公开(公告)号：US20060135556A1

公开(公告)日：2006-06-22

申请号：US10526249

申请日：2003-08-22

申请人： Jean-Luc Girardet ,  Zhijun Zhang ,  Robert Hamatake ,  Martha de la Rosa ,  Esmir Gunic ,  Zhi Hong ,  Hong Kim ,  Yung-Hyo Koh ,  Shahul Nilar ,  Stephanie Shaw ,  Nanhua Yao

发明人： Jean-Luc Girardet ,  Zhijun Zhang ,  Robert Hamatake ,  Martha de la Rosa ,  Esmir Gunic ,  Zhi Hong ,  Hong Kim ,  Yung-Hyo Koh ,  Shahul Nilar ,  Stephanie Shaw ,  Nanhua Yao

IPC分类号： A61K31/4709 ,  A61K31/4196 ,  A61K31/4166

CPC分类号： C07D249/08 ,  A61K31/4196 ,  A61K31/4709 ,  C07D233/84 ,  C07D249/10 ,  C07D401/04 ,  C07D401/12 ,  C07D401/14

摘要： Various carbonyl amides are employed in vitro and in vivo as non-nucleoside inhibitors of a reverse transcriptase, and particularly of HIV reverse transcriptase. Therefore, contemplated compounds may be employed in the treatment of HIV infected patients. Further contemplated aspects include pharmaceutical compositions comprising therapeutically effective amounts of contemplated compounds.

摘要翻译： 各种羰基酰胺在体外和体内被用作逆转录酶的非核苷抑制剂，特别是HIV逆转录酶的非核苷抑制剂。 因此，预期的化合物可用于治疗HIV感染患者。 进一步考虑的方面包括包含治疗有效量的预期化合物的药物组合物。

公开(公告)号：US06653127B1

公开(公告)日：2003-11-25

申请号：US09684881

申请日：2000-10-06

申请人： Bruce A. Malcolm ,  S. Shane Taremi ,  Patricia C. Weber ,  Nanhua Yao

发明人： Bruce A. Malcolm ,  S. Shane Taremi ,  Patricia C. Weber ,  Nanhua Yao

IPC分类号： C12N1574

CPC分类号： C07K14/005 ,  A61K39/00 ,  C07K2319/00 ,  C12N9/506 ,  C12N9/90 ,  C12N2770/24222

摘要： Covalent HCV NS4A-NS3 complexes comprising the central hydrophobic domain of native HCV NS4A peptide, a linker, and the HCV NS3 serine protease domain, wherein the hydrophobic domain of native HCV NS4A peptide is tethered by the linker to the amino terminus of the HCV NS3 protease domain.

摘要翻译： 共价HCV NS4A-NS3复合物，其包含天然HCV NS4A肽的中枢疏水结构域，接头和HCV NS3丝氨酸蛋白酶结构域，其中天然HCV NS4A肽的疏水结构域被连接体连接到HCV NS3的氨基末端 蛋白酶结构域。

公开(公告)号：US06211338B1

公开(公告)日：2001-04-03

申请号：US09198723

申请日：1998-11-24

申请人： Bruce A. Malcolm ,  S. Shane Taremi ,  Patricia C. Weber ,  Nanhua Yao

发明人： Bruce A. Malcolm ,  S. Shane Taremi ,  Patricia C. Weber ,  Nanhua Yao

IPC分类号： C07K1402

CPC分类号： C07K14/005 ,  A61K39/00 ,  C07K2319/00 ,  C12N9/506 ,  C12N9/90 ,  C12N2770/24222

摘要： Covalent HCV NS4A-NS3 complexes comprising the central hydrophobic domain of native HCV NS4A peptide, a linker, and the HCV NS3 serine protease domain, wherein the hydrophobic domain of native HCV NS4A peptide is tethered by the linker to the amino terminus of the HCV NS3 protease domain.

摘要翻译： 共价HCV NS4A-NS3复合物，其包含天然HCV NS4A肽的中枢疏水结构域，接头和HCV NS3丝氨酸蛋白酶结构域，其中天然HCV NS4A肽的疏水结构域被连接体连接到HCV NS3的氨基末端 蛋白酶结构域。

公开(公告)号：US06906190B2

公开(公告)日：2005-06-14

申请号：US10330369

申请日：2002-12-27

申请人： Nanhua Yao ,  Haoyun An ,  Todd Appleby ,  Shahul Nilar ,  Yili Ding ,  Zhi Hong

发明人： Nanhua Yao ,  Haoyun An ,  Todd Appleby ,  Shahul Nilar ,  Yili Ding ,  Zhi Hong

IPC分类号： A61K31/52 ,  C07D473/18 ,  C07D473/16 ,  A61P31/14 ,  C07D473/30 ,  C07D473/34

CPC分类号： C07D473/18 ,  A61K31/52

摘要： A polymerase inhibitor has first moiety coupled to a second moiety via an optional linker in which the first moiety binds to an initiation nucleotide binding site of a polymerase and forms at least two hydrogen bonds with an RNA template strand that is associated with the polymerase, and in which the second moiety comprised a compound that binds to a site proximal to the nucleotide binding site of the polymerase and thereby increases the affinity of the polymerase inhibitor to the polymerase.

摘要翻译： 聚合酶抑制剂具有通过任选的接头与第二部分偶联的第一部分，其中第一部分结合聚合酶的起始核苷酸结合位点，并与与聚合酶相关的RNA模板链形成至少两个氢键，以及 其中第二部分包含结合到聚合酶的核苷酸结合位点附近的位点的化合物，从而增加聚合酶抑制剂对聚合酶的亲和力。

公开(公告)号：US07459296B2

公开(公告)日：2008-12-02

申请号：US09825423

申请日：2001-04-03

申请人： Patricia C. Weber ,  Paul Reichert ,  Vincent S. Madison ,  Daniel F. Wyss ,  Nanhua Yao ,  Dingjiang Liu ,  Jennifer J. Gesell

发明人： Patricia C. Weber ,  Paul Reichert ,  Vincent S. Madison ,  Daniel F. Wyss ,  Nanhua Yao ,  Dingjiang Liu ,  Jennifer J. Gesell

IPC分类号： C12N9/12 ,  C07K14/00 ,  G01N31/00

CPC分类号： C07K14/005 ,  C12N9/90 ,  C12N2770/24222

摘要： This invention provides fragments of HCV NS3 helicase, and crystalline compositions thereof, based on subdomains of HCV helicase protein. The protein fragments are stable, soluble, and structurally sound. They can be expressed at high levels in conventional expressions systems, such as E. coli, to permit efficient, large-scale production for NMR-based screening applications and production of [2H,13C,15N]- and [13C,15N]-labeled polypeptides for structural NMR studies. Helicase fragments of the present invention are useful in the most advanced NMR techniques available, e.g., NMR-based drug discovery techniques such as SAR-by-NMR, in biological assays to discover inhibitors of HCV NS3 helicase, and to evaluate the mechanism of action and substrates for HCV NS3 helicase. Crystals of the present invention are useful for structure-based drug design studies using x-ray crystallographic techniques.

摘要翻译： 本发明基于HCV解旋酶蛋白的亚结构域提供HCV NS3解旋酶的片段及其结晶组合物。 蛋白质片段稳定，可溶，结构合理。 它们可以在常规表达系统如大肠杆菌中以高水平表达，以允许基于NMR的筛选应用的有效的大规模生产和[2H，13C，15N] - 和[13C，15N] - 用于结构NMR研究的标记多肽。 本发明的螺旋酶片段可用于可用的最先进的NMR技术，例如基于NMR的药物发现技术，例如通过核磁共振的核磁共振（NMR），用于发现HCV NS3解旋酶抑制剂的生物测定中，以及评估作用机制 和HCV NS3解旋酶的底物。 本发明的晶体可用于使用x射线晶体学技术的基于结构的药物设计研究。

公开(公告)号：US20080249131A1

公开(公告)日：2008-10-09

申请号：US12114467

申请日：2008-05-02

申请人： Jean-Luc Girardet ,  Zhijun Zhang ,  Robert Hamatake ,  Martha A. De La Rosa ,  Esmir Gunic ,  Zhi Hong ,  Hong Woo Kim ,  Yung-hyo Koh ,  Shahul Nilar ,  Stephanie Shaw ,  Nanhua Yao

发明人： Jean-Luc Girardet ,  Zhijun Zhang ,  Robert Hamatake ,  Martha A. De La Rosa ,  Esmir Gunic ,  Zhi Hong ,  Hong Woo Kim ,  Yung-hyo Koh ,  Shahul Nilar ,  Stephanie Shaw ,  Nanhua Yao

IPC分类号： A61K31/4709 ,  C07D249/10 ,  A61K31/4196 ,  C07D401/10

CPC分类号： C07D249/08 ,  A61K31/4196 ,  A61K31/4709 ,  C07D233/84 ,  C07D249/10 ,  C07D401/04 ,  C07D401/12 ,  C07D401/14

摘要： Various carbonyl amides are employed in vitro and in vivo as non-nucleoside inhibitors of a reverse transcriptase, and particularly of HIV reverse transcriptase. Therefore, contemplated compounds may be employed in the treatment of HIV infected patients. Further contemplated aspects include pharmaceutical compositions comprising therapeutically effective amounts of contemplated compounds.

摘要翻译： 各种羰基酰胺在体外和体内被用作逆转录酶的非核苷抑制剂，特别是HIV逆转录酶的非核苷抑制剂。 因此，预期的化合物可用于治疗HIV感染患者。 进一步考虑的方面包括包含治疗有效量的预期化合物的药物组合物。

公开(公告)号：US06524589B1

公开(公告)日：2003-02-25

申请号：US09543376

申请日：2000-04-05

申请人： Paul Reichert ,  Winifred W. Prosise ,  Shahriar Shane Taremi ,  Nanhua Yao ,  Patricia C. Weber

发明人： Paul Reichert ,  Winifred W. Prosise ,  Shahriar Shane Taremi ,  Nanhua Yao ,  Patricia C. Weber

IPC分类号： A61K3929

CPC分类号： C07K14/005 ,  C07K2299/00 ,  C12N2770/24222

摘要： The invention relates to the purification and crystallization of hepatitis C virus (HCV) NS3/NS4A polypeptide complex. Also, crystallization conditions for NS3/NS4A are provided. Further, the atomic coordinates for the NS3/NS4A protein are disclosed. Examples of its use for the determination of the three-dimensional atomic structures of HCV NS3/NS4A with substrate(s) or substrate analog(s) or inhibitor complexes are also provided.

摘要翻译： 本发明涉及丙型肝炎病毒（HCV）NS3 / NS4A多肽复合物的纯化和结晶。 另外，提供NS3 / NS4A的结晶条件。 此外，公开了NS3 / NS4A蛋白的原子坐标。 还提供了其用于测定具有底物或底物类似物或抑制剂复合物的HCV NS3 / NS4A的三维原子结构的用途。