基于SplintR连接酶触发的磁珠表面原位滚环扩增的microRNA检测方法

    公开(公告)号:CN116479091A

    公开(公告)日:2023-07-25

    申请号:CN202310354767.3

    申请日:2023-04-04

    IPC分类号: C12Q1/682

    摘要: 本发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种基于SplintR连接酶触发的磁珠表面原位滚环扩增的microRNA检测方法。包括以下步骤:S1:寡核苷酸DNA单链P1、P2在SplintR连接酶的作用下与靶标microRNA形成P1‑P2‑miRNA双链复合物,再通过加热变性使得双链复合物释放成P1‑P2单链和microRNA;S2:链霉亲和素修饰的磁珠吸附富集P1‑P2单链;S3:磁珠表面进行原位滚环扩增,原位滚环扩增将P2段作为RCA反应引物序列;S4:荧光检测。本发明方法通过靶标microRNA支架连接两条单链DNA,结合磁珠表面原位RCA实现microRNA的单碱基错配识别,达到高特异、高灵敏、快速检测。

    一种利用3D条形码的DNA分子检测方法

    公开(公告)号:CN111926063B

    公开(公告)日:2021-03-23

    申请号:CN202010851879.6

    申请日:2020-08-21

    IPC分类号: C12Q1/682 C12Q1/683

    摘要: 本发明具体涉及一种利用3D条形码的DNA分子检测方法,属于基因诊断技术领域,所述检测方法具体为,根据待测DNA序列设计DNA单链环C1和DNA单链L2,DNA单链L2两端序列与DNA单链环C1的一段序列全部杂交,连接DNA单链L2两端序列缺口,形成DNA单链双环C1C2,再与3D条形码上的探针杂交连接,待测DNA与DNA单链双环C1C2杂交,得到的部分双链DNA上具有限制性酶切位点,通过限制性内切酶切割双链DNA释放拓扑结构,在3D条形码表面进行固相RCA反应,最后进行荧光解码。本发明的DNA分子检测方法可以实现DNA单碱基突变的检测,检测灵敏度高、特异性强,最低能检测到0.1%的突变。

    一种基于DNA互锁结构的DNA分子检测方法

    公开(公告)号:CN111926062B

    公开(公告)日:2021-03-23

    申请号:CN202010850525.X

    申请日:2020-08-21

    IPC分类号: C12Q1/682 C12Q1/683

    摘要: 本发明具体涉及一种基于DNA互锁结构的DNA分子检测方法,属于基因诊断技术领域,所述检测方法为,根据待测DNA序列设计DNA单链环C1和DNA单链L2,DNA单链L2两端序列与DNA单链环C1的一段序列全部杂交,形成DNA单链双环C1C2,再与待测DNA杂交形成部分双链DNA,通过限制性内切酶切割双链DNA释放拓扑结构,以C1为模板进行RCA反应,在RCA反应产物基础上进行支链RCA反应,最后检测反应产物。本发明的DNA分子检测方法操作简单,对待测DNA具有高特异性,通过支链RCA反应放大检测信号,可以应用于背景复杂、含量低的DNA分子溶液的检测。

    一种利用3D条形码的DNA分子检测方法

    公开(公告)号:CN111926063A

    公开(公告)日:2020-11-13

    申请号:CN202010851879.6

    申请日:2020-08-21

    IPC分类号: C12Q1/682 C12Q1/683

    摘要: 本发明具体涉及一种利用3D条形码的DNA分子检测方法,属于基因诊断技术领域,所述检测方法具体为,根据待测DNA序列设计DNA单链环C1和DNA单链L2,DNA单链L2两端序列与DNA单链环C1的一段序列全部杂交,连接DNA单链L2两端序列缺口,形成DNA单链双环C1C2,再与3D条形码上的探针杂交连接,待测DNA与DNA单链双环C1C2杂交,得到的部分双链DNA上具有限制性酶切位点,通过限制性内切酶切割双链DNA释放拓扑结构,在3D条形码表面进行固相RCA反应,最后进行荧光解码。本发明的DNA分子检测方法可以实现DNA单碱基突变的检测,检测灵敏度高、特异性强,最低能检测到0.1%的突变。

    一种基于3D DNA纳米网状结构双信号放大技术的microRNA检测方法

    公开(公告)号:CN111187806A

    公开(公告)日:2020-05-22

    申请号:CN202010022659.2

    申请日:2020-01-09

    IPC分类号: C12Q1/682 C12Q1/6825

    摘要: 本发明涉及一种基于3D DNA纳米网状结构双信号放大技术的microRNA检测方法,本发明基于靶标自循环的催化发卡自组装与3D DNA纳米网结构的整合,构建了一个双信号放大技术的电化学生物传感器。设计的两个发卡序列一旦被靶标启动,即可形成热力学稳定的杂交双链体结构,同时释放靶标进入下一个循环。该过程成功将靶标转换为更加稳定的结构,从而达到第一次信号放大的目的。随后引入了一个3D DNA纳米网结构,该结构由三条DNA序列杂交形成的X型DNA结构通过T4连接酶连接而成。3D DNA纳米网结构可与上述反应形成的双链体结构杂交,从而实现第二次信号放大。具有检测灵敏度高、检测特异性好等优点。