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公开(公告)号：CN106834286A
公开(公告)日：2017-06-13
申请号：CN201710218530.7
申请日：2017-04-05
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
摘要： 本发明公开了一步法快速构建扩增子文库的引物组合，其包括：根据目标扩增子设计的上游融合引物，所述上游融合引物包括第一接头序列和根据目标扩增子设计的特异性上游引物序列；根据目标扩增子设计的下游融合引物，所述下游融合引物包括第二接头序列和根据目标扩增子设计的特异性下游引物序列；上游通用引物，所述上游通用引物包括第三接头序列、barcode序列和第一接头序列；和下游通用引物，所述下游通用引物包括通用序列和第二接头序列。运用该融合引物组合可以简便、快速的经1步构建扩增子文库，且由于在PCR起始前就引入barcode，使得样本及文库间交叉污染的可能性大大降低。
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公开(公告)号：CN113817822B
公开(公告)日：2024-02-13
申请号：CN202010564746.0
申请日：2020-06-19
申请人： 中国医学科学院肿瘤医院 , 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , G16B30/00
摘要： 本发明公开了一种基于甲基化检测的肿瘤诊断试剂盒及其应用。本发明建立了一种基于低深度全基因组测序的肿瘤预测指标，即低深度全基因组甲基化特征，依据低深度全基因组甲基化特征，可以在肿瘤/非肿瘤样本中，通过随机森林算法建立预测模型，实现肿瘤样本的早期筛查。本发明的肿瘤预测指标具有很好的实用性和广泛的应用前景。
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公开(公告)号：CN111304299B
公开(公告)日：2022-04-26
申请号：CN201911270317.6
申请日：2019-12-11
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6851 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种用于检测常染色体拷贝数变异的引物组合、试剂盒和方法。本发明首先提供了用于检测常染色体拷贝数变异的引物组合，包括：Barcode引物、上游引物、下游外引物和下游内引物。本发明进一步公开了检测常染色体拷贝数变异的方法。本发明以逆转座子区域为扩增特定目标区域，通过设计有限的一到几对引物就可以覆盖这些区域对全基因组进行富集，就可以真正的反应不同染色体各区域的拷贝数水平，结合一步法构建扩增子文库，杜绝样本污染，使得本发明检测常染色体拷贝数变异具有操作简单、高灵敏度、高准确性以及低成本的特点，可真正实现染色体拷贝数检测方法在实际检测中的应用。
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公开(公告)号：CN110904225B
公开(公告)日：2022-04-12
申请号：CN201911131771.3
申请日：2019-11-19
申请人： 中国医学科学院肿瘤医院 , 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , G16B20/00
摘要： 本发明公开了用于肝癌检测的组合标志物及其应用。用于肝癌检测的组合标志物包括AK055957、BDH1、C6orf223、DAB2IP、F12、GRASP、LRRC4、NFIX、OPLAH、PPFIA1、PSD4和TBX15的甲基化程度。实验证明，通过检测本发明提供的组合标志物可以判断待测肝脏组织的基因组DNA或血浆cfDNA来源于肝癌患者还是非肝癌患者，具有较高的准确性。本发明具有重要的应用价值。
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公开(公告)号：CN111304299A
公开(公告)日：2020-06-19
申请号：CN201911270317.6
申请日：2019-12-11
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6851 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种用于检测常染色体拷贝数变异的引物组合、试剂盒和方法。本发明首先提供了用于检测常染色体拷贝数变异的引物组合，包括：Barcode引物、上游引物、下游外引物和下游内引物。本发明进一步公开了检测常染色体拷贝数变异的方法。本发明以逆转座子区域为扩增特定目标区域，通过设计有限的一到几对引物就可以覆盖这些区域对全基因组进行富集，就可以真正的反应不同染色体各区域的拷贝数水平，结合一步法构建扩增子文库，杜绝样本污染，使得本发明检测常染色体拷贝数变异具有操作简单、高灵敏度、高准确性以及低成本的特点，可真正实现染色体拷贝数检测方法在实际检测中的应用。
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公开(公告)号：CN106835292B
公开(公告)日：2019-04-09
申请号：CN201710218529.4
申请日：2017-04-05
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
摘要： 本发明公开了一步法快速构建扩增子文库的方法，包括以下步骤：1、合成用于构建DNA样品的扩增子文库的引物组合，所述用于构建DNA样品的扩增子文库的引物组合包括：根据目标扩增子设计的上游融合引物，根据目标扩增子设计的下游融合引物，上游通用引物和下游通用引物；2、构建DNA样品的PCR反应体系；3、进行PCR。运用该方法可以简便、快速的经1步构建扩增子文库，且由于在PCR起始前就引入barcode，使得样本及文库间交叉污染的可能性大大降低。
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公开(公告)号：CN106434941A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201610913004.8
申请日：2016-10-19
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/686 , C12Q2600/118 , C12Q2600/156 , C12Q2600/158 , C12Q2563/107
摘要： 本发明公开了一种检测人类EGFR基因突变的试剂盒、反应体系及方法，该试剂盒包括：上游引物、下游引物、检测L858R突变的荧光探针和检测野生型的荧光探针。该试剂盒针对EGFR基因L858R突变设计了特定序列的引物对和特定序列的探针，在优化的反应体系中通过digital PCR平台的方法，实现对EGFR基因L858R突变的高灵敏度检测，并且在检测L858R突变的阴阳性的同时还可以获得样本中该突变的比例，进一步的本申请中可检测的样本来源多样，既可以是肿瘤组织，也可以是ctDNA，扩大了该试剂盒、反应体系和方法的使用范围。
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