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公开(公告)号：CN112626189A
公开(公告)日：2021-04-09
申请号：CN202010334969.8
申请日：2020-04-24
申请人： 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 苏州吉因加生物医学工程有限公司
IPC分类号： C12Q1/6876 , C12N15/11 , C40B40/06 , C40B50/06 , C12Q1/6869
摘要： 本发明提供的一种基因测序仪的短接头、双index接头引物和双index建库体系，短接头包括两条部分互补的接头寡核苷酸链：接头寡核苷酸链1，由5’端到3’端依次包括index2引物结合区、正义接头互补区、正义分子标签和1个突出的碱基T；接头寡核苷酸链2，由5’端到3’端依次包括反义分子标签、反义接头互补区和index1引物结合区。使用上述短接头构建的双index文库体系的片段转化效率、index组合间扩增效率均一性、捕获效率均一性以及数据产量稳定性方面均显著优于现有的双index文库体系。
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公开(公告)号：CN112538657A
公开(公告)日：2021-03-23
申请号：CN202011565077.5
申请日：2020-12-25
申请人： 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C40B50/06 , C12Q1/6874
摘要： 一种脑脊液基因测序建库、检测方法及其应用，该建库方法具体是通过对脑脊液的待测样本进行cfDNA提取，并采用Labchip GX Touch对其进行片段浓度检测，从而确定构建文库的PCR循环数，以满足扩增的需求；再采用浓度至少为20μmol/L的PCR扩增引物浓度进行富集扩增，以提高建库成功率。
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公开(公告)号：CN112538657B
公开(公告)日：2021-08-17
申请号：CN202011565077.5
申请日：2020-12-25
申请人： 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C40B50/06 , C12Q1/6874
摘要： 一种脑脊液基因测序建库、检测方法及其应用，该建库方法具体是通过对脑脊液的待测样本进行cfDNA提取，并采用Labchip GX Touch对其进行片段浓度检测，从而确定构建文库的PCR循环数，以满足扩增的需求；再采用浓度至少为20μmol/L的PCR扩增引物浓度进行富集扩增，以提高建库成功率。
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公开(公告)号：CN112614548B
公开(公告)日：2021-08-03
申请号：CN202011560739.X
申请日：2020-12-25
申请人： 北京吉因加医学检验实验室有限公司
摘要： 一种计算样本建库投入量的方法及其建库方法，算样本建库投入量的的方法包括：根据如下公式计算样本建库投入量Input：Input＝Z*(X/Y)…(I)，其中，Z为投入系数，X为样本中m1bp～m2bp片段的面积积分值，Y为m3bp～m4bp片段的面积积分值，m1＜m2，m3＜m4，m2＞m4。通过提高建库投入量，将cfDNA的投入比例提高，避免了片段筛选带来的丢失，提高了cfDNA检测的准确性。
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公开(公告)号：CN112614548A
公开(公告)日：2021-04-06
申请号：CN202011560739.X
申请日：2020-12-25
申请人： 北京吉因加医学检验实验室有限公司
摘要： 一种计算样本建库投入量的方法及其建库方法，算样本建库投入量的的方法包括：根据如下公式计算样本建库投入量Input：Input＝Z*(X/Y)…(I)，其中，Z为投入系数，X为样本中m1bp～m2bp片段的面积积分值，Y为m3bp～m4bp片段的面积积分值，m1＜m2，m3＜m4，m2＞m4。通过提高建库投入量，将cfDNA的投入比例提高，避免了片段筛选带来的丢失，提高了cfDNA检测的准确性。
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公开(公告)号：CN113943728B
公开(公告)日：2022-12-09
申请号：CN202111498969.2
申请日：2021-12-09
申请人： 苏州吉因加医学检验有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12N15/10
摘要： 一种核酸纯化方法，包括：一次纯化步骤，包括将第一磁珠与待测样本混合，磁性分离，取第一上清液，备用；二次纯化步骤，将第一上清液与第二磁珠混合，磁性分离，弃去第二上清液，得到结合有靶核酸分子的磁珠。本发明进行两轮磁珠纯化，污染程度不同的样本，两轮磁珠用量不同，第一轮磁珠可以结合分子量较大的DNA，通过丢弃磁珠去除这部分产物；第二轮磁珠结合剩余产物中所有DNA，达到去除大片段，保留目的片段的目的。
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公开(公告)号：CN114317528A
公开(公告)日：2022-04-12
申请号：CN202011061421.7
申请日：2020-09-30
申请人： 北京吉因加科技有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12N15/11 , C40B50/06 , C40B40/06 , C12Q1/6869
摘要： 本发明涉及核酸测序技术领域，具体涉及一种特异分子标签UMI组、混合特异分子标签接头及应用，提供的特异分子标签UMI组包括：序列长度为5bp的第一特异分子标签UMI，序列长度为6bp的第二特异分子标签UMI，序列长度为7bp的第三特异分子标签UMI，和序列长度为8bp的第四特异分子标签。使用上述混合特异分子标签构建的双index文库可保证分子标签下游固定碱基对的碱基平衡，实现携带分子标签的文库在不混合平衡文库的情况下直接上机测序。同时，本发明提供的混合特异分子标签接头及配套的双index接头引物在不同分子标签接头连接均一性和不同index间扩增均一性方面亦显著优于现有的双index文库体系。
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公开(公告)号：CN114032288A
公开(公告)日：2022-02-11
申请号：CN202111503868.X
申请日：2021-12-10
申请人： 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806
摘要： 一种试剂盒及其制备测序用靶核苷酸的方法，试剂盒包含第一接头序列、第二接头序列、短寡核苷酸序列，第一接头序列的5’末端被腺苷酸化，所述第一接头序列的3’末端修饰有间隔子；从5’端到3’端，所述第一接头序列包含反义接头互补区、第一引物结合区；从5’端到3’端，所述第二接头序列包含第二引物结合区以及可与所述反义接头互补区反向互补配对的正义接头互补区；所述短寡核苷酸序列可与所述第一接头序列上靠近5’末端的部分序列反向互补配对。本发明提供了特殊设计的接头序列以及对接头的修饰，无接头二聚体产生，且降低了样本DNA片段的嵌合体形成。
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公开(公告)号：CN113249444B
公开(公告)日：2023-10-13
申请号：CN202110533156.6
申请日：2021-05-17
申请人： 苏州吉因加生物医学工程有限公司
IPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种用于与成纤维细胞生长因子受体(Fibroblast growth factor receptor，FGFR)1、2或3基因杂交的DNA探针库及应用，属于生物医药技术领域。本发明提供了一种用于与FGFR1、FGFR2或FGFR3基因杂交的DNA探针库，DNA探针包括SEQ ID NO.1‑186所列举的全部探针。本发明提供了一种利用DNA探针库富集FGFR1、FGFR2或FGFR3基因片段，并与下一代测序技术(NGS)结合检测相关融合变异的方法。使用本发明的基因富集方法和筛选得到的特定DNA探针库，应用下一代测序技术可以准确地获得FGFR1、FGFR2或FGFR3基因中的融合变异。具有检测通量大、准确性高、周期短、敏感性高的优点。
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公开(公告)号：CN113249444A
公开(公告)日：2021-08-13
申请号：CN202110533156.6
申请日：2021-05-17
申请人： 苏州吉因加生物医学工程有限公司
IPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种用于与成纤维细胞生长因子受体(Fibroblast growth factor receptor，FGFR)1、2或3基因杂交的DNA探针库及应用，属于生物医药技术领域。本发明提供了一种用于与FGFR1、FGFR2或FGFR3基因杂交的DNA探针库，DNA探针包括SEQ ID NO.1‑186所列举的全部探针。本发明提供了一种利用DNA探针库富集FGFR1、FGFR2或FGFR3基因片段，并与下一代测序技术(NGS)结合检测相关融合变异的方法。使用本发明的基因富集方法和筛选得到的特定DNA探针库，应用下一代测序技术可以准确地获得FGFR1、FGFR2或FGFR3基因中的融合变异。具有检测通量大、准确性高、周期短、敏感性高的优点。
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