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公开(公告)号:CN117143966A
公开(公告)日:2023-12-01
申请号:CN202311105682.8
申请日:2023-08-30
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6841 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种甘菊4号同源染色体区分/鉴定用BAC克隆及其应用,属于分子细胞遗传学研究技术领域。本发明首先利用甘菊HindⅢ酶切位点BAC文库随机筛选BAC克隆提取质粒,然后利用缺刻平移法将BAC质粒标记成荧光BAC探针制成杂交液,接着预处理甘菊根尖细胞有丝分裂中期染色体样品,将BAC探针和甘菊染色体样品进行杂交,经过显微镜观察和图像分析,最终发现一个特异BAC克隆能够将甘菊1对同源染色体进行区分和鉴定,比对序列发现特异信号定位在甘菊4号同源染色体上。本发明所提供的探针和方法能够高效、准确地区分甘菊4号同源染色体,操作简便,与传统方法相比显著提高了甘菊4号同源染色体的鉴定速度和鉴定准确性。
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公开(公告)号:CN113957166B
公开(公告)日:2023-10-27
申请号:CN202010700190.3
申请日:2020-07-20
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6841 , G16B20/20 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种基于菊花近缘种属植物参考基因组的核糖体DNA(rDNA)寡核苷酸混合探针套,并公开了一种基于菊花近缘种属植物参考基因组的核糖体DNA(rDNA)寡核苷酸混合探针套的开发方法。具体为:利用已下载的拟南芥rDNA数据,对已有的菊花脑、甘野菊、黄蒿和向日葵进行本地Blast比对,获得5S rDNA和45S rDNA(5.8S、18S和28S)共有序列;再利用该数据在Oligo7软件开发5S rDNA和45S rDNA探针;合成的5S rDNA和45SrDNA寡核苷酸探针套分别包含2条和10条寡核苷酸探针。本发明开发的寡核苷酸探针开发方法和探针套,可有效的用于菊属植物染色体分析核型图谱的构建,通过组配好的寡核苷酸探针套通过FISH分析进行检测,避免克隆重组、标记探针的繁琐程序和异源片段,大大简化了FISH分析的程序,提高了实验效率。
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公开(公告)号:CN103114078B
公开(公告)日:2015-10-07
申请号:CN201310037287.0
申请日:2013-01-30
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明属于基因工程领域,公开了一种植物抗病毒相关蛋白及其编码基因与应用。本发明提供的蛋白质,是如下(a)或(b)的蛋白质:(a)由SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(b)将SEQ ID NO.的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物雄抗病相关的由SEQ ID NO.1衍生的蛋白质。本发明的植物抗病相关蛋白影响植物的抗病性。提高该蛋白编码基因的表达可导致感病植物抗病,从而可以培育植物抗病转基因植物。所述蛋白及其编码基因可以应用于植物遗传改良。
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公开(公告)号:CN103215237B
公开(公告)日:2015-06-24
申请号:CN201310098927.9
申请日:2013-03-25
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12N9/12 , C12N15/54 , C12N15/63 , C12N15/11 , C12N5/10 , C12N1/21 , C12N15/82 , C12N15/84 , A01H5/00
Abstract: 本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一组水稻抗褐飞虱基因及其编码蛋白及应用。本发明所述的一组水稻抗褐飞虱基因序列如SEQ ID NO.5~SEQ ID NO.8所示,其编码的蛋白质序列如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.4所示。本发明的水稻抗虫相关蛋白影响植物的抗虫性。提高该蛋白编码基因的表达可导致感虫植物抗虫,从而可以培育植物抗褐飞虱转基因植物。所述基因及其编码蛋白可以应用于植物遗传改良。
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公开(公告)号:CN104388576A
公开(公告)日:2015-03-04
申请号:CN201410759318.8
申请日:2014-12-10
Applicant: 南京农业大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了抗褐飞虱主基因Bph27转育籼稻品种的分子标记方法。本发明开发设计的Bph27紧密连锁分子标记引物B471和B58,能够在抗褐飞虱供体亲本Balamawee与感虫籼稻品种扩增出差异片段。通过Bph27基因位点的分子标记实现了抗褐飞虱基因Bph27的遗传转育,可准确而快速地导入所需要的片段,大大提高Bph27的选择效率,并育成抗褐飞虱籼稻新品系991RB。
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公开(公告)号:CN118459566A
公开(公告)日:2024-08-09
申请号:CN202310089482.1
申请日:2023-02-09
Applicant: 南京农业大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了一种多效转录因子OsWRKY36及其编码基因与应用。本发明提供的蛋白质,是如下(a)或(b)的蛋白质:(a)SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列;(b)将SEQ ID NO.1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物抗病虫相关的由SEQ ID NO.1衍生的蛋白质。本发明的植物抗病虫相关蛋白影响植物的抗性。敲除或降低该蛋白编码基因的表达可导致感病虫植物抗性增强,从而可以培育植物抗病虫转基因植物。所述蛋白及其编码基因可以应用于植物遗传改良。
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公开(公告)号:CN118240962A
公开(公告)日:2024-06-25
申请号:CN202410490399.X
申请日:2024-04-23
Applicant: 南京农业大学 , 三明学院 , 三明国家农业科技园区管理委员会
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6841 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速确定菊花19‑20‑21染色体的寡核苷酸探针及其应用。所述寡核苷酸探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明的筛选到的寡核苷酸探针可实现1条探针即可定位19‑20‑21号染色体可有效的用于菊花单倍体染色体19‑20‑21的识别,方法简单易行,可操作性强,实用性非常突出;在进行FISH检测时,通过简单变性即可用于检测,相较于传统的FISH程序,大大简化了荧光原位杂交探针的制备和标记、分析方法,进一步帮助实验效率的提高;检测时,可得到明亮且清晰的FISH信号,同时杂质信号易洗脱,有利于获得更好的FISH核型,为进一步设计特异性寡核苷酸探针提供有效依据。
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公开(公告)号:CN117660686A
公开(公告)日:2024-03-08
申请号:CN202311700951.5
申请日:2023-12-12
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6841 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种基于低深度测序快速获得白晶菊寡核苷酸探针的方法及其应用,属于分子细胞遗传学研究技术领域。本发明中的寡核苷酸探针为BJJ‑1或BJJ‑2,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示。本发明中的寡核苷酸探针采用基因组survey方法快速获得。使用含有本发明中寡核苷酸探针的杂交液进行染色体高分辨率荧光原位杂交,可用于识别模式作物白晶菊,方法简单易行,可操作性强,高效性和实用性突出,可帮助发展其他物种类似方法。
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公开(公告)号:CN117363613A
公开(公告)日:2024-01-09
申请号:CN202310430521.X
申请日:2023-04-16
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明提供一种紧凑型CRISPR/Cas系统及其应用,包括以下单元:(1)pH‑Cas12j‑U3crRNA:依次设置的水稻OsU3启动子、pre‑crRNA、间隔区Spacer、crRNA、SUP4ter、玉米Ubi1启动子、Cas12j、连接序列、核定位信号、豌豆rbcS‑E9终止子;或(2)pH‑Cas12j‑tRNA:pH‑Cas12j‑tRNA:依次设置的柳枝稷Ubi1启动子、tRNA核酶序列、crRNA、间隔区spacer、tRNA核酶序列、花椰菜花叶病毒CaMV终止子、Ubipro、Cas12j、连接序列、核定位信号、豌豆rbcS‑E9终止子;或(3)pH‑Cas12j‑STU:依次设置的玉米Ubi启动子、Cas12j、连接序列、核定位信号、PolyA、pre‑crRNA、间隔区Spacer、crRNA、豌豆rbcS‑E9终止子;或(4)依次设置的黄叶卷曲病毒强启动子CmYLCVpro、crRNA、间隔区Spacer、花椰菜花叶病毒35S终止子、玉米Ubi1启动子、Csy4、P2A、Cas12j、连接序列、核定位信号、豌豆rbcS‑E9终止子。紧凑型CRISPR/Cas系统应用于基因编辑,能够显著提高编辑效率。
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公开(公告)号:CN116445645B
公开(公告)日:2024-01-02
申请号:CN202310252064.X
申请日:2023-03-16
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6841 , C12N15/11 , G16B25/20 , G16B20/30 , G16B50/00
Abstract: 本发明公开了一种荧光原位杂交探针组,该寡核苷酸探针组包括重复序列寡核苷酸探针SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ IDNO.6。同时,公开了该荧光原位杂交探针的基于转录组快速获得方法,包含该荧光原位杂交探针的寡核苷酸探针杂交液,进行染色体高分辨率荧光原位杂交的方法。本发明方法简单易行,可操作性强,高效性和实用性突出。
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