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公开(公告)号：CN110675914B
公开(公告)日：2024-01-26
申请号：CN201910876889.2
申请日：2019-09-17
IPC分类号： G16B25/10 , G16B50/00 , G06F18/23 , G01N33/569 , C12Q1/6869
摘要： 本公开提供了一种筛选肿瘤特异性T细胞及TCR的方法，具体步骤为：(1)首先将肿瘤组织进行浸润单细胞消化分离；(2)然后从分离的单细胞中流式分选出CD3+T细胞；(3)利用免疫磁珠去除流式分选出CD3+T细胞中的死细胞；(4)将去除死细胞后的CD3+T细胞进行单细胞转录组建库、VDJ建库及测序；(5)将测序后的数据进行分析，然后筛选肿瘤特异CD8+T细胞及TCR。所述方法针对每个未知抗原的样本，能够在其肿瘤抗原未知的情况下，筛选出其肿瘤特异性T细胞及TCR。
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公开(公告)号：CN108588221A
公开(公告)日：2018-09-28
申请号：CN201810415086.2
申请日：2018-05-03
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/113 , C12N15/867 , C12N7/01 , A61K31/7088 , A61P35/00
摘要： 本发明提供了STIL基因的用途及其相关药物。公开了STIL基因在制备鼻咽癌辅助诊断或鼻咽癌治疗/预后评估的试剂或试剂盒中的应用。还进一步公开了STIL基因小分子干扰RNA靶标片段、STIL基因小分子干扰RNA、STIL基因的RNA干扰核酸构建体、STIL基因干扰慢病毒、药物组合物以及RNA干扰慢病毒载体的构建方法。本发明提供的siRNA或者包含该siRNA序列的核酸构建体、慢病毒能够特异性抑制STIL基因的表达，尤其是慢病毒，能够高效侵染靶细胞，高效率地抑制靶细胞中STIL基因的表达，进而抑制肿瘤细胞的生长，促进肿瘤细胞凋亡，在肿瘤治疗中具有重要意义。
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公开(公告)号：CN113249326A
公开(公告)日：2021-08-13
申请号：CN202110416319.2
申请日：2021-04-19
IPC分类号： C12N5/09 , C12Q1/6886 , G16B25/10 , G16B30/10
摘要： 本发明公开了一种筛选肿瘤抗原特异性TCR序列的方法，包括步骤：1)处理肿瘤组织，获取细胞悬液；2)单细胞转录组测序；3)测序所得数据转换成细胞‑基因的表达矩阵；4)标准化整合表达矩阵的数据并进行细胞分群，筛选同时高表达肿瘤标签基因与T细胞标签基因的目标细胞；5)获取步骤4)所得目标细胞的TCR基因序列。单细胞转录组测序技术过程中会出现两个或以上细胞进入一个反应体系的情况，这时测序结果会显示只有一个细胞，而实质是两个或多个细胞，这种情况被称作双/多胞体。当肿瘤细胞与T细胞特异性结合时，也会产生双/多胞体。利用该现象可筛选出同时表达了肿瘤标签基因与T细胞标签基因的目标细胞，进而提取TCR序列。
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公开(公告)号：CN108588221B
公开(公告)日：2021-08-24
申请号：CN201810415086.2
申请日：2018-05-03
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/113 , C12N15/867 , C12N7/01 , A61K31/7088 , A61P35/00
摘要： 本发明提供了STIL基因的用途及其相关药物。公开了STIL基因在制备鼻咽癌辅助诊断或鼻咽癌治疗/预后评估的试剂或试剂盒中的应用。还进一步公开了STIL基因小分子干扰RNA靶标片段、STIL基因小分子干扰RNA、STIL基因的RNA干扰核酸构建体、STIL基因干扰慢病毒、药物组合物以及RNA干扰慢病毒载体的构建方法。本发明提供的siRNA或者包含该siRNA序列的核酸构建体、慢病毒能够特异性抑制STIL基因的表达，尤其是慢病毒，能够高效侵染靶细胞，高效率地抑制靶细胞中STIL基因的表达，进而抑制肿瘤细胞的生长，促进肿瘤细胞凋亡，在肿瘤治疗中具有重要意义。
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公开(公告)号：CN108707665A
公开(公告)日：2018-10-26
申请号：CN201810424633.3
申请日：2018-05-07
IPC分类号： C12Q1/6886
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/158
摘要： 本发明公开了一种用于鼻咽癌诊断的标志物，该组标志物包括TCRBV5.4、TCRBV6.3、TCRBV6.4、TCRBV6.6、TCRBV6.7、TCRBV7.9、TCRBV8.1、TCRBV10.2、TCRBV10.3、TCRBV12.3、TCRBV12.4、TCRBV15、TCRBV20.1、TCRBV22、TCRBV25.1，并通过LASSO模型构建了鼻咽癌诊断公式，得到了根据这些TCR基因预测鼻咽癌的方法，经过ROC检测，诊断公式在测试组中的AUC值达到0.96，当灵敏度为0.95时，特异性为0.86；在验证组中的AUC值为0.74，当灵敏度为0.79时，特异性为0.75，诊断效能良好。
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公开(公告)号：CN115521978A
公开(公告)日：2022-12-27
申请号：CN202211315711.9
申请日：2022-10-26
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6886 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种第三代测序分子标签、测序方法及应用。所述第三代测序分子标签使得第三代测序技术完成测序之后可以根据标签序列和比对位置回溯到原始DNA，通过比对来源于同一DNA的多条序列的共同序列(consensus)来甄别突变是真实的还是引入的随机错误，并且可以根据UMI序列实现对测序基因的表达量的进行绝对定量。所述第三代测序分子标签和测序方法可以应用于检测肿瘤细胞基因的可变剪切体和/或抗原位点。
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公开(公告)号：CN108707665B
公开(公告)日：2022-03-22
申请号：CN201810424633.3
申请日：2018-05-07
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明公开了一种用于鼻咽癌诊断的标志物，该组标志物包括TCRBV5.4、TCRBV6.3、TCRBV6.4、TCRBV6.6、TCRBV6.7、TCRBV7.9、TCRBV8.1、TCRBV10.2、TCRBV10.3、TCRBV12.3、TCRBV12.4、TCRBV15、TCRBV20.1、TCRBV22、TCRBV25.1，并通过LASSO模型构建了鼻咽癌诊断公式，得到了根据这些TCR基因预测鼻咽癌的方法，经过ROC检测，诊断公式在测试组中的AUC值达到0.96，当灵敏度为0.95时，特异性为0.86；在验证组中的AUC值为0.74，当灵敏度为0.79时，特异性为0.75，诊断效能良好。
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公开(公告)号：CN112521484A
公开(公告)日：2021-03-19
申请号：CN202011393657.0
申请日：2020-12-03
IPC分类号： C07K14/725 , G01N33/574
摘要： 本发明提供了结肠癌肿瘤特异TCR序列及其应用，所述结肠癌肿瘤特异TCR序列包括9个序列。结肠癌肿瘤特异TCR序列在制备辅助诊断或结肠癌治疗或预后评估结肠癌的试剂或试剂盒中的应用，所述结肠癌肿瘤特异TCR去识别结肠癌的共同抗原后，T细胞增殖且针对结肠癌肿瘤发挥特异性杀伤作用，能够准确的识别结肠癌肿瘤，从而达到治疗或诊断的效果。
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公开(公告)号：CN110675914A
公开(公告)日：2020-01-10
申请号：CN201910876889.2
申请日：2019-09-17
IPC分类号： G16B25/10 , G16B50/00 , G06K9/62 , G01N33/569 , C12Q1/6869
摘要： 本公开提供了一种筛选肿瘤特异性T细胞及TCR的方法，具体步骤为：(1)首先将肿瘤组织进行浸润单细胞消化分离；(2)然后从分离的单细胞中流式分选出CD3+T细胞；(3)利用免疫磁珠去除流式分选出CD3+T细胞中的死细胞；(4)将去除死细胞后的CD3+T细胞进行单细胞转录组建库、VDJ建库及测序；(5)将测序后的数据进行分析，然后筛选肿瘤特异CD8+T细胞及TCR。所述方法针对每个未知抗原的样本，能够在其肿瘤抗原未知的情况下，筛选出其肿瘤特异性T细胞及TCR。
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公开(公告)号：CN108624667A
公开(公告)日：2018-10-09
申请号：CN201810461908.0
申请日：2018-05-15
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 本公开公开了一种基于二代测序的T细胞受体库分析方法及装置，针对5'RACE扩增TCR库的方法，设计的一套一体化、操作简便的TCR库分析方法，通过perl程序语言调用序列比对工具blat为内核与参考序列进行序列比对，基于TCR基因的参考坐标，注释比对结果，输出内容包含了当前TCR库分析中公认的各类指标，使得非生物信息专业人员可也以快速的得到样本TCR库的分析结果。
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