公开(公告)号：US07970547B2

公开(公告)日：2011-06-28

申请号：US10493304

申请日：2002-11-14

申请人： Ehud Shapiro ,  Yaakov Benenson ,  Rivka Adar ,  Tamar Paz-Elizur

发明人： Ehud Shapiro ,  Yaakov Benenson ,  Rivka Adar ,  Tamar Paz-Elizur

IPC分类号： G06F19/00 ,  C12P19/34 ,  C12Q1/68

CPC分类号： G06N3/002 ,  B82Y10/00 ,  G06N3/123

摘要： A device, system and method for molecular computing which not only includes a suitable, renewable power source, but actually is able to receive power through the performance of the computations themselves. The molecular computing machine of the present invention actually employs the free-energy difference between its input and output to accomplish a computation, preferably by using its input DNA molecule as a partial source of energy, or alternatively by using the input DNA molecule as the sole source of energy. This molecular finite automaton preferably transforms an input DNA molecule into an output DNA molecule by digesting the input as it computes.

摘要翻译： 用于分子计算的装置，系统和方法，其不仅包括合适的可再生能源，而且实际上能够通过执行计算本身来接收能量。 本发明的分子计算机实际上采用其输入和输出之间的自由能差来完成计算，优选地通过使用其输入的DNA分子作为部分能量来源，或者通过使用输入的DNA分子作为唯一的 能量之源。 该分子有限自动机优选通过在计算时消化输入来将输入DNA分子转化为输出DNA分子。

公开(公告)号：US20100197006A1

公开(公告)日：2010-08-05

申请号：US12605040

申请日：2009-10-23

申请人： Yaakov Benenson ,  Ron Weiss ,  Leonidas Bleris ,  Zhen Xie

发明人： Yaakov Benenson ,  Ron Weiss ,  Leonidas Bleris ,  Zhen Xie

IPC分类号： C12N5/10 ,  C12N1/19

CPC分类号： G06N3/002 ,  B82Y10/00 ,  C12N15/10 ,  C12N15/63

摘要： Disclosed herein are autonomous molecular circuits that can function in cells. The circuits can process logical operations in which one or more input cues are among the operands and produce an appropriate output. Such circuits can be implemented in living cells, e.g., eukaryotic or prokaryotic cells that have been modified to include circuit components. The molecular circuits and cells containing the circuits can be used in a variety of applications including, e.g., diagnostics, therapeutics, and protein production.

摘要翻译： 这里公开了可以在细胞中起作用的自主分子电路。 电路可以处理逻辑运算，其中一个或多个输入提示在操作数之间，并产生适当的输出。 这样的电路可以在活细胞中实现，例如已被修饰为包括电路组件的真核细胞或原核细胞。 包含电路的分子电路和细胞可用于多种应用，包括例如诊断，治疗和蛋白质生产。

公开(公告)号：US20050075792A1

公开(公告)日：2005-04-07

申请号：US10493304

申请日：2002-11-14

申请人： Ehud Shapiro ,  Yaakov Benenson ,  Rivka Adar ,  Tamar Paz-Elizur

发明人： Ehud Shapiro ,  Yaakov Benenson ,  Rivka Adar ,  Tamar Paz-Elizur

IPC分类号： C12Q20060101 ,  G01N33/48 ,  G01N33/50 ,  G06F9/44 ,  G06F13/10 ,  G06F13/12 ,  G06N3/00 ,  G06N3/12 ,  G06F19/00

CPC分类号： G06N3/002 ,  B82Y10/00 ,  G06N3/123

摘要： A device, system and method for molecular computing which not only includes a suitable, renewable power source, but actually is able to receive power through the performance of the computations themselves. The molecular computing machine of the present invention actually employs the free-energy difference between its input and output to accomplish a computation, preferably by using its input DNA molecule as a partial source of energy, or alternatively by using the input DNA molecule as the sole source of energy. This molecular finite automaton preferably transforms an input DNA molecule into an output DNA molecule by digesting the input as it computes.

摘要翻译： 用于分子计算的装置，系统和方法，其不仅包括合适的可再生能源，而且实际上能够通过执行计算本身来接收能量。 本发明的分子计算机实际上采用其输入和输出之间的自由能差来完成计算，优选地通过使用其输入的DNA分子作为部分能量来源，或者通过使用输入的DNA分子作为唯一的 能量之源。 该分子有限自动机优选通过在计算时消化输入来将输入DNA分子转化为输出DNA分子。

公开(公告)号：US09458509B2

公开(公告)日：2016-10-04

申请号：US13811126

申请日：2011-07-22

申请人： Yaakov Benenson ,  Ron Weiss ,  Liliana Wroblewska ,  Zhen Xie

发明人： Yaakov Benenson ,  Ron Weiss ,  Liliana Wroblewska ,  Zhen Xie

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N15/63 ,  G06F19/20 ,  G06F19/24

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12N15/111 ,  C12N15/63 ,  C12Q1/6897 ,  G06F19/20 ,  G06F19/24 ,  C12Q2525/207

摘要： Provided herein are high-input detector modules and multi-input biological classifier circuits and systems that integrate sophisticated sensing, information processing, and actuation in living cells and permit new directions in basic biology, biotechnology and medicine. The multi-input biological classifier circuits described herein comprise synthetic, scaleable transcriptional/post-transcriptional regulatory circuits that are designed to interrogate the status of a cell by simultaneously sensing expression levels of multiple endogenous inputs, such as microRNAs. The classifier circuits then compute whether to trigger a desired output or response if the expression levels match a pre-determined profile of interest.

摘要翻译： 这里提供了高输入检测器模块和多输入生物分类器电路和系统，其将生物细胞中的复杂的感测，信息处理和致动集成，并允许在基础生物学，生物技术和医学方面的新方向。 本文描述的多输入生物分类器电路包括合成的，可缩放的转录/转录后调控电路，其设计成通过同时检测多种内源性输入（例如微小RNA）的表达水平来询问细胞的状态。 分类器电路然后计算是否触发期望的输出或响应，如果表达级别匹配预先确定的感兴趣的分布。

公开(公告)号：US20130202532A1

公开(公告)日：2013-08-08

申请号：US13811126

申请日：2011-07-22

申请人： Yaakov Benenson ,  Ron Weiss ,  Liliana Wroblewska ,  Zhen Xie

发明人： Yaakov Benenson ,  Ron Weiss ,  Liliana Wroblewska ,  Zhen Xie

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12N15/111 ,  C12N15/63 ,  C12Q1/6897 ,  G06F19/20 ,  G06F19/24 ,  C12Q2525/207

摘要： Provided herein are high-input detector modules and multi-input biological classifier circuits and systems that integrate sophisticated sensing, information processing, and actuation in living cells and permit new directions in basic biology, biotechnology and medicine. The multi-input biological classifier circuits described herein comprise synthetic, scaleable transcriptional/post-transcriptional regulatory circuits that are designed to interrogate the status of a cell by simultaneously sensing expression levels of multiple endogenous inputs, such as microRNAs. The classifier circuits then compute whether to trigger a desired output or response if the expression levels match a pre-determined profile of interest.

摘要翻译： 这里提供了高输入检测器模块和多输入生物分类器电路和系统，其将生物细胞中的复杂的感测，信息处理和致动集成，并允许在基础生物学，生物技术和医学方面的新方向。 本文描述的多输入生物分类器电路包括合成的，可缩放的转录/转录后调控电路，其设计成通过同时检测多种内源性输入（例如微小RNA）的表达水平来询问细胞的状态。 分类器电路然后计算是否触发期望的输出或响应，如果表达级别匹配预先确定的感兴趣的分布。

公开(公告)号：US20070299645A1

公开(公告)日：2007-12-27

申请号：US11587754

申请日：2005-05-01

申请人： Ehud Shapiro ,  Yaakov Benenson ,  Binyamin Gil ,  Uri Ben-Dor ,  Rivka Adar

发明人： Ehud Shapiro ,  Yaakov Benenson ,  Binyamin Gil ,  Uri Ben-Dor ,  Rivka Adar

IPC分类号： G06G7/48

CPC分类号： G06N3/123 ,  B82Y10/00

摘要： An autonomous molecular computer that, when coupled to a molecular model of a disease, is capable of disease diagnosis. The computer preferably performs such diagnosis by detecting one or more disease markers. For example, optionally and preferably the molecular computer checks for the presence of over-expressed, under-expressed and mutated genes, applies programmed medical knowledge to this information to reach a diagnostic decision.

摘要翻译： 一种自主分子计算机，当与疾病的分子模型相耦合时，能够进行疾病诊断。 计算机优选地通过检测一种或多种疾病标记进行这种诊断。 例如，可选地且优选地，分子计算机检查是否存在过表达的，低表达的和突变的基因，将编程的医学知识应用于该信息以达到诊断决定。