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1.发明申请HYBRID SELECTION USING GENOME-WIDE BAITS FOR SELECTIVE GENOME ENRICHMENT IN MIXED SAMPLES 审中-公开使用混合样品中选择性基因扩增的基因组杂交的杂交选择公开(公告)号：US20130230857A1
公开(公告)日：2013-09-05
申请号：US13883422
申请日：2011-11-03
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6888 , C07H21/04 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/6893 , C12Q2600/156 , Y02A50/58
摘要： The present invention provides methods for sequencing and genotyping of DNA useful for analysis of samples in which the target DNA represents a small portion (e.g., 10-1000-fold less) that a contaminating DNA source. Accordingly, the methods described herein are useful for sequencing or genotyping pathogen DNA, such as malaria DNA, in clinical samples taken from infected subjects.
摘要翻译： 本发明提供了可用于分析其中靶DNA代表污染性DNA来源的小部分（例如，少于10-1000倍）的样品的DNA的测序和基因分型方法。 因此，本文所述的方法可用于从感染的受试者获取的临床样品中对病原体DNA（例如疟疾DNA）进行测序或基因分型。
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公开(公告)号：US09434985B2
公开(公告)日：2016-09-06
申请号：US13121158
申请日：2009-09-22
申请人： Job Dekker , Erez Lieberman , Nynke Van Berkum , Andreas Gnirke , Eric Lander , Chad Nusbaum , Louise Williams , Alexandre Melnikov , Georgia Giannoukos
发明人： Job Dekker , Erez Lieberman , Nynke Van Berkum , Andreas Gnirke , Eric Lander , Chad Nusbaum , Louise Williams , Alexandre Melnikov , Georgia Giannoukos
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6837 , C12Q1/68
摘要： The disclosed Hi-C protocol can identify genomic loci that are spatially co-located in vivo. These spatial co-locations may include, but are not limited to, intrachromosomal interactions and/or interchromosomal interactions. Hi-C techniques may be applied to many different scales of interest. For example, on a large scale, Hi-C techniques can be used to identify long-range interactions between distant genomic loci.
摘要翻译： 所公开的Hi-C协议可以鉴定空间上位于体内的基因座。 这些空间共位点可以包括但不限于染色体间相互作用和/或染色体间相互作用。 Hi-C技术可以应用于许多不同的感兴趣的尺度。 例如，大规模地，Hi-C技术可用于鉴定远距离基因组基因座之间的长距离相互作用。
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公开(公告)号：US20140200163A1
公开(公告)日：2014-07-17
申请号：US14115608
申请日：2012-05-04
申请人： Tarjei Mikkelsen , Andreas Gnirke , Alexandre Melnikov , Eric S. Lander , Li Wang , Xiaolan Zhang
发明人： Tarjei Mikkelsen , Andreas Gnirke , Alexandre Melnikov , Eric S. Lander , Li Wang , Xiaolan Zhang
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6897 , C12N15/1086 , C12N15/63
摘要： The invention provides methods for determining the activity of a plurality of nucleic acid regulatory elements. These methods may facilitate, e.g., the systematic reverse engineering, and optimization of mammalian cis-regulatory elements at high resolution and at a large scale. The method may include integration of multiplexed DNA synthesis and sequencing technologies to generate and quantify the transcriptional regulatory activity of e.g., thousands of arbitrary DNA sequences in parallel in cell-based as says (e.g., mammalian cell based assays).
摘要翻译： 本发明提供了确定多种核酸调节元件的活性的方法。 这些方法可以促进例如系统逆向工程，并且以高分辨率和大规模优化哺乳动物顺式调节元件。 该方法可以包括多重的DNA合成和测序技术的整合，以产生并定量例如成千上万个任意DNA序列在基于细胞的平行中的转录调节活性，如所述（例如，基于哺乳动物细胞的测定）。
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公开(公告)号：US20130096009A1
公开(公告)日：2013-04-18
申请号：US13121158
申请日：2009-09-22
申请人： Job Dekker , Erez Lieberman , Nynke Van Berkum , Andreas Gnirke , Eric Lander , Chad Nusbaum , Louise Williams , Alexandre Melnikov , Georgia Giannoukos
发明人： Job Dekker , Erez Lieberman , Nynke Van Berkum , Andreas Gnirke , Eric Lander , Chad Nusbaum , Louise Williams , Alexandre Melnikov , Georgia Giannoukos
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6837 , C12Q1/68
摘要： The disclosed Hi-C protocol can identify genomic loci that are spatially co-located in vivo. These spatial co-locations may include, but are not limited to, intrachromosomal interactions and/or interchromosomal interactions. Hi-C techniques may be applied to many different scales of interest. For example, on a large scale, Hi-C techniques can be used to identify long-range interactions between distant genomic loci.
摘要翻译： 所公开的Hi-C协议可以鉴定空间上位于体内的基因座。 这些空间共位点可以包括但不限于染色体间相互作用和/或染色体间相互作用。 Hi-C技术可以应用于许多不同的感兴趣的尺度。 例如，大规模地，Hi-C技术可用于鉴定远距离基因组基因座之间的长距离相互作用。
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