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公开(公告)号：CN118072822A
公开(公告)日：2024-05-24
申请号：CN202410160017.7
申请日：2024-02-04
摘要： 本发明属于猪基因组育种芯片技术领域，具体公开了一种基于干扰转录因子结合强度的猪功能突变位点基因芯片及其构建方法和应用。该芯片充分考虑到基因组调控元件的调控作用对突变位点的影响，从海量的猪基因组功能突变位点中筛选出干扰转录因子结合强度更高的81,000个突变位点，与传统的猪育种芯片和已有的功能位点相比，本发明提供的芯片上的每个标记与表型关联更加紧密，采用基于转录因子干扰作用设计的功能位点芯片进行育种可提高后续育种值计算准确性，从而提高育种效率。
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公开(公告)号：CN117625809A
公开(公告)日：2024-03-01
申请号：CN202311655654.3
申请日：2023-12-01
申请人： 华中农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了与仔猪均匀度性状相关的SNP分子标记及其应用，登录号为rs328479442的SNP位点与仔猪均匀度性状显著关联，其位于猪3号染色体26987339位碱基（猪基因组11.1版本），参阅Ensembl数据库，得到登陆号为rs328479442片段上下游各50 bp的核苷酸序列，所述核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1或2所示，多态性位点为C或T，相比于多态性位点为C的个体，多态性位点为T时仔猪均匀度较好。
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公开(公告)号：CN116463425A
公开(公告)日：2023-07-21
申请号：CN202211193303.0
申请日：2022-09-28
申请人： 华中农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及猪初生重性状相关的SNP分子标记。该SNP分子标记登陆号为rs80876322，通过采集来自中国南部某猪场的杜洛克猪耳样，提取基因组DNA并进行质量检测，利用GeneSeek Porcine 50K SNP高密度芯片进行全基因组范围内的SNP检测获得个体的基因型信息，通过全基因组关联分析获得了一种与猪初生重性状相关的SNP分子标记，该SNP分子标记位于14号染色体，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，在所述序列的第51位碱基处存在一个A/G的等位基因突变(替换)，该突变(替换)引起所示序列的核苷酸多态性。当SEQ ID NO:1所示序列第51位核苷酸为G时，判定为猪的初生重更大。
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公开(公告)号：CN112011627B
公开(公告)日：2022-02-25
申请号：CN202011028842.X
申请日：2020-09-27
申请人： 赤峰家育种猪生态科技集团有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11 , G16B20/20
摘要： 本发明公开了一种与加系大白猪背膘厚相关的分子标记及筛选方法和应用，本发明与加系大白猪背膘厚相关的分子标记为ASGA0004992上下游100bp的核苷酸序列，在核苷酸序列101位碱基处的R是A或G，当序列的第101位核苷酸为G时，则加系大白猪具有更低的背膘厚。本发明可通过在体外采用基因芯片技术检测猪的基因型，作为非诊断目的的评价猪的背膘厚度，具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点。本发明的目的在于完善加系大白背膘厚度性状相关的育种分子标记，利用50K的基因芯片对SNP进行分型，并使用GWAS筛选与加系大白背膘厚度相关的SNP，为猪的遗传育种提供了新的分子标记资源和标记辅助选择应用基础。
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公开(公告)号：CN111254205A
公开(公告)日：2020-06-09
申请号：CN202010238325.9
申请日：2020-03-30
申请人： 赤峰家育种猪生态科技集团有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种影响加系大白猪平均日增重的分子标记及筛选方法和应用，该分子标记克隆自登陆号为ASGA0005017，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与加系大白猪平均日增重相关的分子标记，该分子标记的核苷酸序列如核苷酸序列表所示，在该核苷酸序列第101位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变，且当上述核苷酸序列的第101位核苷酸为G时，则加系大白猪具有更高的平均日增重。本发明还公开了筛选影响加系大白猪平均日增重的分子标记的方法及其应用，本发明为加系大白猪平均日增重性状的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。本发明中的分子标记具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点。
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公开(公告)号：CN110484631A
公开(公告)日：2019-11-22
申请号：CN201910719346.X
申请日：2019-08-01
申请人： 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪性成熟期性状相关的InDel分子标记。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所中公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据，对比猪参考基因组序列获得基因分型数据，得到一种与猪性成熟期性状相关InDel的分子标记，本发明的分子标记为猪15号染色体上94356743bp处发生的缺失，由原先的AG缺失为A。当个体基因型为AA时，有利于个体拥有更长的性成熟期。公开了筛选与猪性成熟期性状相关分子标记的方法及其关联分析的应用。本发明为猪性成熟期的标记辅助选择提供了一个新的InDel分子标记。
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公开(公告)号：CN109837348A
公开(公告)日：2019-06-04
申请号：CN201910055926.3
申请日：2019-01-19
申请人： 华中农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与公猪精子浓度性状关联的分子标记，该分子标记克隆自登陆号为WU_10.2_17_4574599的基因片段，通过基因芯片技术对该基因进行分型，筛选得到一种与猪精子浓度性状关联的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个T/C的等位基因突变，当SEQ ID NO：1上的第101位的核苷酸为C时，判定猪具有更高的精子浓度。本发明为猪精液性状的标记辅助选择提供了新的SNP分子标记资源。
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公开(公告)号：CN109554487A
公开(公告)日：2019-04-02
申请号：CN201910056622.9
申请日：2019-01-19
申请人： 华中农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与公猪精液量性状关联的分子标记及应用。该分子标记克隆自登陆号为WU_10.2_13_11960687的基因片段，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选，得到一种与公猪精液量性状关联的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变，该突变导致所述核苷酸序列的多态性，当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为T时，判定公猪具有更多的精液量。本发明为猪精液量性状的标记辅助选择提供了新的SNP分子标记资源。
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公开(公告)号：CN109524059B
公开(公告)日：2023-02-28
申请号：CN201811620927.X
申请日：2018-12-28
申请人： 华中农业大学 , 广州影子科技有限公司
IPC分类号： G16B20/00
摘要： 本发明提供一种快速稳定的动物个体基因组育种值评估方法，涉及动物育种技术领域。该方法采用HIBLUP使用表型、基因型和谱系信息进行基因组育种值的预测，最终输出中包括估计的个体遗传价值、每个个体的加性效应和显性效应值以及用于基因分型芯片中的每个遗传标记效应的反向解析值。本发明全面利用谱系、表型和基因型信息来预测每个动物的遗传(加性和显性效应)价值以及每个SNP标记位点的效应值，实现最先进的基因组育种值的预测和方差组分估计算法而实现基因组选择。
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公开(公告)号：CN109554487B
公开(公告)日：2021-04-16
申请号：CN201910056622.9
申请日：2019-01-19
申请人： 华中农业大学
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与公猪精液量性状关联的分子标记及应用。该分子标记克隆自登陆号为WU_10.2_13_11960687的基因片段，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选，得到一种与公猪精液量性状关联的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变，该突变导致所述核苷酸序列的多态性，当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为T时，判定公猪具有更多的精液量。本发明为猪精液量性状的标记辅助选择提供了新的SNP分子标记资源。
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