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公开(公告)号：CN116463398A
公开(公告)日：2023-07-21
申请号：CN202310713150.6
申请日：2023-06-16
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/10 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种与鸡核糖体RNA结合的特异性探针组及应用，属于生物技术领域。本发明参考鸡核糖体RNA序列设计特异性反义探针，通过梯度降温方法使探针与总RNA中的核糖体RNA结合形成杂交链，使用RNase H酶与DNase I酶清除核糖体RNA、基因组DNA及探针。该方法获得的纯化RNA产物可通过商用建库测序试剂盒同时对mRNA和部分含有poly A结构的lncRNA进行测序，减少测序数据量和样品的浪费，加强转录组测序技术在鸡这一物种中的应用。
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公开(公告)号：CN116463398B
公开(公告)日：2023-10-03
申请号：CN202310713150.6
申请日：2023-06-16
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/10 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种与鸡核糖体RNA结合的特异性探针组及应用，属于生物技术领域。本发明参考鸡核糖体RNA序列设计特异性反义探针，通过梯度降温方法使探针与总RNA中的核糖体RNA结合形成杂交链，使用RNase H酶与DNase I酶清除核糖体RNA、基因组DNA及探针。该方法获得的纯化RNA产物可通过商用建库测序试剂盒同时对mRNA和部分含有poly A结构的lncRNA进行测序，减少测序数据量和样品的浪费，加强转录组测序技术在鸡这一物种中的应用。
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公开(公告)号：CN118460741A
公开(公告)日：2024-08-09
申请号：CN202410912640.3
申请日：2024-07-09
申请人： 南京农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种与鸽产蛋间隔性状相关的USP37基因分子标记及其应用，属于生物技术领域。本发明的USP37基因分子标记位点位于USP37基因的内含子区域，是鸽参考基因组Cliv_NAU_1.0版本的6号染色体第27487400位碱基的SNP分子标记，存在C/T多态性，所述分子标记所需鸽子DNA特异性引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示。其有益效果是可以实现对鸽52周平均产蛋间隔性状进行早期选择，提高选育效率，具有较大的经济应用和科研价值。
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公开(公告)号：CN118460739A
公开(公告)日：2024-08-09
申请号：CN202410912623.X
申请日：2024-07-09
申请人： 南京农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种与鸽受精率性状相关的CEPU‑1基因分子标记及其应用，属于生物技术领域。本发明的分子标记位点处于CEPU‑1基因附近，是鸽参考基因组Cliv_NAU_1.0版本的25号染色体第2833945位碱基的SNP分子标记，存在A/G多态性，所述SNP分子标记检测所需鸽子DNA特异性引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示。其有益效果是可以实现对鸽52周受精率性状进行早期选择，提高选育效率，更好地服务于鸽的育种，具有很大的经济应用和科研价值。
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公开(公告)号：CN118460740A
公开(公告)日：2024-08-09
申请号：CN202410912628.2
申请日：2024-07-09
申请人： 南京农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种与鸽蛋重性状相关的NDRG3基因分子标记及其应用，属于生物技术领域。本发明的NDRG3基因分子标记位点位于NDRG3基因内含子区域，是鸽参考基因组Cliv_NAU_1.0版本的16号染色体第13957404位碱基的SNP分子标记，存在C/T多态性，所述分子标记检测所需鸽子DNA特异性引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示。其有益效果是可以实现对鸽蛋重性状进行早期选择，提高选育效率。
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公开(公告)号：CN118667968A
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202410839771.3
申请日：2024-06-26
申请人： 中国农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种与鸡不同周龄胫长相关的SNP分子标记及应用。本发明公开了一个与鸡6周，8周和10周龄胫长相关的SNP位点，该位点位IGF2BP1基因内含子区，基因组位置为GRCg6a 104的chr27：6079608bp处。该SNP标记存在3种基因型，T/T、C/C和T/C，其中T/T对应较高的胫长和体重。在高胫长鸡中，T为优势等位基因，通过优选该SNP位点的T/T基因型，对鸡胫长性状进行早期选择，可以加快鸡的遗传育种。
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公开(公告)号：CN118667967A
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202410839761.X
申请日：2024-06-26
申请人： 中国农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种与鸡多个屠体性状相关的遗传标记及其应用。本发明公开了一个与鸡屠体重，总胃重和肝脏重相关的SNP位点，该位点位于SETDB2基因上游，基因组位置为GRCg6a版本基因组1号染色体170526425核苷酸。该SNP标记存在3种基因型，T/T、C/C和T/C，其中T/T对应较高的鸡屠体重，总胃重和肝脏重等屠体性状。在高体重鸡中，T为优势等位基因，而在低体重鸡中，C为优势等位基因，通过优选该SNP位点的T/T基因型，对鸡屠体性状进行早期选择，可以加快鸡的遗传育种。
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公开(公告)号：CN118621026A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410839680.X
申请日：2024-06-26
申请人： 中国农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种与鸡体重增重性状相关的SNP分子标记及其应用，具体涉及与鸡4到6周龄体增重和6到8周龄体增重相关的SNP位点，该SNP位点位于SETDB2基因上游，GRCg6a基因组版本chr1:170526091，利用重测序技术对1066只鸡进行测序，进行全基因组关联分析，得到了一个影响不同发育阶段体增重的SNP(chr1：170526091)位点，统计该SNP位点在重测序的低体重鸡种与高体重鸡种中的SNP频率，发现其在低体重鸡种和高体重鸡种中存在显著差异，高体重鸡中G为优势等位基因，低体重鸡中A为优势等位基因，在体重低的群体中，通过选择该位点等位基因G的个体，可以提高育种群体的体重。
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公开(公告)号：CN118621024A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410839420.2
申请日：2024-06-26
申请人： 中国农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种与鸡两周龄体重性状相关的SNP标记(chr1：170514458，位于CAB39L基因上游)及其应用，通过测定并记录鸡杂交群体鸡杂交个体的两周龄体重，利用重测序技术对1176只鸡进行测序，进一步进行全基因组关联分析，得到了一个影响两周龄体重的SNP(chr1：170514458)位点，统计该SNP位点在重测序的低体重鸡种与高体重鸡种中的SNP频率，发现其在低体重鸡种和高体重鸡种中存在显著差异，高体重鸡中G为优势等位基因，低体重鸡中T为优势等位基因，在体重低的群体中，通过选择该位点等位基因G的个体，可以提高育种群体的体重。
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公开(公告)号：CN114836418B
公开(公告)日：2024-07-12
申请号：CN202110145282.4
申请日：2021-02-02
申请人： 中国农业大学
IPC分类号： C12N15/113 , C12N15/85 , C12N9/22
摘要： 本发明提供一种用于敲降猪流行性腹泻病毒的CRISPR‑Cas13d系统。本发明利用mCherry荧光报告基因，将PEDV病毒ORF3、E、M和N四个表达阅读框序列分别融合到mCherry基因的C端，构建筛选靶向PEDV表达阅读框的sgRNA高效作用靶点的荧光报告系统，利用CRISPR‑Cas13d高效切割mRNA的特性，进行高效率sgRNAs的快速筛选。然后利用筛选出的高效靶向结合的sgRNAs进行CRISPR‑Cas13d系统对靶病毒的高效降解。本发明提供的RNA病毒敲降方法具有高效率、高精准率及低脱靶率的优势。
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