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公开(公告)号：CN108588201A
公开(公告)日：2018-09-28
申请号：CN201810449985.4
申请日：2018-05-11
申请人： 浙江省人民医院 , 浙江大学医学院附属第一医院 , 北京吉因加科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6886
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6886 , C12Q2600/156 , C12Q2565/537
摘要： 本发明公开了一种结直肠癌西妥昔单抗耐药性痕量DNA突变检测的方法及装置，所述方法包括：从样本中提取游离DNA；将所述游离DNA构建文库；将所述文库进行富集；将所述富集的文库使用捕获探针进行捕获，获得捕获DNA；将所述捕获DNA测序，获得测序结果；将所述测序结果与参考序列比较，检出突变位点。本发明的方法实现了低起始量DNA富集捕获测序突变检测。
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公开(公告)号：CN108588201B
公开(公告)日：2019-08-09
申请号：CN201810449985.4
申请日：2018-05-11
申请人： 浙江省人民医院 , 浙江大学医学院附属第一医院 , 北京吉因加科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6886
摘要： 本发明公开了一种一种结直肠癌西妥昔单抗耐药性痕量DNA突变检测的方法及装置，所述方法包括：从样本中提取游离DNA；将所述游离DNA构建文库；将所述文库进行富集；将所述富集的文库使用捕获探针进行捕获，获得捕获DNA；将所述捕获DNA测序，获得测序结果；将所述测序结果与参考序列比较，检出突变位点。本发明的方法实现了低起始量DNA富集捕获测序突变检测。
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公开(公告)号：CN108424957B
公开(公告)日：2019-04-19
申请号：CN201810231453.3
申请日：2018-03-20
申请人： 浙江省人民医院 , 北京吉因加科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6886
摘要： 本发明公开了一种胰腺癌痕量DNA富集捕获测序的方法，所述方法包括步骤：(1)从样本中提取游离DNA；(2)将所述游离DNA建文库；(3)将所述文库进行富集；(4)将所述富集的文库进行捕获，获得捕获DNA；(5)将所述捕获DNA测序，获得测序结果；(6)将所述测序结果与参考序列比较，获得突变位点。
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公开(公告)号：CN108424957A
公开(公告)日：2018-08-21
申请号：CN201810231453.3
申请日：2018-03-20
申请人： 浙江省人民医院 , 北京吉因加科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6886
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6886 , C12Q2600/156 , C12Q2565/501
摘要： 本发明公开了一种胰腺癌痕量DNA富集捕获测序的方法，所述方法包括步骤：(1)从样本中提取游离DNA；(2)将所述游离DNA建文库；(3)将所述文库进行富集；(4)将所述富集的文库进行捕获，获得捕获DNA；(5)将所述捕获DNA测序，获得测序结果；(6)将所述测序结果与参考序列比较，获得突变位点。
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公开(公告)号：CN112029858B
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202010844019.X
申请日：2020-08-20
申请人： 北京吉因加科技有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12M1/34 , C12M1/00 , G16B20/30 , G16B30/00
摘要： 本发明公开了一种PD‑1/PD‑L1抑制剂免疫治疗疗效预测的方法和系统。所述方法包括：获取受试者的肿瘤浸润淋巴细胞的T细胞受体的种类和丰度，以及基线外周血的CD8+PD1+T细胞的T细胞受体的种类；统计受试者的肿瘤浸润淋巴细胞与CD8+PD1+T细胞共有T细胞受体的种类，计算所述肿瘤浸润淋巴细胞中具有共有T细胞受体的肿瘤浸润淋巴细胞的平均比例，作为IR指数；通过所述IR指数判断PD‑1/PD‑L1抑制剂免疫治疗疗效。本发明的方法可以提供肿瘤免疫治疗疗效及预后的预测指标，能有效筛选免疫治疗应答患者群。
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公开(公告)号：CN115346608B
公开(公告)日：2023-05-09
申请号：CN202210743555.X
申请日：2022-06-27
申请人： 北京吉因加科技有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
摘要： 一种构建病原生物基因组数据库的方法及装置，该方法包括：获取基因组数据步骤，包括从数据库获取选定的病原生物的基因组数据；同源区域屏蔽步骤，包括对基因组数据进行质粒同源区域屏蔽、宿主源同源区域屏蔽，获得屏蔽同源区域后的基因组数据；融合基因组构建步骤，包括对屏蔽同源区域序列后的基因组数据中的各个基因组构建融合基因组；组库步骤，包括重复所述获取基因组数据步骤、同源区域屏蔽步骤、融合基因组构建步骤，遍历所选定的所有病原生物的基因组数据，汇总所有融合基因组，得到病原生物基因组数据库。该方法构建的数据库具有准确度高，分析时间短的优点。
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公开(公告)号：CN111968701B
公开(公告)日：2022-10-04
申请号：CN202010880479.8
申请日：2020-08-27
申请人： 北京吉因加科技有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
摘要： 本发明涉及基因领域，特别是涉及一种检测指定基因组区域体细胞拷贝数变异的方法和装置。本发明综合log2(copy Ratio)值、B等位基因频率(BAF)差异显著性、目标捕获区域内均一化的读长覆盖度的差异显著性和非目标捕获区域内均一化的读长覆盖度的差异显著性多个指标，并应用多变量分析综合多个指标分析结果，实现对指定的基因或区间进行高效、准确的拷贝数变异检测。
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公开(公告)号：CN109427412A
公开(公告)日：2019-03-05
申请号：CN201811303219.3
申请日：2018-11-02
申请人： 北京吉因加科技有限公司 , 苏州吉因加生物医学工程有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
摘要： 本发明公开了用于检测肿瘤突变负荷的序列组合和其设计方法。所述方法包括：a)确定需要设计探针的目标区域，并获得包含大样本测定的肿瘤突变数据的数据库；b)对于每个目标区域，以一个窗口长度进行滑动获得多个窗口，对所述每个窗口进行打分；c)对于每个目标区域，得分最高的窗口是目标探针区域。本发明还公开了计算组织和血浆样本TMB的方法，以及计算组织和血浆样本TMB的质控方法。
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公开(公告)号：CN105063209B
公开(公告)日：2017-12-12
申请号：CN201510488030.6
申请日：2015-08-10
申请人： 北京吉因加科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： 本发明提供了一种外泌体miRNA的定量检测方法，包括外泌体总RNA提取、3’端和5’端特异性唯一标签接头连接、反转录合成cDNA并进行PCR扩增、miRNA文库的筛选纯化与上机测序、纠错算法的信息分析等步骤。本发明方法基于特异性的唯一标签接头的标记，对每个原始模板进行区分，避免了扩增时分子间存在的偏好性，可以精确检测低于10拷贝以下的miRNA分子，且特异性高，可用于肿瘤源性的外泌体miRNA的检测，神经退行性疾病、心血管疾病，生育健康等领域的检测，可为疾病的早期筛查提供依据，还可应用于其他小RNA精准定量检测领域。具有广阔的应用前景和市场价值。
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公开(公告)号：CN106676178A
公开(公告)日：2017-05-17
申请号：CN201710043183.9
申请日：2017-01-19
申请人： 北京吉因加科技有限公司
摘要： 本发明公开了一种评估肿瘤异质性的方法及系统。具体而言，本发明提出了一种分子克隆分析方法，该方法基于高通量测序在循环肿瘤DNA中的多种类型变异检测结果，将所有变异划分为不同的分子克隆，利用分子克隆层级评估肿瘤的异质性。本发明的方法实现以ctDNA高通量变异检测为基础的肿瘤异质性评估，以有效辅助肿瘤预后和治疗方案制定。
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