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公开(公告)号:CN118098347A
公开(公告)日:2024-05-28
申请号:CN202410054738.X
申请日:2024-01-15
Applicant: 华中农业大学
Abstract: 本发明提供了一种牛的23K甲基化芯片及其设计方法和应用,该甲基化芯片基因分型对象为包含23525个变异位点的甲基化变异位点组合,该甲基化芯片可以应用于牛基因组DNA甲基化修饰检测、环境对性状的表观调控机制解析、经济性状候选基因的定位、遗传多样性分析、种质资源评价与改良、全基因组关联分析以及全基因组选择育种等。本发明甲基化芯片能够为牛的DNA甲基化检测、表观修饰选择育种等领域和其他研究提供较好的研究基础和数据支撑,并进一步降低牛基因组甲基化检测的成本,加快我国优质牛品种改良的遗传进展,具有较好的社会价值和推广价值。
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公开(公告)号:CN116334275A
公开(公告)日:2023-06-27
申请号:CN202211606197.4
申请日:2022-12-14
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种桃疮痂病菌抗药性检测试剂,包括:快速提取样品基因组DNA的反应试剂,重组酶聚合酶扩增反应试剂,以及CRISPR/Cas12a反应试剂;所述重组酶聚合酶扩增反应试剂包括一对用于特异性扩增桃疮痂病菌抗药性基因片段的引物;所述CRISPR/Cas12a反应试剂包括一条检测桃疮痂病菌抗药性基因片段的CRISPR RNA和一条单链DNA探针,所述单链DNA探针带有荧光素标记和淬灭基团。本发明的桃疮痂病菌抗药性检测试剂用于检测桃疮痂病菌MBCs杀菌剂抗药性。本发明的桃疮痂病菌抗药性检测试剂具有反应快速、操作简便、灵敏度高、特异性好、观察简便等优点。
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公开(公告)号:CN115354082A
公开(公告)日:2022-11-18
申请号:CN202210238245.2
申请日:2022-03-11
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种InDel分子标记组合及其引物和在鉴定湖北省恩施黄牛品种上的应用,该分子标记组合包括4个InDel分子标记,分别为InDel_2位于牛第1号染色体88012237bp处,其核苷酸序列为TAAGA;InDel_4位于牛第11号染色体59170765bp处,其核苷酸序列为G;InDel_8位于牛第8号染色体29286667bp处,其核苷酸序列为G;InDel_14位于牛第2号染色体15978630bp处,其核苷酸序列为AGC。该分子标记组合可以作为鉴定现有牛品种血统的有效靶点,用于鉴别湖北省恩施黄牛与国外牛品种或含有国外牛品种血统的杂种牛,若符合上述特征则为湖北省恩施黄牛;若不符合则为国外牛品种或含有国外牛品种血统的杂种牛。该鉴别方法为牛品种的血统来源解析及后续的杂交改良提供必要资源和方法,鉴别方法简便、准确、有效。
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公开(公告)号:CN111455072B
公开(公告)日:2021-09-14
申请号:CN202010475390.3
申请日:2020-05-29
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了可用于鉴别瘤牛和普通牛血统的基因组序列如SEQ ID NO.1和2所示,可用于鉴别瘤牛和普通牛以及有助于后期牛品种纯繁、改良和保种工作实施,瘤牛缺失SEQ ID NO.1基因组序列,普通牛正常;本发明还公开了鉴别瘤牛和普通牛的分子生物学方法,包括:1)从待鉴定牛的组织中分离提取DNA;2)用正向引物(SEQ ID NO.3)和反向引物(SEQ ID NO.4)进行PCR扩增;3)取扩增出的产物在1.5%琼脂糖凝胶中电泳;4)观察电泳结果,如果条带扩增如SEQ ID NO.2即可判断待鉴定牛为普通牛,否则为瘤牛。本发明基因组序列可以作为鉴定现有牛品种血统的有效靶点,用于鉴别瘤牛和普通牛,为牛品种的血统来源解析及杂交改良提供必要资源和方法,鉴别方法简便、准确、有效。
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公开(公告)号:CN113234840A
公开(公告)日:2021-08-10
申请号:CN202110475115.6
申请日:2021-04-29
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/64
Abstract: 本发明涉及一种快速诊断桃细菌性穿孔病的试剂盒,属于植物保护技术领域。本发明的试剂盒含有RPA引物对、特异性crRNA和单链DNA探针,所述RPA引物对序列如SEQ ID NO.1‑2所示,所述特异性crRNA序列如SEQ ID NO.3所示,所述单链DNA探针序列如SEQ ID NO.4和/或SEQ ID NO.5所示。本发明的试剂盒基于RPA技术和Crispr/Cas系统进行桃细菌性穿孔病主要病原菌Xap检测,通过横向流动检测试纸条和微型紫外手电筒实现可视化检测,简单灵活,成本低廉,灵敏度高,特异性强,用户可以自由选择,有效避免了某些场景无法使用的问题,在桃树疾病诊断和监控领域应用前景良好。
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公开(公告)号:CN109082472B
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN201810855244.6
申请日:2018-07-31
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6879 , C12N15/113
Abstract: 本发明属于分子标记筛选技术领域,具体涉及牛X和Y精子特异miRNA标志物鉴定及其应用。提供了两个分别作为鉴别牛X和Y精子的miRNA生物标志物,即分子标记bta‑miR‑378和bta‑miR‑204,其中分子标记bta‑miR‑204的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1所示;分子标记bta‑miR‑378的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:2所示。本发明所提供的这两个miRNAs组成的miRNA生物标志物可用于牛X和Y精子的性别鉴定以及作为牛性别控制的分子标记的应用。
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公开(公告)号:CN111455072A
公开(公告)日:2020-07-28
申请号:CN202010475390.3
申请日:2020-05-29
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了可用于鉴别瘤牛和普通牛血统的基因组序列如SEQ ID NO.1和2所示,可用于鉴别瘤牛和普通牛以及有助于后期牛品种纯繁、改良和保种工作实施,瘤牛缺失SEQ ID NO.1基因组序列,普通牛正常;本发明还公开了鉴别瘤牛和普通牛的分子生物学方法,包括:1)从待鉴定牛的组织中分离提取DNA;2)用正向引物(SEQ ID NO.3)和反向引物(SEQ ID NO.4)进行PCR扩增;3)取扩增出的产物在1.5%琼脂糖凝胶中电泳;4)观察电泳结果,如果条带扩增如SEQ ID NO.2即可判断待鉴定牛为普通牛,否则为瘤牛。本发明基因组序列可以作为鉴定现有牛品种血统的有效靶点,用于鉴别瘤牛和普通牛,为牛品种的血统来源解析及杂交改良提供必要资源和方法,鉴别方法简便、准确、有效。
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公开(公告)号:CN109082472A
公开(公告)日:2018-12-25
申请号:CN201810855244.6
申请日:2018-07-31
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6879 , C12N15/113
Abstract: 本发明属于分子标记筛选技术领域,具体涉及牛X和Y精子特异miRNA标志物鉴定及其应用。提供了两个分别作为鉴别牛X和Y精子的miRNA生物标志物,即分子标记bta-miR-378和bta-miR-204,其中分子标记bta-miR-204的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1所示;分子标记bta-miR-378的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:2所示。本发明所提供的这两个miRNAs组成的miRNA生物标志物可用于牛X和Y精子的性别鉴定以及作为牛性别控制的分子标记的应用。
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公开(公告)号:CN116465851A
公开(公告)日:2023-07-21
申请号:CN202310218245.0
申请日:2023-03-08
Applicant: 华中农业大学
IPC: G01N21/3577
Abstract: 本发明属于光谱应用与哺乳动物进化领域,具体涉及基于奶中红外光谱的不同哺乳动物间参考遗传距离的快速预测方法。申请人首次使用奶的MIRS对不同哺乳动物群体间的参考遗传距离进行预测,建立了1个回归模型,可以对自然界中已知哺乳动物的新群体、甚至未知哺乳动物新物种群体与已知哺乳动物群体之间的遗传距离进行预测,从而对哺乳动物群体间的进化差异进行初步判断。准确性较高,趋势明显,可以接近蛋白组或其他组学分析所得的结果。
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公开(公告)号:CN116144794A
公开(公告)日:2023-05-23
申请号:CN202310218543.X
申请日:2023-03-09
Applicant: 华中农业大学
Abstract: 本发明提供了一种牛12KSV液相芯片及其设计方法和应用,芯片包含12506个SV变异位点,对应12506个用于探针设计的位点。设计方法具体包括如下步骤:S1,牛的二代全基因组测序数据的收集;S2,测序数据的质控和序列对比;S3,SV变异位点的鉴定及分型;S4,对所有的缺失型SV变异位点进行整合筛选;S5,根据所有候选位点进行SV液相芯片的定制。本发明芯片能够为牛的种质鉴定、选择育种等领域和其他研究提供较好的研究基础和数据支撑,并进一步降低牛基因组选择的成本,加快我国优质牛品种改良的遗传进展,具有较好的社会价值和推广价值。
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