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公开(公告)号:CN110910959A
公开(公告)日:2020-03-24
申请号:CN201911068002.3
申请日:2019-11-04
申请人: 中国水稻研究所
摘要: 本发明提供了一种群体遗传进化图谱及其构建方法。该构建方法包括选择重组冷点区域;利用重组冷点区域的SNP位点构建系统进化树;对系统进化树进行聚类分析,确定物种之间的演化关系,从而获得群体遗传进化图谱。通过选取重组冷点区域(如着丝粒区域)的SNP位点进行系统进化树的构建,一方面由于重组发生率低,在亲本与子代之间稳定遗传,因而遗传进化关系明确,使得构建的系统进化树更准确,另一方面所选用的序列中SNP位点的数量相比全基因组序列的少,又较单倍型分析法中的SNP位点多和全面。因而,能够实现快速准确地构建系统进化树。
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公开(公告)号:CN110910959B
公开(公告)日:2022-08-30
申请号:CN201911068002.3
申请日:2019-11-04
申请人: 中国水稻研究所
摘要: 本发明提供了一种群体遗传进化图谱及其构建方法。该构建方法包括选择重组冷点区域;利用重组冷点区域的SNP位点构建系统进化树;对系统进化树进行聚类分析,确定物种之间的演化关系,从而获得群体遗传进化图谱。通过选取重组冷点区域(如着丝粒区域)的SNP位点进行系统进化树的构建,一方面由于重组发生率低,在亲本与子代之间稳定遗传,因而遗传进化关系明确,使得构建的系统进化树更准确,另一方面所选用的序列中SNP位点的数量相比全基因组序列的少,又较单倍型分析法中的SNP位点多和全面。因而,能够实现快速准确地构建系统进化树。
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公开(公告)号:CN113396818B
公开(公告)日:2022-05-27
申请号:CN202110696444.3
申请日:2021-06-23
申请人: 中国水稻研究所
摘要: 本发明公开了一种利用多倍体杂种优势的植物育种方法。该方法包括以下步骤:S1,利用技术手段突变MiMe关键基因,筛选基因座位均为杂合的株系,创制出杂合MiMe材料;S2,杂合MiMe材料与其它品系杂交,后代中再分离新的杂合MiMe株系,实现转移MiMe策略目的;S3,杂合MiMe材料自交分离,筛选遗传背景重组的纯合MiMe材料;S4,通过扳分蘖、茎节培养、花药培养等无性繁殖的方式,扩繁具有多倍体杂种优势的纯合MiMe,大量繁种,并通过Fix诱导保存纯合MiMe;以及S5,纯合MiMe材料自交加倍,产生具有杂种优势的多倍体育种材料。应用本发明的技术方案,将多倍体育种与杂种优势结合,解决多倍体杂种优势利用必须依赖于多倍体诱导和每代杂交制种的问题,提供一种简洁高效的多倍体杂种优势的植物育种方法。
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公开(公告)号:CN113396818A
公开(公告)日:2021-09-17
申请号:CN202110696444.3
申请日:2021-06-23
申请人: 中国水稻研究所
摘要: 本发明公开了一种利用多倍体杂种优势的植物育种方法。该方法包括以下步骤:S1,利用技术手段突变MiMe关键基因,筛选基因座位均为杂合的株系,创制出杂合MiMe材料;S2,杂合MiMe材料与其它品系杂交,后代中再分离新的杂合MiMe株系,实现转移MiMe策略目的;S3,杂合MiMe材料自交分离,筛选遗传背景重组的纯合MiMe材料;S4,通过扳分蘖、茎节培养、花药培养等无性繁殖的方式,扩繁具有多倍体杂种优势的纯合MiMe,大量繁种,并通过Fix诱导保存纯合MiMe;以及S5,纯合MiMe材料自交加倍,产生具有杂种优势的多倍体育种材料。应用本发明的技术方案,将多倍体育种与杂种优势结合,解决多倍体杂种优势利用必须依赖于多倍体诱导和每代杂交制种的问题,提供一种简洁高效的多倍体杂种优势的植物育种方法。
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公开(公告)号:CN110600079B
公开(公告)日:2021-12-10
申请号:CN201910741623.7
申请日:2019-08-12
申请人: 中国水稻研究所
IPC分类号: G16B30/10
摘要: 本发明提供了一种转基因鉴定方法和鉴定装置。该鉴定方法包括:获取待鉴定样本的待测数据、待鉴定样本的载体序列和宿主基因组序列;将所述宿主基因组序列与所述待鉴定样本的载体序列进行同源性比对,并在所述待鉴定样本的载体序列上标记与所述宿主基因组序列同源的区域,得到标记区域;将所述待测数据与所述待鉴定样本的载体序列进行比对,得到多个候选外源DNA片段;从多个所述候选外源DNA片段中去除含有所述标记区域的片段,得到外源DNA片段。通过对待鉴定样本的载体序列上的同源性区域进行标记,以便从比对得到的多个候选外源DNA片段中去除标记的区域,从而排除假阳性错误,因此该鉴定方法操作简单且准确性高。
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公开(公告)号:CN110600079A
公开(公告)日:2019-12-20
申请号:CN201910741623.7
申请日:2019-08-12
申请人: 中国水稻研究所
IPC分类号: G16B30/10
摘要: 本发明提供了一种转基因鉴定方法和鉴定装置。该鉴定方法包括:获取待鉴定样本的待测数据、待鉴定样本的载体序列和宿主基因组序列;将所述宿主基因组序列与所述待鉴定样本的载体序列进行同源性比对,并在所述待鉴定样本的载体序列上标记与所述宿主基因组序列同源的区域,得到标记区域;将所述待测数据与所述待鉴定样本的载体序列进行比对,得到多个候选外源DNA片段;从多个所述候选外源DNA片段中去除含有所述标记区域的片段,得到外源DNA片段。通过对待鉴定样本的载体序列上的同源性区域进行标记,以便从比对得到的多个候选外源DNA片段中去除标记的区域,从而排除假阳性错误,因此该鉴定方法操作简单且准确性高。
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公开(公告)号:CN105543196A
公开(公告)日:2016-05-04
申请号:CN201610115904.8
申请日:2016-03-01
申请人: 中国水稻研究所
CPC分类号: C12N9/22 , C12N15/102 , C12N15/63 , C12N2310/10 , C12N2310/12 , C12N2800/80 , C12N2810/10
摘要: 本发明公开了一种植物Cas9变体蛋白VRER,该蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID No:2所示。本发明还同时公开了植物Cas9变体基因VRER,该基因编码植物Cas9变体蛋白VRER,所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明还同时公开了包含上述基因的重组表达载体。植物Cas9变体蛋白VRER的用途是:能够在PAM区为5’-NGCG-3’的情况下实现基因组编辑功能。
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公开(公告)号:CN105543195A
公开(公告)日:2016-05-04
申请号:CN201610113183.7
申请日:2016-03-01
申请人: 中国水稻研究所
CPC分类号: C12N9/22 , C12N15/102 , C12N15/63 , C12N2310/10 , C12N2310/12 , C12N2800/80 , C12N2810/10
摘要: 本发明公开了一种植物Cas9变体蛋白VQR,该蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID No:2所示。本发明还同时公开了植物Cas9变体基因VQR,该基因编码植物Cas9变体蛋白VQR,所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明还同时公开了包含上述基因的重组表达载体。本发明的植物Cas9变体蛋白VQR的用途是:能够在PAM区为5’-NGA-3’的情况下实现基因组编辑功能。
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