一种甘菊4号同源染色体区分/鉴定用BAC克隆及其应用

    公开(公告)号:CN117143966A

    公开(公告)日:2023-12-01

    申请号:CN202311105682.8

    申请日:2023-08-30

    Abstract: 本发明提供了一种甘菊4号同源染色体区分/鉴定用BAC克隆及其应用,属于分子细胞遗传学研究技术领域。本发明首先利用甘菊HindⅢ酶切位点BAC文库随机筛选BAC克隆提取质粒,然后利用缺刻平移法将BAC质粒标记成荧光BAC探针制成杂交液,接着预处理甘菊根尖细胞有丝分裂中期染色体样品,将BAC探针和甘菊染色体样品进行杂交,经过显微镜观察和图像分析,最终发现一个特异BAC克隆能够将甘菊1对同源染色体进行区分和鉴定,比对序列发现特异信号定位在甘菊4号同源染色体上。本发明所提供的探针和方法能够高效、准确地区分甘菊4号同源染色体,操作简便,与传统方法相比显著提高了甘菊4号同源染色体的鉴定速度和鉴定准确性。

    一种基于菊花近缘种属植物参考基因组的核糖体DNA寡核苷酸混合探针套及开发方法

    公开(公告)号:CN113957166B

    公开(公告)日:2023-10-27

    申请号:CN202010700190.3

    申请日:2020-07-20

    Abstract: 本发明提供了一种基于菊花近缘种属植物参考基因组的核糖体DNA(rDNA)寡核苷酸混合探针套,并公开了一种基于菊花近缘种属植物参考基因组的核糖体DNA(rDNA)寡核苷酸混合探针套的开发方法。具体为:利用已下载的拟南芥rDNA数据,对已有的菊花脑、甘野菊、黄蒿和向日葵进行本地Blast比对,获得5S rDNA和45S rDNA(5.8S、18S和28S)共有序列;再利用该数据在Oligo7软件开发5S rDNA和45S rDNA探针;合成的5S rDNA和45SrDNA寡核苷酸探针套分别包含2条和10条寡核苷酸探针。本发明开发的寡核苷酸探针开发方法和探针套,可有效的用于菊属植物染色体分析核型图谱的构建,通过组配好的寡核苷酸探针套通过FISH分析进行检测,避免克隆重组、标记探针的繁琐程序和异源片段,大大简化了FISH分析的程序,提高了实验效率。

    一种紧凑型CRISPR/Cas系统及其应用
    9.
    发明公开

    公开(公告)号:CN117363613A

    公开(公告)日:2024-01-09

    申请号:CN202310430521.X

    申请日:2023-04-16

    Abstract: 本发明提供一种紧凑型CRISPR/Cas系统及其应用,包括以下单元:(1)pH‑Cas12j‑U3crRNA:依次设置的水稻OsU3启动子、pre‑crRNA、间隔区Spacer、crRNA、SUP4ter、玉米Ubi1启动子、Cas12j、连接序列、核定位信号、豌豆rbcS‑E9终止子;或(2)pH‑Cas12j‑tRNA:pH‑Cas12j‑tRNA:依次设置的柳枝稷Ubi1启动子、tRNA核酶序列、crRNA、间隔区spacer、tRNA核酶序列、花椰菜花叶病毒CaMV终止子、Ubipro、Cas12j、连接序列、核定位信号、豌豆rbcS‑E9终止子;或(3)pH‑Cas12j‑STU:依次设置的玉米Ubi启动子、Cas12j、连接序列、核定位信号、PolyA、pre‑crRNA、间隔区Spacer、crRNA、豌豆rbcS‑E9终止子;或(4)依次设置的黄叶卷曲病毒强启动子CmYLCVpro、crRNA、间隔区Spacer、花椰菜花叶病毒35S终止子、玉米Ubi1启动子、Csy4、P2A、Cas12j、连接序列、核定位信号、豌豆rbcS‑E9终止子。紧凑型CRISPR/Cas系统应用于基因编辑,能够显著提高编辑效率。

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