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公开(公告)号：US09434985B2
公开(公告)日：2016-09-06
申请号：US13121158
申请日：2009-09-22
申请人： Job Dekker , Erez Lieberman , Nynke Van Berkum , Andreas Gnirke , Eric Lander , Chad Nusbaum , Louise Williams , Alexandre Melnikov , Georgia Giannoukos
发明人： Job Dekker , Erez Lieberman , Nynke Van Berkum , Andreas Gnirke , Eric Lander , Chad Nusbaum , Louise Williams , Alexandre Melnikov , Georgia Giannoukos
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6837 , C12Q1/68
摘要： The disclosed Hi-C protocol can identify genomic loci that are spatially co-located in vivo. These spatial co-locations may include, but are not limited to, intrachromosomal interactions and/or interchromosomal interactions. Hi-C techniques may be applied to many different scales of interest. For example, on a large scale, Hi-C techniques can be used to identify long-range interactions between distant genomic loci.
摘要翻译： 所公开的Hi-C协议可以鉴定空间上位于体内的基因座。 这些空间共位点可以包括但不限于染色体间相互作用和/或染色体间相互作用。 Hi-C技术可以应用于许多不同的感兴趣的尺度。 例如，大规模地，Hi-C技术可用于鉴定远距离基因组基因座之间的长距离相互作用。
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2.发明申请HYBRID SELECTION USING GENOME-WIDE BAITS FOR SELECTIVE GENOME ENRICHMENT IN MIXED SAMPLES 审中-公开使用混合样品中选择性基因扩增的基因组杂交的杂交选择公开(公告)号：US20130230857A1
公开(公告)日：2013-09-05
申请号：US13883422
申请日：2011-11-03
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6888 , C07H21/04 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/6893 , C12Q2600/156 , Y02A50/58
摘要： The present invention provides methods for sequencing and genotyping of DNA useful for analysis of samples in which the target DNA represents a small portion (e.g., 10-1000-fold less) that a contaminating DNA source. Accordingly, the methods described herein are useful for sequencing or genotyping pathogen DNA, such as malaria DNA, in clinical samples taken from infected subjects.
摘要翻译： 本发明提供了可用于分析其中靶DNA代表污染性DNA来源的小部分（例如，少于10-1000倍）的样品的DNA的测序和基因分型方法。 因此，本文所述的方法可用于从感染的受试者获取的临床样品中对病原体DNA（例如疟疾DNA）进行测序或基因分型。
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公开(公告)号：US20130096009A1
公开(公告)日：2013-04-18
申请号：US13121158
申请日：2009-09-22
申请人： Job Dekker , Erez Lieberman , Nynke Van Berkum , Andreas Gnirke , Eric Lander , Chad Nusbaum , Louise Williams , Alexandre Melnikov , Georgia Giannoukos
发明人： Job Dekker , Erez Lieberman , Nynke Van Berkum , Andreas Gnirke , Eric Lander , Chad Nusbaum , Louise Williams , Alexandre Melnikov , Georgia Giannoukos
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6837 , C12Q1/68
摘要： The disclosed Hi-C protocol can identify genomic loci that are spatially co-located in vivo. These spatial co-locations may include, but are not limited to, intrachromosomal interactions and/or interchromosomal interactions. Hi-C techniques may be applied to many different scales of interest. For example, on a large scale, Hi-C techniques can be used to identify long-range interactions between distant genomic loci.
摘要翻译： 所公开的Hi-C协议可以鉴定空间上位于体内的基因座。 这些空间共位点可以包括但不限于染色体间相互作用和/或染色体间相互作用。 Hi-C技术可以应用于许多不同的感兴趣的尺度。 例如，大规模地，Hi-C技术可用于鉴定远距离基因组基因座之间的长距离相互作用。
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4.发明申请SELECTION OF NUCLEIC ACIDS BY SOLUTION HYBRIDIZATION TO OLIGONUCLEOTIDE BAITS 审中-公开通过解决方案将寡核苷酸杂交选择为核酸公开(公告)号：US20100029498A1
公开(公告)日：2010-02-04
申请号：US12365650
申请日：2009-02-04
申请人： Andreas Gnirke , Chad Nusbaum , Eric S. Lander
发明人： Andreas Gnirke , Chad Nusbaum , Eric S. Lander
IPC分类号： C40B30/04
CPC分类号： C12Q1/6811 , C12Q1/6869 , C12Q2537/101
摘要： Methods of selection of nucleic acids using solution hybridization, methods of sequencing nucleic acids including such selection methods, and products for use in the methods are disclosed.
摘要翻译： 公开了使用溶液杂交法选择核酸的方法，包括这种选择方法的核酸测序方法和用于该方法的产品。
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