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    COMPOSITIONS AND METHODS FOR PRODUCING CHEMICALS AND DERIVATIVES THEREOF
    1.
    发明申请
    COMPOSITIONS AND METHODS FOR PRODUCING CHEMICALS AND DERIVATIVES THEREOF 审中-公开
    用于生产化学品及其衍生物的组合物和方法

    公开(公告)号：WO2015143381A2

    公开(公告)日：2015-09-24

    申请号：PCT/US2015/021848

    申请日：2015-03-20

    申请人： SYNTHETIC GENOMICS, INC.

    发明人： KAMBOURAKIS, Spiros ,  GRIFFIN, Benjamin, M. ,  MARTIN, Kevin, V.

    IPC分类号： C12P7/58 ,  C12P17/04

    CPC分类号： C12P7/58 ,  C12P7/44 ,  C12P17/06

    摘要： The present invention provides methods for producing a product of one or more enzymatic pathways. The pathways used in the methods of the invention involve one or more conversion steps such as, for example, an enzymatic conversion of guluronic acid into D-glucarate (Step 7); an enzymatic conversion of 5-ketogluconate (5-KGA) into L-Iduronic acid (Step 15); an enzymatic conversion of L-Iduronic acid into Idaric acid Step 7b); and an enzymatic conversion of 5-ketocluconate into 4,6-dihydroxy 2,5-diketo hexanoate (2,5-DDH) (Step 16). In some embodiments the methods of the invention produce 2,5-furandicarboxylic acid (FDCA) as a product. The methods include both enzymatic and chemical conversions as steps. Various pathways are also provided for converting glucose into 5-dehdyro-4-deoxy-glucarate (DDG), and for converting glucose into 2,5-furandicarboxylic acid (FDCA). The methods also involve the use of engineered enzymes that perform reactions with high specificity and efficiency. Additional products that can be produce include metabolic products such as, but not limited to, guluronic acid, L-iduronic acid, idaric acid, glucaric acid. Any of the products can be produced using glucose as a substrate or using any intermediate in any of the methods or pathways of the invention.

    摘要翻译： 本发明提供了生产一种或多种酶途径的产物的方法。 用于本发明方法的途径包括一个或多个转化步骤，例如将古罗糖醛酸酶促转化成D-葡糖二酸（步骤7）; 将5-酮葡萄糖酸（5-KGA）酶促转化成L-阿魏酸（步骤15）; 步骤7b）中L-赖康酸转化成Idaric酸的酶促转化; 并将5-酮基葡萄糖酸酯酶促转化成4,6-二羟基2,5-二酮己酸酯（2,5-DDH）（步骤16）。 在一些实施方案中，本发明的方法产生作为产物的2,5-呋喃二羧酸（FDCA）。 所述方法包括作为步骤的酶和化学转化。 还提供了将葡萄糖转化为5-脱氢-4-脱氧葡糖二酸（DDG）和将葡萄糖转化为2,5-呋喃二羧酸（FDCA）的各种途径。 该方法还涉及使用以高特异性和高效率进行反应的工程化酶。 可以生产的其它产品包括代谢产物，例如但不限于古洛糖醛酸，L-艾杜糖醛酸，id酸，葡糖二酸。 可以使用葡萄糖作为底物或在本发明的任何方法或途径中使用任何中间体来生产任何产物。

    MANUFACTURE OF XYLONIC ACID
    4.
    发明申请
    MANUFACTURE OF XYLONIC ACID 审中-公开
    制备方法

    公开(公告)号：WO2010106230A1

    公开(公告)日：2010-09-23

    申请号：PCT/FI2010/050205

    申请日：2010-03-17

    申请人： VALTION TEKNILLINEN TUTKIMUSKESKUS ,  RICHARD, Peter ,  WIEBE, Marilyn ,  TOIVARI, Mervi ,  MOJZITA, Dominik ,  RUOHONEN, Laura ,  PENTTILÄ, Merja

    发明人： RICHARD, Peter ,  WIEBE, Marilyn ,  TOIVARI, Mervi ,  MOJZITA, Dominik ,  RUOHONEN, Laura ,  PENTTILÄ, Merja

    IPC分类号： C12P7/58 ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N9/04 ,  C12N15/53

    CPC分类号： C12P7/58 ,  C12N9/0006

    摘要： The invention provides a method for producing xylonic acid from xylose with a recombinant fungal strain that is genetically modified to express a xylose dehydrogenase gene, which is able to convert xylose to xylonolactone, which is spontaneously or enzymatically hydrolysed to xylonic acid. The xylonic acid is excreted outside the host cell. Xylonate production may be coupled with xylitol production. Alternatively, if xylitol production is not desired, its production is reduced by removing the aldose reductase (or specific xylose reductase) enzyme, which converts xylose to xylitol. Expression of a heterologous lactonase encoding gene may result in higher acid concentrations. The method is especially suitable for producing xylonic acid from a hemicelluiose hydrolysate such as hydrolysed lignocellulosic plant biomass.

    摘要翻译： 本发明提供了一种从木糖中生产木糖的方法，该重组真菌菌株被遗传修饰以表达木糖脱氢酶基因，其能够将木糖转化为己内酰胺，其自发或酶促水解成木糖酸。 木糖酸在宿主细胞外排出。 木糖苷生产可能与木糖醇生产相结合。 或者，如果不需要木糖醇生产，则通过除去将木糖转化为木糖醇的醛糖还原酶（或特异性木糖还原酶）酶来降低其产生。 异源内含子编码基因的表达可能导致较高的酸浓度。 该方法特别适用于从半纤维素水解产物如水解的木质纤维素植物生物质生产木糖酸。

    L-アラビノースをα－ケトグルタル酸に変換する方法、この方法に使用する酵素、該酵素をコードする遺伝子、該遺伝子を含む組換え微生物
    6.
    发明申请
    L-アラビノースをα－ケトグルタル酸に変換する方法、この方法に使用する酵素、該酵素をコードする遺伝子、該遺伝子を含む組換え微生物 审中-公开
    将L-阿拉伯糖苷转化成乙酸的方法，该方法中使用的酶，编码包含基因的酶和重组微生物的基因

    公开(公告)号：WO2007046417A1

    公开(公告)日：2007-04-26

    申请号：PCT/JP2006/320744

    申请日：2006-10-18

    申请人： 信和化工株式会社 ,  国立大学法人京都大学 ,  牧野 圭祐 ,  小瀧 努 ,  渡邉 誠也 ,  和田 啓男

    发明人： 牧野 圭祐 ,  小瀧 努 ,  渡邉 誠也 ,  和田 啓男

    IPC分类号： C12N15/09 ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N5/10 ,  C12N9/04 ,  C12N9/18 ,  C12N9/88 ,  C12P7/50 ,  C12P7/52

    CPC分类号： C12N9/88 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/18 ,  C12P7/50 ,  C12P7/58

    摘要： 　L-アラビノースをα－ケトグルタル酸に変換する方法、使用する酵素、該酵素をコードする遺伝子、該遺伝子により形質転換した組換え微生物を提供する。 　以下の工程を含むL-アラビノースをα－ケトグルタル酸に変換する方法。 （Ａ）L-アラビノースをL-アラビノ－γ－ラクトンに変換し、（Ｂ）これをL-アラボネートに変換し、（Ｃ）これをL-２－ケト－３－デオキシアラボネートに変換し、（Ｄ）これをα－ケトグルタル酸セミアルデヒドに変換し、及び（Ｅ）これをα－ケトグルタル酸に変換する工程；L-アラビノース－１－脱水素酵素、L-アラビノラクトナーゼ、L-アラボネート脱水酵素、L-２－ケト－３－デオキシアラボネート脱水酵素、及びα－ケトグルタル酸セミアルデヒド脱水素酵素；上記酵素コードする遺伝子、該遺伝子を含むベクター、該ベクターにより形質転換された酵母。

    摘要翻译： 旨在提供将L-阿拉伯糖转化成α-酮戊二酸的方法; 其中使用的酶; 编码酶的基因; 和已被基因转化的重组微生物。 即，将L-阿拉伯糖转化为α-酮戊二酸的方法，其包括将L-阿拉伯糖转化为L-阿拉伯糖-β-内酯的步骤（A），（B）将其转化成L-阿拉伯糖酸酯，（C）将其转化为 （D）将其转化为α-酮戊二醛半醛，（E）将其转化为α-酮戊二酸;（D）将其转化为α-酮戊二酸， L-阿拉伯糖-1-脱氢酶，L-阿拉伯糖乳酸酶，L-阿拉伯糖酸脱氢酶，L-2-酮-3-脱氧糖尿酸酯脱水酶和α-酮戊二醛半醛脱氢酶; 编码上述酶的基因; 含有该基因的载体; 和已经通过载体转化的酵母。

    BACTERIAL SYNTHESIS OF 1,2,4-BUTANETRIOL ENANTIOMERS
    7.
    发明申请
    BACTERIAL SYNTHESIS OF 1,2,4-BUTANETRIOL ENANTIOMERS 审中-公开
    1,2,4-丁二烯类化合物的细菌合成

    公开(公告)号：WO2005068642A3

    公开(公告)日：2005-12-15

    申请号：PCT/US2004031997

    申请日：2004-09-30

    申请人： UNIV MICHIGAN STATE ,  FROST JOHN W

    发明人： FROST JOHN W

    IPC分类号： C06B25/10 ,  C07C31/22 ,  C12N9/04 ,  C12N9/88 ,  C12P7/18 ,  C12P7/58 ,  C12N15/60

    CPC分类号： C12N9/88 ,  C06B25/10 ,  C07C31/22 ,  C12N9/0006 ,  C12P7/18 ,  C12P7/58

    摘要： A bioengineered synthesis scheme for the production of L-1,2,4-butanetriol, D-1,2,4-butanetriol and racemic mixtures thereof from a carbon source is provided. Methods of producing L-1,2,4-butanetriol, D-1,2,4-butanetriol and racemic mixtures thereof are also provided. Methods are also provided for converting D-1,2,4-butanetriol and L-1,2,4,-butanetriol to D,L-1,2,4-butanetriol trinitrate.

    摘要翻译： 提供了用于从碳源生产L-1,2,4-丁三醇，D-1,2,4-丁三醇及其外消旋混合物的生物工程化合成方案。 还提供了生产L-1,2,4-丁三醇，D-1,2,4-丁三醇及其外消旋混合物的方法。 还提供了将D-1,2,4-丁三醇和L-1,2,4丁烷三醇转化为D，L-1,2,4-丁三醇三硝酸酯的方法。

    METHODS AND FUNGAL STRAINS FOR PYRANOSONE PRODUCTION
    9.
    发明申请
    METHODS AND FUNGAL STRAINS FOR PYRANOSONE PRODUCTION 审中-公开
    吡咯烷酮生产的方法和真菌菌株

    公开(公告)号：WO1987004460A1

    公开(公告)日：1987-07-30

    申请号：PCT/US1986000082

    申请日：1986-01-16

    申请人： CETUS CORPORATION

    发明人： CETUS CORPORATION ,  KOTHS, Kirston, E. ,  HALENBECK, Robert, F. ,  FERNANDES, Peter, M. ,  RING, David, B.

    IPC分类号： C12N09/04

    CPC分类号： C12N9/0006 ,  C12P7/58 ,  C12P19/02

    摘要： Substantially pure pyranose-2-oxidase preparations which are substantially free of glucosone-utilizing enzyme contaminants, including pyranosone dehydratase activity, which have measurable activity at a selected pH between about 4.4 and 7.0 prepared from mycelia of Polyporus obtusus, Coriolus versicolor and Lenzites betulinus. The enzymes are used in the production of pure pyranosones from the corresponding pyranose.

    摘要翻译： 基本上没有使用葡萄糖的酶污染物的基本上纯的吡喃糖-2-氧化酶制剂，包括吡喃酮脱水酶活性，其在从多孔from属，Coriolus versicolor和Lenzites betulinus的菌丝体制备的约4.4和7.0之间的选定pH下具有可测量的活性。 酶用于从相应的吡喃糖生产纯的吡喃糖酮。

    SYNTHESIS OF FDCA AND FDCA PRECURSORS FROM GLUCONIC ACID DERIVATIVES
    10.
    发明申请
    SYNTHESIS OF FDCA AND FDCA PRECURSORS FROM GLUCONIC ACID DERIVATIVES 审中-公开
    来自GLUCONIC酸性衍生物的FDCA和FDCA前体的合成

    公开(公告)号：WO2017030668A1

    公开(公告)日：2017-02-23

    申请号：PCT/US2016/040983

    申请日：2016-07-05

    申请人： SYNTHETIC GENOMICS, INC.

    发明人： KAMBOURAKIS, Spiros ,  GRIFFIN, Benjamin, M.

    IPC分类号： C12P17/04 ,  C12P7/58

    CPC分类号： C07D307/68 ,  C12P7/58 ,  C12P17/04

    摘要： The present invention provides methods of method of synthesizing 2,5-furan dicarboxylic acid (FDCA) and FDCA precursor molecules. The methods involve performing a chemical dehydration reaction on a gluconic acid derivative in the presence of a dehydration catalyst. In some embodiments the gluconic acid derivative can be 2-dehydro-3-deoxy gluconic acid (DHG) or an ester thereof, 2-ketogluconic acid (2KGA) or an ester thereof, and 5- ketogluconic acid (5KGA) or an ester thereof. The 2,5-furan dicarboxylic acid precursor molecule is thereby synthesized, which can be converted into FDCA. The chemical dehydration can be performed by a variety of acid basic catalysts.

    摘要翻译： 本发明提供了合成2,5-呋喃二羧酸（FDCA）和FDCA前体分子的方法。 所述方法包括在脱水催化剂存在下在葡萄糖酸衍生物上进行化学脱水反应。 在一些实施方案中，葡萄糖酸衍生物可以是2-脱氢-3-脱氧葡萄糖酸（DHG）或其酯，2-酮基葡萄糖酸（2KGA）或其酯，和5-酮基葡萄糖酸（5KGA）或其酯 。 由此合成了2,5-呋喃二羧酸前体分子，可以将其转化为FDCA。 化学脱水可以通过各种酸性碱性催化剂进行。