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公开(公告)号:CN118553306A
公开(公告)日:2024-08-27
申请号:CN202410554417.6
申请日:2024-05-07
Applicant: 华南理工大学
Abstract: 本发明公开了一种基于分子指纹比较的肿瘤新抗原鉴定方法。传统肿瘤新抗原鉴定均未考虑多肽分子指纹对突变肽免疫原性的影响,与之相比,本发明所述方法充分利用多肽的分子指纹信息,可显著过滤掉无免疫原性的突变肽,提高肿瘤新抗原预测的准确率;本发明所述方法可以为肿瘤疫苗和肿瘤细胞疗法提供精准的肿瘤新抗原靶标。
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公开(公告)号:CN113881806A
公开(公告)日:2022-01-04
申请号:CN202111115472.8
申请日:2021-09-23
Applicant: 华南理工大学
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开一种基于CRISPR/Cas12a技术检测新冠病毒和69/70突变株的方法及试剂盒。本发明通过LbaCas12a/crRNA系统特异性识别DNA靶标的能力,通过分别设计针对新冠病毒的非突变的靶点69/70和突变靶点69/70缺失的69/70‑crRNA‑W以及69/70‑crRNA‑M,对样品分子进行检测,只需要一台PCR仪或者恒温装置和简易荧光读取装置,当使用两个crRNA检测同一个样品时,可快速、有效区分核酸样品中含有新冠病毒野生型还是69/70缺失突变株,同时具有高特异性、高灵敏度以及低成本的特点,更加广泛适用于各种分子诊断实验室。本发明对新冠病毒疫情防控具有重要意义。
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公开(公告)号:CN110106290A
公开(公告)日:2019-08-09
申请号:CN201910467339.5
申请日:2019-05-31
Applicant: 华南理工大学
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开一种基于CRISPR/Cas系统用于检测ASFV的现场快速检测方法及试剂盒。本发明利用crRNA的特异性有效保证对病毒特征序列核酸检测的正确度,且常温下1~2小时内即可通过试纸或荧光确定样品中是否存在ASFV,相比传统基于PCR的检测方法精确度有所提高。本发明可在现场,如猪场,屠宰场方便快速地对ASFV进行检测,且不需要复杂的控温仪器如PCR仪和离心机等复杂设备,只需要一个恒温装置及简易荧光检测装置即可快速获得可观测的结果,如果使用侧流试纸显色方案甚至可实现不需要仪器的肉眼现场检测,由此可更加高效地了解猪场的健康状况,避免损失;为ASFV的检测提供更低成本,更快速方便的检测方法。
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公开(公告)号:CN105316416A
公开(公告)日:2016-02-10
申请号:CN201510828705.7
申请日:2015-11-24
Applicant: 华南理工大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q2600/158
Abstract: 本发明公开一种整合转录组、代谢组和KEGG数据快速筛查疾病候选标志物或靶标的方法。本发明的方法可以快速将转录组、代谢组和KEGG的数据整合,有效地找到KEGG中有差异基因和代谢物的位置,这样可以快速锁定不同组学水平数据吻合的关键机制和有效的候选标志物和靶标。相对于单组学水平的数据,不同组学水平数据整合相互佐证疾病机制后得到的标志物或靶标应该更加可信,更有应用前景。本发明方法就是整合了代谢组和转录组的数据来快速鉴定更有价值的疾病标志物或靶标。
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公开(公告)号:CN104975105A
公开(公告)日:2015-10-14
申请号:CN201510469373.8
申请日:2015-07-31
Applicant: 华南理工大学 , 广东省实验动物监测所
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开一种用于小鼠近交系鉴定的SNP标记、引物对及其应用。利用筛出的7个SNP位点:SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6和SNP7,设计7对引物,序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:14所示;每对引物都能够在同样条件下扩增小鼠近交系的基因组序列,序列如SEQ ID NO:15~SEQ ID NO:21所示。且每对引物扩增出的序列都含有一个特定的SNP标记。SNP标记和引物对的应用可达到快速初筛和降低检测成本的目的,从而促进近交系小鼠遗传质量监测标准化进程。
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公开(公告)号:CN113403424B
公开(公告)日:2024-01-09
申请号:CN202110589822.8
申请日:2021-05-28
Applicant: 华南理工大学
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/686 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开一种基于CRISPR/Cas12a技术快速检测新冠病毒和突变株的方法及试剂盒,属于生物技术领域。本发明通过LbaCas12/crRNA系统的单碱基分辨率能力,通过分别设计针对新冠病毒的非突变的靶点N501和突变靶点Y501的501‑crRNA‑W以及501‑crRNA‑M,对样品分子进行检测,只需要一台PCR仪或者恒温装置和简易荧光读取装置,当使用两个crRNA同时检测同一个样品的时候,可快速、有效区分待测核酸样品是非突变株还是突变株,同时具有高特异性、高灵敏度以及低成本的特点,更加广泛适用于各种分子诊断实验室。本发明对新冠病毒疫情防控具有重要意义。
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公开(公告)号:CN107012231B
公开(公告)日:2019-10-18
申请号:CN201710278371.X
申请日:2017-04-25
Applicant: 华南理工大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开一种用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记及其应用。该SNP标记包括48个SNP位点,为SNP1~SNP48,并分别表示其位于SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:48所示的核苷酸序列的第151位。本发明采用生物信息技术的优势开发出能用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记,对于评估食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入水平,SNP标记的应用可大大降低成本和简化操作。SNP标记应用可达到快速初筛和降低检测成本的目的,从而促进食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的标准化进程。
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公开(公告)号:CN109022592A
公开(公告)日:2018-12-18
申请号:CN201810981662.X
申请日:2018-08-27
Applicant: 华南理工大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开一种用于四种常用品系大鼠鉴定的SNP标记及其应用。该SNP标记包括13个SNP位点,为SNP1~SNP13,并分别表示其位于SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:13所示的核苷酸序列的第201位。本发明采用高通量测序及生物信息分析等技术的优势开发出能用于快速鉴定四种常用品系(Wistar、GK、BN、SD)大鼠的SNP标记,SNP标记的应用可大大降低大鼠遗传检测成本并简化操作。
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公开(公告)号:CN108004318A
公开(公告)日:2018-05-08
申请号:CN201711157870.X
申请日:2017-11-20
Applicant: 华南理工大学
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开一种用于早期乳腺癌筛查的血清miRNA标志物组合及其应用。本发明的早期乳腺癌血清miRNA标志物组合,包括的3个miRNA分别为:has-miR-21-5p、has-miR-10b-5p、has-miR-99a-5p。本发明采用生物信息技术优势,基于大规模高通量组织测序数据,结合血清样本的验证,快速筛选出能有效检测出早期乳腺癌的血清miRNA组合。此筛查方法可以大大降低数据获得成本和减少早期乳腺癌血清标志物筛选过程的时间。本发明提供的包括3个miRNA的血清标志物组合,应用标志物组合作为检测靶标,可达到降低检测成本和提高乳腺癌病人的早期检出率的目的。
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公开(公告)号:CN106947825A
公开(公告)日:2017-07-14
申请号:CN201710278366.9
申请日:2017-04-25
Applicant: 华南理工大学
Abstract: 本发明公开一种用于食蟹猴起源(亚群)鉴定的SNP标记及其应用。该SNP标记包括48个SNP位点,为SNP1~SNP48,并分别表示其位于SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:48所示的核苷酸序列的第61位。本发明采用生物信息技术的优势开发出能用于食蟹猴起源(亚群)鉴定的48个SNP标记,对于进口食蟹猴真实起源(亚群)的鉴定,SNP标记的应用可大大降低成本和简化操作。SNP标记应用可达到快速初筛和降低检测成本的目的,从而促进食蟹猴起源(亚群)鉴定标准化进程。
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