一种InDel分子标记组合及其引物和在鉴定湖北省恩施黄牛品种上的应用

    公开(公告)号:CN115354082A

    公开(公告)日:2022-11-18

    申请号:CN202210238245.2

    申请日:2022-03-11

    Abstract: 本发明公开了一种InDel分子标记组合及其引物和在鉴定湖北省恩施黄牛品种上的应用,该分子标记组合包括4个InDel分子标记,分别为InDel_2位于牛第1号染色体88012237bp处,其核苷酸序列为TAAGA;InDel_4位于牛第11号染色体59170765bp处,其核苷酸序列为G;InDel_8位于牛第8号染色体29286667bp处,其核苷酸序列为G;InDel_14位于牛第2号染色体15978630bp处,其核苷酸序列为AGC。该分子标记组合可以作为鉴定现有牛品种血统的有效靶点,用于鉴别湖北省恩施黄牛与国外牛品种或含有国外牛品种血统的杂种牛,若符合上述特征则为湖北省恩施黄牛;若不符合则为国外牛品种或含有国外牛品种血统的杂种牛。该鉴别方法为牛品种的血统来源解析及后续的杂交改良提供必要资源和方法,鉴别方法简便、准确、有效。

    牛12K SV液相芯片及其设计方法和应用

    公开(公告)号:CN116144794B

    公开(公告)日:2023-12-19

    申请号:CN202310218543.X

    申请日:2023-03-09

    Abstract: 本发明提供了一种牛12KSV液相芯片及其设计方法和应用,芯片包含12506个SV变异位点,对应12506个用于探针设计的位点。设计方法具体包括如下步骤:S1,牛的二代全基因组测序数据的收集;S2,测序数据的质控和序列对比;S3,SV变异位点的鉴定及分型;S4,对所有的缺失型SV变异位点进行整合筛选;S5,根据所有候选位点进行SV液相芯片的定制。本发明芯片能够为牛的种质鉴定、选择育种等领域和其他研究提供较好的研究基础和数据支撑,并进一步降低牛基因组选择的成本,加快我国优质牛品种改良的遗传进展,具有较好的社会价值和推广价值。

    水牛的全基因组50K SNP芯片及其设计方法和应用

    公开(公告)号:CN116386717A

    公开(公告)日:2023-07-04

    申请号:CN202211592793.1

    申请日:2022-12-13

    Abstract: 本发明提供一种水牛的全基因组50K SNP芯片及其设计方法和应用,所用到的SNP分子标记主要来自于以下3类:第一类,根据已有文献或专利报道的具有重要经济功能的SNP位点;第二类,从检测到的SNP中筛选出的落在重要基因区域的SNP位点;第三类,来源于由2种以上选择信号支持并根据优先级顺序筛选出的一系列的SNP位点,三类总计得到50,000个SNP位点,在染色体上均匀分布。本发明芯片能够为水牛的种质鉴定、选择育种等领域和其他研究提供较好的研究基础和数据支撑,并进一步降低水牛基因组选择的成本,加快我国优质水牛品种改良的遗传进展,具有较好的社会价值和推广价值。

    牛12K SV液相芯片及其设计方法和应用

    公开(公告)号:CN116144794A

    公开(公告)日:2023-05-23

    申请号:CN202310218543.X

    申请日:2023-03-09

    Abstract: 本发明提供了一种牛12KSV液相芯片及其设计方法和应用,芯片包含12506个SV变异位点,对应12506个用于探针设计的位点。设计方法具体包括如下步骤:S1,牛的二代全基因组测序数据的收集;S2,测序数据的质控和序列对比;S3,SV变异位点的鉴定及分型;S4,对所有的缺失型SV变异位点进行整合筛选;S5,根据所有候选位点进行SV液相芯片的定制。本发明芯片能够为牛的种质鉴定、选择育种等领域和其他研究提供较好的研究基础和数据支撑,并进一步降低牛基因组选择的成本,加快我国优质牛品种改良的遗传进展,具有较好的社会价值和推广价值。

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