公开(公告)号：EP3209791A1

公开(公告)日：2017-08-30

申请号：EP15852699.6

申请日：2015-10-22

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： MOTLEY, Stanley

IPC分类号： C12Q1/04 ,  C12Q1/68 ,  G06F19/18

CPC分类号： C12Q1/689 ,  C12Q1/70 ,  C12Q2600/154 ,  G06F19/00 ,  G06F19/18 ,  G06F19/28 ,  G16H50/80

摘要： Provided herein are systems and methods for determining the epigenetic sequences and signatures of bacteria, methods of characterizing bacteria based thereon, and methods of use thereof.

摘要翻译： 本文提供了用于确定细菌的表观遗传序列和标记的系统和方法，基于其的表征细菌的方法以及其使用方法。

公开(公告)号：EP2794904A2

公开(公告)日：2014-10-29

申请号：EP12858832.4

申请日：2012-12-21

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： MOTLEY, Stanley ,  ESHOO, Mark W.

IPC分类号： C12P19/34

CPC分类号： C12Q1/70 ,  C12N15/1096 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2531/143 ,  C12Q2535/122

摘要： The present invention relates to methods and compositions for tagging, amplifying, purifying, and or characterizing of ribonucleic acid (RNA) in a sample. In particular, methods are provided for preparing RNA from a sample for subsequent analysis.

公开(公告)号：EP3215194A1

公开(公告)日：2017-09-13

申请号：EP15856551.5

申请日：2015-11-06

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： MICHAEL, Todd P. ,  MOTLEY, Stanley

IPC分类号： A61K48/00 ,  C12N15/113 ,  A61P25/28

CPC分类号： C12N15/113 ,  A61K48/00 ,  A61K48/0016 ,  A61K48/0075

摘要： Provided herein are methods for improving memory or cognitive function in a subject by administering a composition to the brain of the subject, where the composition comprises: i) a compound that increases expression of MALAT-1 long non-coding RNA, ii) a MALAT-1 long-coding RNA nucleic acid sequence, or iii) at least one MALAT-1 derived piRNA nucleic acid sequence. Also provided herein are methods of screening candidate compounds for their ability to modulate the expression of MALAT-1 long non-coding RNA in brain cells. In certain embodiments, such identified modulators that increase expression are further administered to the brain of a lab animal to determine the impact of such modulators on learning and memory.

摘要翻译： 本文提供了通过将组合物施用于受试者的大脑来改善受试者的记忆或认知功能的方法，其中所述组合物包含：i）增加MALAT-1长非编码RNA表达的化合物，ii）MALAT -1长编码RNA核酸序列，或iii）至少一个MALAT-1衍生的piRNA核酸序列。 本文还提供筛选候选化合物调节脑细胞中MALAT-1长非编码RNA表达的能力的方法。 在某些实施方案中，将这种鉴定的增加表达的调节剂进一步施用于实验动物的大脑以确定这种调节剂对学习和记忆的影响。

公开(公告)号：EP2971140A1

公开(公告)日：2016-01-20

申请号：EP14767628.2

申请日：2014-03-12

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： ESHOO, Mark W. ,  MOTLEY, Stanley

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12Q1/70 ,  C12P19/34 ,  A61K35/12 ,  A61K35/66

CPC分类号： C12Q1/689 ,  C12Q1/6848 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2545/101 ,  C12Q2547/101

摘要： The present invention relates to systems and methods for detecting contamination in nucleic acid analyses. In particular, the present invention relates to systems and methods for detecting contamination in DNA sequencing assays.

公开(公告)号：EP3533884A1

公开(公告)日：2019-09-04

申请号：EP19151944.6

申请日：2014-03-12

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： ESHOO, Mark W. ,  MOTLEY, Stanley

IPC分类号： C12Q1/70 ,  C12P19/34 ,  A61K35/12 ,  A61K35/66 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/6869

摘要： The present invention relates to systems and methods for detecting contamination in nucleic acid analyses. In particular, the present invention relates to systems and methods for detecting contamination in DNA sequencing assays.

公开(公告)号：EP2971140B1

公开(公告)日：2019-01-16

申请号：EP14767628.2

申请日：2014-03-12

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： ESHOO, Mark W. ,  MOTLEY, Stanley

IPC分类号： C12Q1/689 ,  C12Q1/6869

公开(公告)号：EP3269820A1

公开(公告)日：2018-01-17

申请号：EP17189479.3

申请日：2012-12-21

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： MOTLEY, Stanley ,  ESHOO, Mark W.

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/70 ,  C12N15/10

CPC分类号： C12Q1/70 ,  C12N15/1096 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2531/143 ,  C12Q2535/122

摘要： The present invention relates to methods and compositions for tagging, amplifying, purifying, and or characterizing of ribonucleic acid (RNA) in a sample. In particular, methods are provided for preparing RNA from a sample for subsequent analysis.

摘要翻译： 本发明涉及用于标记，扩增，纯化和/或表征样品中的核糖核酸（RNA）的方法和组合物。 具体而言，提供了从样品制备RNA用于随后分析的方法。

公开(公告)号：EP2658988B1

公开(公告)日：2018-01-24

申请号：EP11853018.7

申请日：2011-12-27

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： ESHOO, Mark W. ,  PICURI, John ,  MOTLEY, Stanley

IPC分类号： C12P19/34

CPC分类号： B01J19/0046 ,  B01J2219/00585 ,  B01J2219/00722 ,  C12N15/10 ,  C12N15/1093 ,  C12Q1/686 ,  C12Q2521/501 ,  C12Q2525/191

摘要： The present invention provides compositions and methods for preparing a nucleic acid library in a multi-purpose buffer (e.g., employing whole genome amplification), where nucleic acid purification is not required between or during steps. In certain embodiments, small amounts of starting nucleic acid (e.g., genomic DNA) are employed and the steps are accomplished in a single container. In some embodiments, the nucleic acid library is subjected to sequencing methodologies or rolling circle amplification.

公开(公告)号：EP2794904B1

公开(公告)日：2017-09-06

申请号：EP12858832.4

申请日：2012-12-21

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： MOTLEY, Stanley ,  ESHOO, Mark W.

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/70 ,  C12N15/10

CPC分类号： C12Q1/70 ,  C12N15/1096 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2531/143 ,  C12Q2535/122

公开(公告)号：EP2658988A1

公开(公告)日：2013-11-06

申请号：EP11853018.7

申请日：2011-12-27

申请人： Ibis Biosciences, Inc.

发明人： ESHOO, Mark W. ,  PICURI, John ,  MOTLEY, Stanley

IPC分类号： C12P19/34

CPC分类号： B01J19/0046 ,  B01J2219/00585 ,  B01J2219/00722 ,  C12N15/10 ,  C12N15/1093 ,  C12Q1/686 ,  C12Q2521/501 ,  C12Q2525/191

摘要： Compositions and methods for preparing a nucleic acid library in a multi-purpose buffer (e.g., employing whole genome amplification), where nucleic acid purification is not required between or during steps, are disclosed. Small amounts of starting nucleic acid (e.g., genomic DNA) are employed and the steps are accomplished in a single container. The nucleic acid library may be subjected to sequencing methodologies or rolling circle amplification.