用于检测结核分枝杆菌及其耐吡嗪酰胺药性的引物组

    公开(公告)号:CN102925554B

    公开(公告)日:2016-04-06

    申请号:CN201210345181.2

    申请日:2012-09-18

    摘要: 本发明涉及用于检测结核分枝杆菌及其耐吡嗪酰胺药性的引物组,利用该引物组检测结核分枝杆菌的耐吡嗪酰胺药性的方法是:提取样本中的DNA;通过荧光定量PCR扩增含有全长吡嗪酰胺酶基因(pncA)的结核基因组片段来检测结核分枝杆菌;对结核分枝杆菌阳性样本,进行吡嗪酰胺耐药性的检测,该检测的步骤为,1.以荧光定量PCR产物为模板再进行一次PCR反应添加体外表达元件;2.将此PCR产物加入到无细胞表达系统中,表达吡嗪酰胺酶;3.通过该样本与标准菌株的吡嗪酰胺酶活性对比,给出吡嗪酰胺耐药性结果。本发明将荧光定量PCR扩增全长pncA基因结合体外表达的吡嗪酰胺酶酶活性,实现了样本中结核分枝杆菌及其吡嗪酰胺耐药性的联合检测,无需细菌培养和DNA测序仪。

    一种枯草芽孢杆菌脂肪酶及制备方法和应用

    公开(公告)号:CN101857856B

    公开(公告)日:2012-02-01

    申请号:CN201010187108.8

    申请日:2010-05-25

    IPC分类号: C12N9/20 C12N15/57 C11D3/386

    摘要: 本发明公开了一种枯草芽孢杆菌脂肪酶及制备方法和应用,一种枯草芽孢杆菌脂肪酶,大肠杆菌(Escherichia coli)BL21/pET28a-/Lip A f10-H1(I12V/L140F/D144E),CCTCC NO:M2010058。这种高活力脂肪酶突变体的编码基因具有SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,其编码的蛋白具有SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列,其步骤是:第一是通过PCR扩增出枯草芽孢杆菌脂肪酶Lip A结构基因;第二是设计3对诱变引物,通过重叠PCR将突变引入脂肪酶Lip A基因;第三获得高活力脂肪酶产生菌BL21(DE3)/Lip A(I12V/L140F/D144E);第四是在大肠杆菌中诱导表达目的蛋白;第五是纯化蛋白。一种枯草芽孢杆菌脂肪酶在洗涤剂工业中的应用。本发明方法易行,成本低廉,高酶活脂肪酶突变株蛋白在食品、能源、化工和医药等行业具有重要应用价值。

    一种具有超广谱裂解活性的裂解酶LysPd403及其应用

    公开(公告)号:CN117448307A

    公开(公告)日:2024-01-26

    申请号:CN202311415575.5

    申请日:2023-10-30

    摘要: 本发明公开了一种具有超广谱裂解活性的裂解酶LysPd403及其应用,所述氨基酸序列如SEQ ID NO.1,其基因序列如SEQ ID NO.2所示。本发明的具有超广谱裂解活性的裂解酶LysPd403在体外对牙周炎疾病相关致病菌,如牙周炎相关的牙龈卟啉单胞菌、具核梭杆菌和伴放线放线聚集杆菌等具有较好的裂解效果,同时对粪肠球菌、变形链球菌、鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌具有良好的裂解效果,能够超广谱杀死革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。所述裂解酶能在大肠杆菌中进行可溶性表达,酶的产量高。因此,所述具有超广谱裂解活性的裂解酶LysPd403在抗感染类药物的研发中具有较好的应用前景。

    一种具有超广谱裂解活性的裂解酶LysPd424及其应用

    公开(公告)号:CN117417926A

    公开(公告)日:2024-01-19

    申请号:CN202311371508.8

    申请日:2023-10-23

    摘要: 本发明公开了一种具有超广谱裂解活性的裂解酶LysPd424及应用。所述裂解酶LysPd424的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。这组序列来自伴放线放线聚集杆菌基因组。经实验验证,裂解酶LysPd424在体外对牙周炎疾病相关致病菌,如牙龈卟啉单胞菌、具核梭杆菌和伴放线放线聚集杆菌等具有较好的裂解效果,同时对粪肠球菌、变形链球菌、鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌具有良好的裂解效果,能够超广谱杀死革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。裂解酶LysPd424能在大肠杆菌中进行可溶性表达,酶的产量高,在抗感染类药物的研发中具有较好的应用前景。

    一种利用生信技术挖掘ASFV核酸检测序列的方法

    公开(公告)号:CN110364225B

    公开(公告)日:2023-08-08

    申请号:CN201910763772.3

    申请日:2019-08-19

    IPC分类号: G16B30/10 G16B50/30

    摘要: 本发明公开了一种利用生信技术挖掘ASFV核酸检测序列的方法,本发明涉及生物信息学和病毒检测技术领域。该利用生信技术挖掘ASFV核酸检测序列的方法,提供了3个R语言脚本、3个Perl语言脚本,搭配chewBBACA软件,将公共数据库中可获得的所有ASFV全基因组序列进行分析、挖掘,找到保守且特异的序列和保留序列信息的矩阵文件,将这些序列根据矩阵文件信息,重新分配还原至对应的ASFV序列,并将序列按照在基因组上从5’到3’方向排序,根据ASFV的注释信息,获得这些序列所在ORF对应的功能基因名称,最后得到所有可以作为ASFV核酸检测的基因及序列信息,该生物信息学技术对于其他病毒的核酸检测序列的挖掘具有重要的指导意义和较高的应用价值。

    一种MERS RNA核酸参考品的制备方法

    公开(公告)号:CN111154779A

    公开(公告)日:2020-05-15

    申请号:CN201910978081.5

    申请日:2019-10-15

    摘要: 本发明公开了一种MERS RNA核酸参考品的制备方法,所述制备方法分别将MERS的upE基因和ORF1a基因串联以及ORF1b和N基因串联整合到慢病毒的表达质粒载体中,将构建的两个表达质粒与三个包装质粒分别在工程大肠杆菌菌株中扩增,得到大量的质粒后,再将构建的两个表达质粒分别和三个包装质粒共同转染至HEK293T细胞中,经细胞表达后得到大量的包装了MERS RNA的慢病毒颗粒,本发明涉及基因工程技术领域。该MERS RNA核酸参考品的制备方法,制备的颗粒作为MERS RNA检测的阳性参考品,能很好地模拟从实际样本中提取病毒核酸RNA到核酸检测的整个过程,此外,将该病毒颗粒通过冻干保护剂进行冻干后得到的冻干粉,非常稳定,在45℃放置四周拷贝数基本不变。

    一种血清中梅毒螺旋体抗体的快速检测方法及其应用

    公开(公告)号:CN110456052A

    公开(公告)日:2019-11-15

    申请号:CN201910778256.8

    申请日:2019-08-22

    摘要: 本发明公开了一种血清中梅毒螺旋体抗体的快速检测方法及其应用,该方法通过使用修饰了protein A和protein G的树脂颗粒捕获血清中的抗体,利用融合了荧光素酶的梅毒脂蛋白TP15、TP17和TP47与捕获在树脂上的抗体结合,再通过检测融合的热稳定荧光素酶的发光活性,实现血清中梅毒螺旋体抗体的灵敏快速检测。该方法使用的荧光素酶与梅毒脂蛋白融合蛋白,能特异地结合梅毒螺旋体的抗体,而且其中的荧光素酶是热稳定性好的荧光素酶。该融合蛋白应用于本发明的快速检测方法,方法使用的血清样本量少,仅需1μL血清就能在20分钟内实现血清中梅毒螺旋体抗体的检测,能准确区分抗体的阴阳性,与传统的ELISA有着相似的灵敏度。

    一种利用生信技术挖掘ASFV核酸检测序列的方法

    公开(公告)号:CN110364225A

    公开(公告)日:2019-10-22

    申请号:CN201910763772.3

    申请日:2019-08-19

    IPC分类号: G16B30/10 G16B50/30

    摘要: 本发明公开了一种利用生信技术挖掘ASFV核酸检测序列的方法,本发明涉及生物信息学和病毒检测技术领域。该利用生信技术挖掘ASFV核酸检测序列的方法,提供了3个R语言脚本、3个Perl语言脚本,搭配chewBBACA软件,将公共数据库中可获得的所有ASFV全基因组序列进行分析、挖掘,找到保守且特异的序列和保留序列信息的矩阵文件,将这些序列根据矩阵文件信息,重新分配还原至对应的ASFV序列,并将序列按照在基因组上从5’到3’方向排序,根据ASFV的注释信息,获得这些序列所在ORF对应的功能基因名称,最后得到所有可以作为ASFV核酸检测的基因及序列信息,该生物信息学技术对于其他病毒的核酸检测序列的挖掘具有重要的指导意义和较高的应用价值。