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公开(公告)号：CN106834286B
公开(公告)日：2020-02-21
申请号：CN201710218530.7
申请日：2017-04-05
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
摘要： 本发明公开了一步法快速构建扩增子文库的引物组合，其包括：根据目标扩增子设计的上游融合引物，所述上游融合引物包括第一接头序列和根据目标扩增子设计的特异性上游引物序列；根据目标扩增子设计的下游融合引物，所述下游融合引物包括第二接头序列和根据目标扩增子设计的特异性下游引物序列；上游通用引物，所述上游通用引物包括第三接头序列、barcode序列和第一接头序列；和下游通用引物，所述下游通用引物包括通用序列和第二接头序列。运用该融合引物组合可以简便、快速的经1步构建扩增子文库，且由于在PCR起始前就引入barcode，使得样本及文库间交叉污染的可能性大大降低。
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公开(公告)号：CN107604045A
公开(公告)日：2018-01-19
申请号：CN201710976835.4
申请日：2017-10-19
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06 , C40B40/06
摘要： 本发明公开了一种用于检测目的基因低频突变的扩增子文库的构建方法。本发明提供了一种用于检测目的基因低频突变的扩增子文库的构建方法，包括如下步骤：1)设计合成Barcode引物F1、上游引物F2、下游外引物R1、下游内引物R2；2)用所述Barcode引物F1、所述上游引物F2、所述下游外引物R1和所述下游内引物R2对待测样本cfDNA进行一步PCR扩增，得到扩增产物，即为用于扩增子测序的DNA文库。该方法除能检测组织样本外，还能够快速、简便、灵敏、特异的对血液、尿液以及脑脊液等样本中游离DNA的不同区域进行靶向扩增，并高效检测低至0.1％水平的突变，大大的简化实验操作，有效避免文库损失及污染，显著降低成本，提高效率。
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公开(公告)号：CN116200461A
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310269589.4
申请日：2023-03-15
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/6886 , C40B50/06 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了用于同时检测脑肿瘤多种基因变异类型的文库构建方法及其所用组合物与应用。本发明所建立的测序文库构建方法为一步法建库，将DNA突变和RNA融合放在一个PCR反应体系中；并将焦磷酸检测MGMT和FISH检测CNV优化成扩增子一步法，可以同时检测DNA水平的突变和RNA水平的融合；而且文库构建之后，不需要QPCR定量，只需要Qubit定量之后直接上机测序操作简单。可应用于快速、简便、准确检测脑肿瘤基础项。
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公开(公告)号：CN115074422A
公开(公告)日：2022-09-20
申请号：CN202110263664.7
申请日：2021-03-11
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/686 , C12Q1/6869
摘要： 本发明公开了一种未知融合基因的检测方法。本发明所要保护的构建未知融合基因检测文库的方法，包括将样本的总RNA在逆转录体系中进行逆转录或将所述总RNA片段化后在逆转录体系中进行逆转录获得逆转录产物；将所得逆转录产物在第一轮扩增体系中进行PCR扩增，获得第一轮PCR扩增产物，所述第一轮扩增体系含有TSO‑F引物和第一特异性引物；将第一轮PCR扩增产物在第二轮扩增体系中进行扩增，获得未知融合基因检测文库，所述第二轮扩增体系含有所述TSO‑F引物、第二特异性引物和Barcode引物。通过对使用本发明所提供的构建方法得到的文库进行测序和生物信息分析，可准确得到与已知目标基因相融合基因的信息。
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公开(公告)号：CN106835292A
公开(公告)日：2017-06-13
申请号：CN201710218529.4
申请日：2017-04-05
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
CPC分类号： C12N15/1093 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12Q2535/122 , C12Q2525/191
摘要： 本发明公开了一步法快速构建扩增子文库的方法，包括以下步骤：1、合成用于构建DNA样品的扩增子文库的引物组合，所述用于构建DNA样品的扩增子文库的引物组合包括：根据目标扩增子设计的上游融合引物，根据目标扩增子设计的下游融合引物，上游通用引物和下游通用引物；2、构建DNA样品的PCR反应体系；3、进行PCR。运用该方法可以简便、快速的经1步构建扩增子文库，且由于在PCR起始前就引入barcode，使得样本及文库间交叉污染的可能性大大降低。
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公开(公告)号：CN111304299B
公开(公告)日：2022-04-26
申请号：CN201911270317.6
申请日：2019-12-11
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6851 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种用于检测常染色体拷贝数变异的引物组合、试剂盒和方法。本发明首先提供了用于检测常染色体拷贝数变异的引物组合，包括：Barcode引物、上游引物、下游外引物和下游内引物。本发明进一步公开了检测常染色体拷贝数变异的方法。本发明以逆转座子区域为扩增特定目标区域，通过设计有限的一到几对引物就可以覆盖这些区域对全基因组进行富集，就可以真正的反应不同染色体各区域的拷贝数水平，结合一步法构建扩增子文库，杜绝样本污染，使得本发明检测常染色体拷贝数变异具有操作简单、高灵敏度、高准确性以及低成本的特点，可真正实现染色体拷贝数检测方法在实际检测中的应用。
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公开(公告)号：CN110904225B
公开(公告)日：2022-04-12
申请号：CN201911131771.3
申请日：2019-11-19
申请人： 中国医学科学院肿瘤医院 , 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , G16B20/00
摘要： 本发明公开了用于肝癌检测的组合标志物及其应用。用于肝癌检测的组合标志物包括AK055957、BDH1、C6orf223、DAB2IP、F12、GRASP、LRRC4、NFIX、OPLAH、PPFIA1、PSD4和TBX15的甲基化程度。实验证明，通过检测本发明提供的组合标志物可以判断待测肝脏组织的基因组DNA或血浆cfDNA来源于肝癌患者还是非肝癌患者，具有较高的准确性。本发明具有重要的应用价值。
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公开(公告)号：CN111304299A
公开(公告)日：2020-06-19
申请号：CN201911270317.6
申请日：2019-12-11
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6851 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种用于检测常染色体拷贝数变异的引物组合、试剂盒和方法。本发明首先提供了用于检测常染色体拷贝数变异的引物组合，包括：Barcode引物、上游引物、下游外引物和下游内引物。本发明进一步公开了检测常染色体拷贝数变异的方法。本发明以逆转座子区域为扩增特定目标区域，通过设计有限的一到几对引物就可以覆盖这些区域对全基因组进行富集，就可以真正的反应不同染色体各区域的拷贝数水平，结合一步法构建扩增子文库，杜绝样本污染，使得本发明检测常染色体拷贝数变异具有操作简单、高灵敏度、高准确性以及低成本的特点，可真正实现染色体拷贝数检测方法在实际检测中的应用。
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公开(公告)号：CN106835292B
公开(公告)日：2019-04-09
申请号：CN201710218529.4
申请日：2017-04-05
申请人： 北京泛生子基因科技有限公司
摘要： 本发明公开了一步法快速构建扩增子文库的方法，包括以下步骤：1、合成用于构建DNA样品的扩增子文库的引物组合，所述用于构建DNA样品的扩增子文库的引物组合包括：根据目标扩增子设计的上游融合引物，根据目标扩增子设计的下游融合引物，上游通用引物和下游通用引物；2、构建DNA样品的PCR反应体系；3、进行PCR。运用该方法可以简便、快速的经1步构建扩增子文库，且由于在PCR起始前就引入barcode，使得样本及文库间交叉污染的可能性大大降低。
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