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公开(公告)号：CN117935923A
公开(公告)日：2024-04-26
申请号：CN202310329801.1
申请日：2023-03-30
Applicant: 华朗生物医药科技(苏州)有限公司
IPC: G16B35/20 , G16B35/10 , G16B30/10 , G16B40/00 , C12N15/864
Abstract: 本发明涉及基因治疗技术领域，具体涉及一种基于AI设计筛选rAAV载体的方法，包括：构建冗余病毒库；选取目标组织；AI工作平台预测较佳的rAAV载体序列；对rAAV载体进行定向进化，并进行实验验证，结合实验检测结果，循环多次重复定向进化过程，直至得到具有最佳序列的rAAV载体。本发明的方法，可大大提高rAAV载体的筛选效率、降低筛选成本，同时可获得靶向性更高、免疫原性和毒副作用更小的rAAV载体，能够使得基因治疗的效果提升10‑20％，甚至更高。
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公开(公告)号：CN113424264B
公开(公告)日：2024-04-12
申请号：CN201980075581.6
申请日：2019-11-15
Applicant: NOUSCOM股份公司
Inventor： 阿尔弗雷多·尼科西亚 , 埃莉萨·斯卡尔塞利 , 阿明·拉姆 , 圭多·莱昂尼
Abstract: 本发明涉及选择用于个性化疫苗的癌症新生抗原的方法。本发明还涉及构建携带用于个性化疫苗的新生抗原的载体或载体集合的方法。本发明还涉及包含个性化基因疫苗的载体或载体集合及所述载体在癌症治疗中的应用。
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公开(公告)号：CN114426982B
公开(公告)日：2024-03-22
申请号：CN202210160708.8
申请日：2022-02-22
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N15/74 , C12N15/65 , C40B50/06 , C40B40/02 , C12N1/21 , C12N15/54 , G16B35/20 , G16B35/10 , G16B25/20 , G16B30/10 , C12R1/63
Abstract: 本发明公开了一种细胞代谢重编程的方法及其应用，属于基因工程领域，本发明利用细胞代谢网络的敏感节点对代谢网络进行重编程，主要包括基于CRISPRi的双基因组合敲弱、细胞高通量筛选和基于幸存率的基因交互作用分析三部分，本发明提供了一个新颖的、简单高效的、成本低廉的智能代谢重编程方法，可广泛用于操作细胞代谢网络。
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公开(公告)号：CN116559092B
公开(公告)日：2023-09-26
申请号：CN202310807765.5
申请日：2023-07-04
Applicant: 北京理工大学 , 重庆大学附属肿瘤医院
IPC: G01N21/25 , C12Q1/6886 , G16B20/50 , G16B40/20 , G16B25/20 , G16B35/10 , G16B50/00 , G06F18/2113 , G06F18/214 , G06F18/241 , G06F18/2411 , G06F18/2413 , G06F18/243
Abstract: 本发明公开了一种基于宏观光谱元素成分分析的肿瘤微观基因突变检测系统，属于生物信息领域；包括：载物台、控温吹扫装置、光谱激发和收集装置、数据库和检测装置；控温吹扫装置，用于对置于载玻片上的待测组织样本进行表面控温吹扫，在待测组织样本表面形成胶质固态硬膜；载物台，用于放置承载有表面控温吹扫后的待测组织样本的载玻片；光谱激发和收集装置，用于产生脉冲激光聚焦照射待测组织样本，对准待测组织样本产生的等离子体团进行光谱收集，产生待测组织样本的光谱数据，发送给检测装置；数据库，用于存储各种已知基因突变类型对应的光谱特征点位和分类模型；使用本发明能够解决肿瘤基因突变点位的分子诊断复杂且价格昂贵的问题。
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公开(公告)号：CN116434844A
公开(公告)日：2023-07-14
申请号：CN202310305072.6
申请日：2020-05-19
Applicant: 贾斯特-埃沃泰克生物制品有限公司
Inventor： 蒂莱利·阿米默 , 兰德尔·罗伯特·凯切姆 , 杰里米·马丁·谢弗 , 鲁蒂略·H·克拉克 , 约翰·亚历克斯·泰勒
IPC: G16B40/20 , G16B35/10 , G06N3/0475 , G06N3/0455 , G06N3/0464 , G06N3/08 , G06N20/00
Abstract: 公开了用于生成蛋白质的氨基酸序列的方法和系统。该方法包括：通过计算系统获得包括蛋白质的氨基酸序列的训练数据集，该计算系统包括一个或更多个计算装置，该计算装置具有一个或更多个处理器和存储器；通过该计算系统，基于训练数据集来生成结构化氨基酸序列；通过该计算系统，使用结构化氨基酸序列和生成式对抗网络来生成用于产生与包括在训练数据集中的氨基酸序列相对应的附加氨基酸序列的模型；通过该计算系统，使用该模型和输入向量来生成附加氨基酸序列；通过该计算系统，根据一个或更多个标准来评估附加氨基酸序列，以确定用于附加氨基酸序列的度量。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116343929A
公开(公告)日：2023-06-27
申请号：CN202310613009.9
申请日：2023-05-29
Applicant: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
Abstract: 本发明提供一种MeRIP‑Seq技术挖掘绵羊骨骼肌发育相关基因的方法及应用，首先对所提取的绵羊背最长肌组织RNA依次进行RNA特异性m6A抗体免疫沉淀、文库构建和测序，对得到的原始数据进行质控过滤，并将过滤后的数据与绵羊的参考基因组数据进行对比，将基因组比对位置数据进行m6A peak的鉴定与注释，以得到差异m6A peak相关基因，并对差异m6A peak相关基因进行鉴定以及GO与KEGG功能富集分析。本发明从表观遗传角度出发，为探索绵羊骨骼肌生长发育调控机制提供科学依据，对于绵羊产肉性状的分子育种及品种改良具有重要借鉴意义。
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公开(公告)号：CN115713972A
公开(公告)日：2023-02-24
申请号：CN202211443753.0
申请日：2022-11-18
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种基于Graphormer算法的蛋白质序列设计方法、装置及存储介质，其中方法包括：将蛋白质结构以图的方式进行表示：以单个氨基酸为节点，以氨基酸之间的联系作为边；提取蛋白质的初始边特征和初始节点特征；将蛋白质初始节点特征和一个随机矩阵进行拼接，并通过线性层调整维度，加上位置编码信息，得到节点特征，作为GPD模型的输入；将蛋白质初始边特征通过矩阵拼接之后再经过两层线性层，得到边特征，嵌入到GPD模型的注意力矩阵中；构建用于固定骨架蛋白质序列设计的GPD模型并训练；基于GPD模型、节点特征和边特征设计蛋白质序列。与现有技术相比，本发明具有更高的序列恢复率和更高的设计序列多样性。
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公开(公告)号：CN114875118A
公开(公告)日：2022-08-09
申请号：CN202210756234.3
申请日：2022-06-30
Applicant: 北京百图智检科技服务有限公司
IPC: C12Q1/6827 , C12Q1/6869 , G16B10/00 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B25/10 , G16B25/20 , G16B30/10 , G16B35/10 , G16B40/30
Abstract: 本发明涉及确定多细胞真核生物中的单细胞线粒体转录组中的变异的方法，并涉及基于细胞中线粒体变异的存在确定多细胞真核生物中的细胞谱系的方法，包括富集线粒体转录组以及进行二代测序和三代测序。本发明还涉及线粒体核酸文库和用于制备线粒体转录组文库的试剂盒、以及基于二代测序和三代测序来识别线粒体测序数据中线粒体变异的装置和确定多细胞真核生物中细胞谱系的装置。
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公开(公告)号：CN114774516A
公开(公告)日：2022-07-22
申请号：CN202210314024.9
申请日：2022-03-28
Applicant: 深圳裕康医学检验实验室
IPC: C12Q1/6806 , C40B40/06 , G16B25/20 , G16B35/10
Abstract: 本申请公开了一种校正测序错误的UMI序列设计方法及其应用。本申请的UMI序列设计方法，包括将UMI序列设计为由X个碱基序列为单元进行Y次串联重复的序列，UMI序列如公式一：(N1…NX)Y，其中，N表示A、T、C、G碱基中的任意一种，(N1…NX)表示X个碱基序列组成的单元，Y表示单元序列重复的次数；2≤X≤6，Y≥3。本申请的UMI序列设计方法，UMI序列的每一个碱基都被测序至少3次，能够校正UMI序列测序错误中出现的任意的单碱基错误，提高测序结果中UMI序列读取的准确率；可以适用于100000×以上深度测序的UMI序列测序错误校正。
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