标物种。
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公开(公告)号：CN113611359B
公开(公告)日：2022-08-05
申请号：CN202110927474.0
申请日：2021-08-13
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
IPC分类号： G16B20/20
摘要： 本发明提供一种通过降维聚类分群提高宏基因组测序数据菌种组装效率的方法，所述方法通过k‑mer频率或频数统计，在组装前进行降维预分群，能够显著提高宏基因组组装效率，组装时间至少减少一半以上，同时保证生信鉴定的有效性和准确性。
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公开(公告)号：CN114317748A
公开(公告)日：2022-04-12
申请号：CN202111630011.4
申请日：2021-12-28
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/686 , C12N15/11
摘要： 本发明属于基因检测领域，具体涉及一种基于ddPCR的AML微小残留病变监测方法，试剂盒及其应用，可针对不同患者的FLT3‑ITD突变进行针对检测，检测灵敏度高，可检出低至1‑1000拷贝和10‑5个细胞，检测特异性好，不能扩增野生型FLT3,但可检出不同患者的FLT3特异性突变，方法适用面更广，针对性更强。
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公开(公告)号：CN114300055A
公开(公告)日：2022-04-08
申请号：CN202111629600.0
申请日：2021-12-28
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
摘要： 本发明提供一种通过降维分群和校正基因组长度优化宏基因组纳米孔测序数据定量的方法，所述方法能够提高宏基因组数据的定量准确度，与传统定量方法相比，相关性平均提高50％左右。
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