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    一种鸢尾属部分种的系统分类方法
    11.
    发明公开
    一种鸢尾属部分种的系统分类方法 审中-公开

    公开(公告)号：CN116904563A

    公开(公告)日：2023-10-20

    申请号：CN202310053956.7

    申请日：2023-02-03

    申请人： 四川农业大学

    发明人： 余小芳 ,  曾小轩 ,  冯艺玫 ,  王志文 ,  刘羽佳 ,  樊春雨 ,  周永红 ,  高素萍 ,  李西 ,  杨丽娟 ,  雷霆 ,  江明艳

    IPC分类号： C12Q1/686 ,  C12Q1/6895 ,  G16B30/10 ,  G16B10/00 ,  G16B20/30

    摘要： 本发明属于植物资源保护与利用技术领域，公开了一种鸢尾属部分种的系统分类方法，利用叶绿体基因matK、核基因ITS对27种鸢尾属植物和3种鸢尾科植物进行测序，结合在GeneBank中收集到的鸢尾属植物的相关序列，并利用软件MEGA6.0构建系统发育树，分析鸢尾属植物种间的亲缘关系，重新界定争议种的分类地位以及鸢尾属植物的系统分类。本发明结合了核基因ITS和叶绿体基因matK来进行分析，从而为建立完整的鸢尾属植物系统发育理论奠定基础，为今后该属种质资源的分析及改良提供相应的参考。本发明为赵毓棠的分类系统和争议种提供分子生物学证据，同时为种质资源的保护和育种提供基础资料。

    一种金钗石斛发尼基焦磷酸合酶Dn-FPPS及其编码基因与应用
    12.
    发明公开
    一种金钗石斛发尼基焦磷酸合酶Dn-FPPS及其编码基因与应用 审中-公开

    公开(公告)号：CN116590318A

    公开(公告)日：2023-08-15

    申请号：CN202211149953.5

    申请日：2022-09-21

    申请人： 中国医学科学院药用植物研究所

    发明人： 李标 ,  龚道勇

    IPC分类号： C12N15/54 ,  C12N15/10 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10 ,  G16B10/00 ,  G16B15/20 ,  C12N9/10 ,  C12P5/02

    摘要： 本发明设计属于基因工程技术领域，具体涉及到一种金钗石斛发尼基焦磷酸合酶基因Dn‑FPPS及其编码产物与应用。利用金钗石斛转录组数据，从中挖掘出一条发尼基焦磷酸合酶基因；利用聚合酶链式反应、cDNA末端快速克隆(RACE)以及同源重组等技术，获得了该基因序列。随后对该序列进行了生物信息学以及生理生化指标等分析。向大肠杆菌感受态细胞DH5α中转入所述的金钗石斛发尼基焦磷酸合酶基因Dn‑FPPS，在宿主大肠杆菌细胞DE3中表达金钗石斛发尼基焦磷酸合酶；利用GC‑MS分析产物，发现金钗石斛发尼基焦磷酸合酶可以使异戊烯焦磷酸(IPP)与二甲基烯丙基焦磷酸(DMAPP)缩合形成β‑发尼烷。

    一种大白菜根肿病根际细菌群落的鉴定方法
    13.
    发明公开
    一种大白菜根肿病根际细菌群落的鉴定方法 审中-公开

    公开(公告)号：CN116240299A

    公开(公告)日：2023-06-09

    申请号：CN202211725200.4

    申请日：2022-12-25

    申请人： 山东大学 ,  德州迈科生物技术有限公司 ,  青岛和协生物科技有限公司

    发明人： 王涵 ,  倪海平 ,  涂强 ,  卞小莹 ,  张友明 ,  武玉侠 ,  李亦放

    IPC分类号： C12Q1/689 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11 ,  G16B10/00 ,  G16B40/00

    摘要： 本发明公开了一种大白菜根肿病根际细菌群落的鉴定方法，所述方法包括以下步骤：S1、样品采集；S2、土壤指标测定：对土壤样品进行pH值、水溶性盐、有机质、土壤全氮、土壤碱解氮、土壤全磷、土壤有效磷、土壤全钾、土壤速效钾、土壤微生物量碳氮磷等指标进行测定；S3、DNA的分离；S4、DNA测序：根据标准方法，在Illumina Miseq平台上执行Illumina Miseq双末端测序过程，原始数据使用Trimmomatic进行质量控制，同时使用FLASH进行序列合并，序列数据上传于NCBI中；S5、统计分析：所得数据用平均值±标准差表示，并用SPSS 20.0软件进行数据分析。本发明借助高通量测序技术，通过鉴定根肿病感染土壤的微生物组成，揭示了与根肿病发生相关的土壤微生物群落的组成和结构，可用于预测根肿病的发生，并为其生物防治开发潜在的工程菌提供数据支撑。

    一种育种材料家系内亲缘关系计算方法及系统
    15.
    发明公开
    一种育种材料家系内亲缘关系计算方法及系统 有权

    公开(公告)号：CN114464248A

    公开(公告)日：2022-05-10

    申请号：CN202210377214.5

    申请日：2022-04-12

    申请人： 北京市农林科学院信息技术研究中心

    发明人： 赵向宇 ,  王开义 ,  刘忠强 ,  韩焱云

    IPC分类号： G16B10/00

    摘要： 本发明提供一种育种材料家系内亲缘关系计算方法及系统，包括：获取育种材料信息，由所述育种材料信息构建育种材料数据集；扩充所述育种材料数据集，遍历更新扩充后的育种材料数据集，得到育种材料更新数据集；从所述育种材料更新数据集中确定目标材料，计算得到所述目标材料的家系内亲缘关系。本发明通过计算农作物育种材料家系内亲缘关系，实现自动的品种选育过程分析，可以辅助育种工作者识别材料家系信息、解析品种亲缘关系、查找近似品种以及优化品种选育方案等。

    一种鉴定家养绵羊是否含有盘羊血缘的方法
    18.
    发明授权
    一种鉴定家养绵羊是否含有盘羊血缘的方法 失效

    公开(公告)号：CN107766698B

    公开(公告)日：2021-10-01

    申请号：CN201710847511.0

    申请日：2017-09-19

    申请人： 四川省草原科学研究院

    发明人： 周明亮 ,  杨平贵 ,  陈明华 ,  庞倩

    IPC分类号： G16B30/00 ,  G16B20/20 ,  G16B10/00 ,  C12Q1/6888

    摘要： 本发明属于基因工程技术领域，公开了一种鉴定家养绵羊是否含有盘羊血缘的方法。包括：个体DNA提取；Primer 5.0软件设计包含绵羊mtDNA D‑Loop序列的引物，以提取的DNA为模板，进行PCR扩增；扩增的PCR产物测序，DNAstar软件对测序结果进行整理、拼接、组装；从NCBI数据库中下载家养绵羊mtDNA D‑loop单倍型A和B的序列及摩弗仑羊、东方盘羊、羱羊、盘羊维式亚种、盘羊哈萨克斯坦亚种、盘羊蒙古亚种、盘羊西藏亚种和盘羊指名亚种的序列；ClustalW软件对以上序列进行多重比对，Mega 6.06的Neighbor‑Joining程序构建进化关系树，以此准确鉴定。

    一种基于宏基因组学分析精准识别水体中未知微生物群落的方法
    19.
    发明公开
    一种基于宏基因组学分析精准识别水体中未知微生物群落的方法 有权

    公开(公告)号：CN112786102A

    公开(公告)日：2021-05-11

    申请号：CN202110099309.0

    申请日：2021-01-25

    申请人： 北京大学

    发明人： 陈倩 ,  钟浩辉 ,  刘树枫 ,  倪晋仁

    IPC分类号： G16B10/00 ,  G16B20/00 ,  G16B50/10 ,  G16B50/00 ,  G16B40/00

    摘要： 本发明公开了一种基于宏基因组学分析精准识别水体中未知微生物群落的方法，所述方法包括步骤(1)自水样提取宏基因组DNA；(2)DNA测序；(3)根据目标群落选择性构建参考数据库；(4)对测序数据进行组装获得组装数据；(5)对组装数据进行分箱；(6)对分箱数据进行质量测试，标记MAGs的质量，并计算测序深度；(7)根据构建的参考数据库对组装数据进行注释；(8)对MAGs做进化关系分析，进而做出宏基因组群落结构分析。本发明不依赖更新速度较慢的大型软件配套数据库，适合处理未知物种较多的样本，且可检测极低丰度物种，检测全面、快速。