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    一种筛选肿瘤抗原特异性TCR序列的方法
    2.
    发明公开
    一种筛选肿瘤抗原特异性TCR序列的方法 审中-实审

    公开(公告)号：CN113249326A

    公开(公告)日：2021-08-13

    申请号：CN202110416319.2

    申请日：2021-04-19

    申请人： 佛山市第一人民医院(中山大学附属佛山医院)

    发明人： 罗微 ,  毛晓帆 ,  余思菲 ,  林凯容 ,  张贝莹 ,  张楚凌 ,  官展文 ,  金亚彬

    IPC分类号： C12N5/09 ,  C12Q1/6886 ,  G16B25/10 ,  G16B30/10

    摘要： 本发明公开了一种筛选肿瘤抗原特异性TCR序列的方法，包括步骤：1)处理肿瘤组织，获取细胞悬液；2)单细胞转录组测序；3)测序所得数据转换成细胞‑基因的表达矩阵；4)标准化整合表达矩阵的数据并进行细胞分群，筛选同时高表达肿瘤标签基因与T细胞标签基因的目标细胞；5)获取步骤4)所得目标细胞的TCR基因序列。单细胞转录组测序技术过程中会出现两个或以上细胞进入一个反应体系的情况，这时测序结果会显示只有一个细胞，而实质是两个或多个细胞，这种情况被称作双/多胞体。当肿瘤细胞与T细胞特异性结合时，也会产生双/多胞体。利用该现象可筛选出同时表达了肿瘤标签基因与T细胞标签基因的目标细胞，进而提取TCR序列。

    一种肿瘤抗原特异性TCR序列的筛选方法
    3.
    发明公开
    一种肿瘤抗原特异性TCR序列的筛选方法 审中-实审

    公开(公告)号：CN116377041A

    公开(公告)日：2023-07-04

    申请号：CN202210922411.0

    申请日：2022-08-02

    申请人： 佛山市第一人民医院(中山大学附属佛山医院)

    发明人： 罗微 ,  毛晓帆 ,  官展文 ,  余思菲

    IPC分类号： C12Q1/6869 ,  G16B30/00 ,  G16B40/30

    摘要： 本发明提供了一种肿瘤抗原特异性TCR序列的筛选方法。所述筛选方法包括步骤：获取同源的肿瘤组织和转移淋巴结组织；制备单细胞悬液，进行转录组建库、VDJ建库及测序，从测序结果中选取第一备选TCR序列集合和第二备选TCR序列集合；同时满足第一备选TCR序列集合和第二备选TCR序列集合的即为所述肿瘤抗原特异性TCR序列。所述方法针对每例患者，在其肿瘤抗原未知的情况下，筛选出其肿瘤抗原特异性TCR序列，通过人工合成该肿瘤抗原特异性TCR的片段并插入患者外周血杀伤性T细胞中，使得外周血T细胞具有杀伤肿瘤的能力，经过体外扩增后回输给患者以杀伤肿瘤。