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公开(公告)号:CN109554460A
公开(公告)日:2019-04-02
申请号:CN201811545154.3
申请日:2018-12-17
申请人: 上海市疾病预防控制中心 , 上海交通大学 , 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
IPC分类号: C12Q1/6883 , C12Q1/6881 , C12N15/11
摘要: 本发明公开的一种基于HLA基因多态性位点的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:A(H7N9)患者和健康对照标本的收集步骤;HLA候选位点的初筛步骤;HLA高风险位点的验证确认步骤。本发明还公开了一种基于HLA基因多态性位点预测H7N9易感人群的用途,其特征在于,所述多态性位点包括HLA-A*02:06和/或HLA-DRB1*12:02。本发明采用多重PCR靶基因捕获联合高通量二代测序的技术,对A(H7N9)禽流感患者和健康对照HLA区域的基因多态性进行检测分析。运用其他研究的大样本健康对照中进行验证,增强了小样本群体基因组研究结果的可靠性,提高了筛选出的基因位点和疾病关联的有效性。
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公开(公告)号:CN109554460B
公开(公告)日:2022-03-22
申请号:CN201811545154.3
申请日:2018-12-17
申请人: 上海市疾病预防控制中心 , 上海交通大学 , 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
IPC分类号: C12Q1/6883 , C12Q1/6881 , C12N15/11
摘要: 本发明公开的一种基于HLA基因多态性位点的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:A(H7N9)患者和健康对照标本的收集步骤;HLA候选位点的初筛步骤;HLA高风险位点的验证确认步骤。本发明还公开了一种基于HLA基因多态性位点预测H7N9易感人群的用途,其特征在于,所述多态性位点包括HLA‑A*02:06和/或HLA‑DRB1*12:02。本发明采用多重PCR靶基因捕获联合高通量二代测序的技术,对A(H7N9)禽流感患者和健康对照HLA区域的基因多态性进行检测分析。运用其他研究的大样本健康对照中进行验证,增强了小样本群体基因组研究结果的可靠性,提高了筛选出的基因位点和疾病关联的有效性。
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公开(公告)号:CN113046474A
公开(公告)日:2021-06-29
申请号:CN201911386991.0
申请日:2019-12-29
申请人: 上海星耀医学科技发展有限公司 , 上海复星长征医学科学有限公司 , 北京大学第三医院 , 上海市疾病预防控制中心 , 上海交通大学医学院附属新华医院 , 上海市东方医院 , 北京大学人民医院 , 复旦大学
IPC分类号: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12R1/93
摘要: 本发明公开了腺病毒的基于LAMP技术的检测试剂盒。LAMP引物根据腺病毒的特异保守序列设计,每组引物包含6条寡核苷酸。用于腺病毒检测时,可通过肉眼观察呈白色沉淀;亦可使用恒温核酸扩增分析仪对扩增产物与核酸染料结合后发出荧光信号进行检测并进行处理分析,形成扩增曲线,并根据Tt值判断检测结果。本发明为腺病毒测提供了一个新的技术平台,适宜在基层单位、现场监测和床旁检测中推广应用。
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公开(公告)号:CN109536600A
公开(公告)日:2019-03-29
申请号:CN201811545165.1
申请日:2018-12-17
申请人: 上海市疾病预防控制中心 , 上海交通大学
IPC分类号: C12Q1/6883 , C12N15/11
摘要: 本发明所公开的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。本发明还公开了一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂盒及基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的分析方法。通过本发明所提供的预测A(H7N9)易感人群的方法快速、简便、有效、准确度高,为预测A(H7N9)易感人群后续靶向药的研制和进一步发病机理的研究提供了新的思路和方向。
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公开(公告)号:CN109536600B
公开(公告)日:2021-11-05
申请号:CN201811545165.1
申请日:2018-12-17
申请人: 上海市疾病预防控制中心 , 上海交通大学
IPC分类号: C12Q1/6883 , C12N15/11
摘要: 本发明所公开的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。本发明还公开了一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂盒及基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的分析方法。通过本发明所提供的预测A(H7N9)易感人群的方法快速、简便、有效、准确度高,为预测A(H7N9)易感人群后续靶向药的研制和进一步发病机理的研究提供了新的思路和方向。
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公开(公告)号:CN113046473A
公开(公告)日:2021-06-29
申请号:CN201911386987.4
申请日:2019-12-29
申请人: 上海星耀医学科技发展有限公司 , 上海复星长征医学科学有限公司 , 北京大学第三医院 , 上海市疾病预防控制中心 , 上海交通大学医学院附属新华医院 , 上海市东方医院 , 北京大学人民医院 , 复旦大学
IPC分类号: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了鼻病毒的基于LAMP技术的检测试剂盒。LAMP引物根据鼻病毒的特异保守序列设计,每组引物包含6条寡核苷酸。用于鼻病毒检测时,可通过肉眼观察呈白色沉淀;亦可使用恒温核酸扩增分析仪对扩增产物与核酸染料结合后发出荧光信号进行检测并进行处理分析,形成扩增曲线,并根据Tt值判断检测结果。本发明为鼻病毒测提供了一个新的技术平台,适宜在基层单位、现场监测和床旁检测中推广应用。
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公开(公告)号:CN117690492A
公开(公告)日:2024-03-12
申请号:CN202311645164.5
申请日:2023-12-04
申请人: 上海市疾病预防控制中心
摘要: 本发明提供了一种基于全基因组测序的寄生虫虫种鉴定分析方法,其特征在于,包含如下步骤:S1.获取原始数据;S2.对原始数据进行数据质控和数据统计后,输出fastq序列,所述数据质控,通过排除数据中的低质量碱基列,获得优化后的序列;S3.去除宿主人源基因组序列;S4.将经S3处理后的测序数据与数据库进行比对分析,从而输出基于k‑mer的所有基因组的最低共同祖先LCA,对每条基因组序列进行分类,并按照门纲目科属和种给出对应的统计信息。本发明可以在短时间内获知寄生虫虫种的相关序列,从而进行相关虫种的鉴定,提供了一种快速精准的寄生虫虫种鉴定技术。
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公开(公告)号:CN102296107A
公开(公告)日:2011-12-28
申请号:CN201010212469.3
申请日:2010-06-28
申请人: 天津生物芯片技术有限责任公司 , 上海市疾病预防控制中心 , 上海市预防医学研究院
CPC分类号: Y02A50/451 , Y02A50/52
摘要: 本发明提供一种用于检测霍乱弧菌O1群的引物和试剂盒,该引物由SEQ ID NO:1-2所示的核苷酸序列组成,其试剂盒中含有上述的引物。使用本发明的引物和试剂盒,经过较为简单的操作程序就可以进行快速、灵敏、简便的检测霍乱弧菌O1群,操作简便,快速,成本低。
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公开(公告)号:CN105242037A
公开(公告)日:2016-01-13
申请号:CN201510567026.9
申请日:2015-09-09
申请人: 上海市疾病预防控制中心
IPC分类号: G01N33/531 , G01N33/569
CPC分类号: G01N33/531 , G01N33/56911
摘要: 本发明涉及一种病原菌免疫磁珠的制备和应用,特别涉及富集TDH致病性副溶血性弧菌免疫磁珠制备方法及应用。主要解决目前检测方法只能对其进行定性分析,不能做到分离致病性副溶血性弧菌的技术问题。本发明的技术方案是通过表达纯化副溶血性弧菌中毒力因子TDH,将其免疫大白兔,获得多克隆抗体,然后将多克隆抗体偶联在磁珠上,获得结合标记二抗的免疫磁珠,然后直接捕获食品中产耐热直接溶血素副溶血性弧菌。本发明适用于出入境检验检疫、水产养殖业、食品卫生和疾病预防控制及相关实验室开展的针对产耐热直接溶血素副溶血性弧菌的检测分离工作。
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公开(公告)号:CN116536441A
公开(公告)日:2023-08-04
申请号:CN202310708007.8
申请日:2023-06-14
申请人: 上海市疾病预防控制中心
IPC分类号: C12Q1/689 , C12N15/11 , C12Q1/6844
摘要: 本发明提供了一种基于RPA检测mcr‑1基因的组合物、试剂盒和应用,涉及生物学检测的技术领域。该组合物包含上游引物、下游引物和探针,上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,且探针为3’端阻断的寡聚核苷酸,非末端位置还含有核酸内切酶nfo识别位点;探针的5’端标记第一标记物,下游引物的5’端标记第二标记物,第一标记物和第二标记物与不同的分子特异性结合。该基于RPA检测mcr‑1基因的组合物和试剂盒简化了mcr‑1基因的检测方法,且具有良好的灵敏度和特异性。
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