本发明公开了一种大型船舶复合式脱硫装置及脱硫方法，由闭式脱硫循环回路和开式脱硫循环回路构成；其中，海水通过海水供给泵一路通往循环水舱，另一路经循环水冷却器排至舷外；碱液舱与循环水舱连通，且循环水舱的清洗液，一路经循环水冷却器分别进入脱硫塔的高温喷淋区和低温喷淋区，另一路通往水处理单元；脱硫塔的清洗液经排液口通往循环水舱；水处理单元的清洗液一路通往污水舱，另一路通往零排放舱，可再利用清洗液返回至循环水舱，形成闭式脱硫循环回路；海水通过海水供给泵分别进入脱硫塔的高温喷淋区和低温喷淋区，再经排液口排至舷外，形成开式脱硫循环回路。本发明利用船舶空间及结构，减少成本，简化工艺，提高了安全系数。