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公开(公告)号：CN118360330B
公开(公告)日：2024-10-11
申请号：CN202410798459.4
申请日：2024-06-20
申请人： 三亚中国农业科学院国家南繁研究院 , 中国水稻研究所
摘要： 本发明属于生物技术和植物育种领域，具体涉及一种利用基因编辑创制无融合生殖体系，从而固定水稻杂种优势的方法。本发明的技术方案主要分为载体构建、遗传转化、倍性与基因型鉴定和结果检测步骤。本发明提供的技术是通过基因编辑手段直接敲除水稻四个内源基因从而获得了高结实率的水稻无融合生殖体系，为水稻无融合生殖体系构建提供了新的思路；更为水稻无融合生殖固定杂种优势提供了新的解决方案，可较大提升农业生产的效率和质量，具有一定的经济价值和广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN116403641A
公开(公告)日：2023-07-07
申请号：CN202211337857.3
申请日：2022-10-28
申请人： 中国水稻研究所
摘要： 本发明提供了一种碱基测序错误的排除方法、低频率突变的鉴定方法及相关装置。其中，该排除方法包括获取双端测序数据中的正向读段和反向读段，并分别在每对正向读段和反向读段的5'端各截取15～25bp，形成测序错误排除序列对；根据测序错误排除序列对对每个读段对进行分簇，读段对为正向读段和反向读段配对获得的数据，将具有相同测序错误排除序列对的读段对归类分组，获得多个序列簇；对每个序列簇中的所有读段对进行一致性序列比对，从而获得一致性序列，一致性序列即为排除了碱基测序错误后的序列。能够解决现有技术中高通量测序易产生测序错误而难以检测低频突变的问题，适用于基因检测领域。
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公开(公告)号：CN110600079B
公开(公告)日：2021-12-10
申请号：CN201910741623.7
申请日：2019-08-12
申请人： 中国水稻研究所
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明提供了一种转基因鉴定方法和鉴定装置。该鉴定方法包括：获取待鉴定样本的待测数据、待鉴定样本的载体序列和宿主基因组序列；将所述宿主基因组序列与所述待鉴定样本的载体序列进行同源性比对，并在所述待鉴定样本的载体序列上标记与所述宿主基因组序列同源的区域，得到标记区域；将所述待测数据与所述待鉴定样本的载体序列进行比对，得到多个候选外源DNA片段；从多个所述候选外源DNA片段中去除含有所述标记区域的片段，得到外源DNA片段。通过对待鉴定样本的载体序列上的同源性区域进行标记，以便从比对得到的多个候选外源DNA片段中去除标记的区域，从而排除假阳性错误，因此该鉴定方法操作简单且准确性高。
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公开(公告)号：CN108753813B
公开(公告)日：2021-08-24
申请号：CN201810590142.6
申请日：2018-06-08
申请人： 中国水稻研究所
摘要： 本发明公开了一种获得无标记转基因植物的方法。该方法通过CRISPR/Cas9或CRISPR/Cpf1系统实现，CRISPR/Cas9或CRISPR/Cpf1系统的载体中包含基因编辑蛋白基因、靶向载体自身的sgRNA和特异时空表达基因启动子，特异时空表达基因启动子在愈伤组织时期不表达，待完成遗传转化后表达基因编辑蛋白基因。应用本发明的技术方案，操作简单，主要针对农作物或经济植物，尤其是多年生，无性繁殖的植物，通过剪切载体本身，产生大片段转基因成分的丢失，意义重大。
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公开(公告)号：CN108728484B
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN201810590138.X
申请日：2018-06-08
申请人： 中国水稻研究所
摘要： 本发明公开了一种用于获得无标记转基因植物的载体及其应用。其中，该载体包含基因编辑蛋白基因、靶向载体自身的sgRNA和特异时空表达基因启动子，特异时空表达基因启动子在愈伤组织时期不表达，待完成遗传转化后表达基因编辑蛋白基因。应用本发明的技术方案，主要针对农作物或经济植物，尤其是多年生，无性繁殖的植物，通过剪切载体本身，产生大片段转基因成分的丢失，意义重大。
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公开(公告)号：CN108728479B
公开(公告)日：2021-03-02
申请号：CN201810355193.0
申请日：2018-04-19
申请人： 中国水稻研究所
摘要： 本发明公开了一种获得丧失遗传干涉的水稻突变体的方法及其应用。其中，该方法包括以下步骤：采用基因工程手段使ZEP1蛋白的前350个氨基酸不表达或者蛋白活性/功能丧失。应用本发明的技术方案，改造水稻ZEP1基因，改造后的植株雄性不育，雌性可育，改造后的水稻植株可用于杂交育种，由于经过改造的水稻细胞核不育，当其用于育种时，不需要配套的保持系，又因为改造之后的水稻的遗传干涉丧失，也可以用作育种的中间材料，加快染色体片段的交换，提高育种效率。
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公开(公告)号：CN110600079A
公开(公告)日：2019-12-20
申请号：CN201910741623.7
申请日：2019-08-12
申请人： 中国水稻研究所
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明提供了一种转基因鉴定方法和鉴定装置。该鉴定方法包括：获取待鉴定样本的待测数据、待鉴定样本的载体序列和宿主基因组序列；将所述宿主基因组序列与所述待鉴定样本的载体序列进行同源性比对，并在所述待鉴定样本的载体序列上标记与所述宿主基因组序列同源的区域，得到标记区域；将所述待测数据与所述待鉴定样本的载体序列进行比对，得到多个候选外源DNA片段；从多个所述候选外源DNA片段中去除含有所述标记区域的片段，得到外源DNA片段。通过对待鉴定样本的载体序列上的同源性区域进行标记，以便从比对得到的多个候选外源DNA片段中去除标记的区域，从而排除假阳性错误，因此该鉴定方法操作简单且准确性高。
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公开(公告)号：CN108728484A
公开(公告)日：2018-11-02
申请号：CN201810590138.X
申请日：2018-06-08
申请人： 中国水稻研究所
摘要： 本发明公开了一种用于获得无标记转基因植物的载体及其应用。其中，该载体包含基因编辑蛋白基因、靶向载体自身的sgRNA和特异时空表达基因启动子，特异时空表达基因启动子在愈伤组织时期不表达，待完成遗传转化后表达基因编辑蛋白基因。应用本发明的技术方案，主要针对农作物或经济植物，尤其是多年生，无性繁殖的植物，通过剪切载体本身，产生大片段转基因成分的丢失，意义重大。
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公开(公告)号：CN106319045A
公开(公告)日：2017-01-11
申请号：CN201610695151.2
申请日：2016-08-19
申请人： 中国水稻研究所
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： 本发明公开了一种ACT-PCR筛选基因编辑产物的方法，包括如下步骤：1)、提取野生型及待测样品的基因组DNA；2)、设计引物：使正向引物FA的3’末端跨过基因编辑拟切割位点；反向引物RA是以目标基因的基因组序列为参照，位于互补链的下游，反向引物RA的Tm值不低于正向引物FA；3)、获得最大临界退火温度Tam和最小临界退火温度Tlm；4)、利用引物对FA/RA以基因组DNA为模板、设定退火温为Tlm
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公开(公告)号：CN105543196A
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201610115904.8
申请日：2016-03-01
申请人： 中国水稻研究所
CPC分类号： C12N9/22 , C12N15/102 , C12N15/63 , C12N2310/10 , C12N2310/12 , C12N2800/80 , C12N2810/10
摘要： 本发明公开了一种植物Cas9变体蛋白VRER，该蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID No：2所示。本发明还同时公开了植物Cas9变体基因VRER，该基因编码植物Cas9变体蛋白VRER，所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示。本发明还同时公开了包含上述基因的重组表达载体。植物Cas9变体蛋白VRER的用途是：能够在PAM区为5’-NGCG-3’的情况下实现基因组编辑功能。
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