基于crRNA间隔区裂分进行单核苷酸多态性识别的方法及应用

    公开(公告)号:CN118389648A

    公开(公告)日:2024-07-26

    申请号:CN202410540526.2

    申请日:2024-04-30

    IPC分类号: C12Q1/6827

    摘要: 本发明公开了一种基于crRNA间隔区裂分进行单核苷酸多态性识别的方法及应用,通过将与靶标碱基互补配对的crRNA间隔区分裂获得识别探针,当识别探针与目标序列完全互补配对时,激活Cas12a蛋白,产生显著荧光信号;当目标序列中存在与分裂式间隔区错配的碱基时,分裂的crRNA间隔区难以与不完全匹配序列组装,Cas12系统不被激活,不产生荧光信号。本发明的方法增强CRISPR/Cas12a对单碱基错配的高特异性识别能力,使得SNP的检测不受错配碱基位置的限制,并在低突变丰度中仍展示高分辨度,用于制备单核苷酸错配的检测试剂盒,以满足针对临床样品的实际检测要求。

    利用Cas12j效应蛋白检测目标突变的方法

    公开(公告)号:CN113913499B

    公开(公告)日:2024-07-16

    申请号:CN202011567811.1

    申请日:2020-12-25

    发明人: 梁亚峰 段志强

    IPC分类号: C12Q1/6827

    摘要: 本发明提供了利用Cas12j效应蛋白检测目标突变的方法。所述方法为一种利用Cas12j效应蛋白检测靶核酸是否存在目标突变的方法,包括将样品与V型CRISPR/CAS效应蛋白、gRNA(指导RNA)和单链核酸检测器接触,所述gRNA包括与所述CRISPR/CAS效应蛋白结合的区域和与突变型靶核酸杂交的导向序列;检测由CRISPR/CAS效应蛋白切割单链核酸检测器产生的可检测信号,所述目标突变设置于gRNA导向序列从5’端第1‑20位,优选的,第9‑10位。

    与水稻籽粒暗胚乳性状相关的SSCP分子标记、基因及其应用

    公开(公告)号:CN115125318B

    公开(公告)日:2024-06-18

    申请号:CN202210448114.7

    申请日:2022-04-26

    申请人: 浙江大学

    发明人: 金晓丽 张雨诗

    摘要: 本发明公开了一种与水稻籽粒暗胚乳性状相关的SSCP分子标记、基因及其应用;该SSCP分子标记的碱基序列如SEQ ID NO.1所示,SSCP位点位于扩增片段的第91bp处,碱基差异为A/G。本发明对通过暗胚乳水稻材料de6进行图位克隆,并首次公开了一个与水稻暗胚乳相关联的SSCP1分子标记。该分子标记可用于分子标记辅助选择育种,具有检测效率高、准确性高、方便操作和成本较低的优点。

    检测人RET基因12号外显子的探针、试剂盒、检测方法及应用

    公开(公告)号:CN114075593B

    公开(公告)日:2024-06-14

    申请号:CN202010831715.7

    申请日:2020-08-18

    发明人: 赵丹 王欢 彭波

    摘要: 本发明提供了一种检测人RET基因12号外显子的探针试剂盒、检测方法及应用。所述探针包括三个区域:(1)5’端同源区,与目的基因的5’端序列互补结合;(2)3’端同源区,与目的基因的3’端序列互补结合;(3)环化区,与荧光探针互补结合,环化区位于5’端同源区和3’端同源区之间;其中,3’同源区的碱基数量为20‑24nt,GC含量为47.8‑55%;5’同源区的碱基数量为12‑15nt,GC含量为60‑75%;3’同源区的Tm值比5’同源区的Tm值高‑3‑15℃,且5’端同源序列Tm值大于45℃。采用所述探针进行原位检测,可直接肉眼观察细胞或者临床组织样本中人RET基因在细胞核内的定位和拷贝数。