检测肿瘤化疗个体化用药相关基因的方法和试剂盒

    公开(公告)号:CN106554995B

    公开(公告)日:2020-05-12

    申请号:CN201610597727.1

    申请日:2016-07-26

    IPC分类号: C12Q1/6886 C12Q1/6858

    摘要: 本发明提供了一种检测肿瘤化疗个体化用药相关基因的方法和试剂盒。与现有技术相比,本发明具有以下优点:1)使用的试剂耗材相对简单且稳定,不需要荧光染料、特殊的酶等价格昂贵的试剂;2)反应可以在微量体系中进行,减少了样品和各种消耗品的使用;3)由于质谱技术直接检测DNA的分子量(质荷比)且直接确定碱基的类型(即不需要经过任何形式的信号转换),因此,理论上只要有一个拷贝的扩增DNA片段被扩增即可识别,从而具有高的灵敏度;4)质谱技术还有自动化、高通量检测等特点,因此,质谱技术与多引物延伸技术相结合,可以在一个反应体系中同时检测多个基因位点,从而大大减少了工作量,提高了检测通量。

    一种用于检测融合基因的双链探针的制备方法及通过该方法制备的探针

    公开(公告)号:CN107190095B

    公开(公告)日:2019-12-17

    申请号:CN201710607455.3

    申请日:2017-07-24

    IPC分类号: C12Q1/6811

    摘要: 本发明涉及一种融合基因捕获探针的制备方法及由该方法制备的探针。所述方法包括:(1)根据目标基因融合位点发生的内含子和外显子确定探针区域;(2)以探针区域为模板设计引物从基因组DNA扩增探针区域;(3)对扩增的探针区域加生物亲和素标记;(4)切胶回收加生物亲和素标记的探针区域;(5)将加生物亲和素标记的探针区域随机打断成60‑120bp的小片段探针;(6)探针定量检测。本方法优点在于适用范围广,周期短,成本低。根据本发明的方法制备的探针的优点在于随机片段化实现多重覆盖,不同区域探针自由组合,高效捕获,结果准确。

    基于双链探针的液相杂交捕获试剂盒、洗涤试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN107354207B

    公开(公告)日:2019-12-10

    申请号:CN201710560804.0

    申请日:2017-07-11

    IPC分类号: C12Q1/6874

    摘要: 本发明公开了一种基因组测序文库杂交捕获试剂盒、洗涤试剂盒以及它们在液相杂交捕获中的应用。所述捕获试剂盒包括2×浓度溶液以及100%去离子甲酰胺,其中,所述2×浓度溶液包含100‑150mM的磷酸二氢钠、4×柠檬酸钠缓冲液、1‑3mM的乙二胺四乙酸、2×Denhardt溶液、2‑5mg/ml的Carrier RNA及15‑20w/w%的硫酸葡聚糖,其中,所述4×柠檬酸钠溶液包含0.6M氯化钠、0.06M柠檬酸钠,pH7.0;并且所述2×Denhardt溶液包含0.04%聚蔗糖400、0.04%聚乙烯吡咯烷酮以及0.04%牛血清蛋白。

    一种检测病毒多种分型的方法和检测试剂盒

    公开(公告)号:CN109777887A

    公开(公告)日:2019-05-21

    申请号:CN201711113975.5

    申请日:2017-11-13

    IPC分类号: C12Q1/70 C12R1/93

    摘要: 本发明公开了一种检测病毒,特别是人乳头瘤病毒多种分型的方法和检测试剂盒。所述方法包括以下步骤:1)确定病毒及其不同亚型;2)对病毒的不同亚型设计特异性引物和探针;3)设计一个或多个筛选组合及其对应的分型组合;4)通过设计一个或多个筛选组合确定待测样本的病毒亚型所属的亚组;5)通过与筛选组合对应的分型组合确定病毒的具体分型。所述方法及试剂盒灵敏度高,特异性强,可以一次检测多种常见高低危类型的病毒,大大提高了病毒的检测效率,缩短检测时间。

    一种检测病毒多种分型的方法和检测试剂盒

    公开(公告)号:CN109777887B

    公开(公告)日:2022-07-15

    申请号:CN201711113975.5

    申请日:2017-11-13

    IPC分类号: C12Q1/70 C12R1/93

    摘要: 本发明公开了一种检测病毒,特别是人乳头瘤病毒多种分型的方法和检测试剂盒。所述方法包括以下步骤:1)确定病毒及其不同亚型;2)对病毒的不同亚型设计特异性引物和探针;3)设计一个或多个筛选组合及其对应的分型组合;4)通过设计一个或多个筛选组合确定待测样本的病毒亚型所属的亚组;5)通过与筛选组合对应的分型组合确定病毒的具体分型。所述方法及试剂盒灵敏度高,特异性强,可以一次检测多种常见高低危类型的病毒,大大提高了病毒的检测效率,缩短检测时间。

    一种基于目标区域捕获的甲基化突变检测方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN114058681A

    公开(公告)日:2022-02-18

    申请号:CN202111455277.X

    申请日:2021-12-01

    IPC分类号: C12Q1/6827 C12Q1/6886

    摘要: 本发明公开了一种基于目标区域捕获的甲基化突变检测方法及试剂盒,属于分子生物学技术领域。首先构建游离DNA基因文库,经重亚硫酸盐处理后,进行PCR扩增,通过磁珠纯化,纯化的产物进行甲基化探针液相杂交,对混合物中的DNA甲基化片段进行捕获,然后经纯化得到捕获后产物片段,扩增后利用磁珠对扩增产物进行纯化回收,得到上机文库,使用Illumina测序平台进行测序,通过生物信息学对得到实验数据进行分析,获得目标区域内甲基化突变情况。本发明的检测方法能够一次性获得样本多个基因目标区域甲基化突变信息,使得对目标基因区域进行高通量、高灵敏度、高准确度的甲基化检测成为现实。