用于马铃薯品种鉴定的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN113817858A

    公开(公告)日:2021-12-21

    申请号:CN202110977723.7

    申请日:2021-08-24

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12Q1/6895 C12N15/11

    摘要: 本发明公开了一种用于马铃薯品种鉴定的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用,所述MNP标记位点为在马铃薯基因组上筛选的在马铃薯种群内具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括马铃薯基因组GCA_009827175.1上MNP‑1~MNP‑560的标记位点。所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.1120所示。所述MNP标记位点数目多、多态性高、品种区分能力强,满足马铃薯品种真实性鉴定和实质性派生品种鉴定需求;所述引物互不干扰,鉴定准确度高、结果重现性强,满足DNA指纹数据库构建的要求;可应用于大规模马铃薯品种鉴定,在农作物产品的市场监管、知识产权保护、新品种培育等方面具有极大的应用价值。

    一种小麦条斑病菌小种分离鉴定方法

    公开(公告)号:CN107828904B

    公开(公告)日:2021-07-02

    申请号:CN201711295741.7

    申请日:2017-12-08

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12Q1/689 C12Q1/04

    摘要: 本发明公开了一种小麦条斑病菌小种分离鉴定方法,属于小种鉴定技术领域。提取样品中的微生物的总核酸并构建高通量测序文库;寻找基因组上的变异位点;通过滑动平移筛选高多态性位点,并在在候选位点两侧设计多重扩增引物;利用固体培养基分离样品中的单菌落并做进一步纯化,以获得单克隆菌落;提取菌落的基因组DNA后利用上述步骤设计的引物进行扩增并测序;基于测序结果单克隆菌落进行分型,具有不同基因型的菌落作为不同的小种进行后续研究。本方法不需要预先知道样品中的小种数量以及丰度等信息,也无需传统的筛选过程中所需要生理生化鉴定试验,只需通过高通量测序和扩增即可分离培养出样品中的全部小种,过程简单、快速且流程规范。

    芝麻微卫星标记位点开发方法与微卫星标记位点内的微卫星标记的长度检测方法

    公开(公告)号:CN106520960B

    公开(公告)日:2020-03-27

    申请号:CN201611030383.2

    申请日:2016-11-16

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本发明公开了一种芝麻微卫星标记位点开发方法与微卫星标记位点内的微卫星标记的长度检测方法。所述开发方法包括:获得混合样本;提取混合样本的基因组;将基因组片段化,获得基因组片段;利用探针组分别与基因组片段进行杂交;纯化多个杂交溶液中成功杂交的基因组片段;将多个所述纯化的杂交基因组片段混合后,利用高通量测序检测所述纯化的基因组片段;获得有效的所述高通量测序片段;将所述有效的高通量测序片段进行分类。所述检测方法包括:选择待检测的微卫星标记位点;利用多重扩增引物扩增所述待检测的微卫星标记位点内的微卫星标记,获得所述微卫星标记位点内的微卫星标记的长度。上述方法简单、快速、全面且准确。

    莱茵衣藻相关基因的RNAi载体及其构建方法和应用

    公开(公告)号:CN104388455B

    公开(公告)日:2018-01-16

    申请号:CN201410591912.0

    申请日:2014-10-29

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12N15/65 C12N15/66 C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了一种莱茵衣藻相关基因的RNAi载体及其构建方法和应用,所述RNAi载体含有一个莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2、内含子和3’UTR和潮霉素筛选标记表达框序列,莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,3’UTR的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,潮霉素筛选标记表达框序列的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。本发明利用PCR技术把目的基因的部分cDNA片段先构建到中间载体pEASY‑T1上,然后再通过两次酶切相继把目标基因的正向和反向片段连接到莱茵衣藻RNAi骨架载体上,简化了载体构建步骤,缩短了载体构建时间,提高了效率,同时可以直接应用到衣藻其它基因的功能研究方面。

    一种番茄转基因成分的检测方法

    公开(公告)号:CN105586412A

    公开(公告)日:2016-05-18

    申请号:CN201610060867.5

    申请日:2016-01-29

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了一种番茄转基因成分的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括:确定转基因成分、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;进行抽样并混合,得到混合样品;提取混合样品的基因组并加入外源标准基因,得到混合核酸;构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;获得待测样品中转基因成分的测序片段的数量、内源标准基因的测序片段的数量和外源标准基因的测序片段的数量;根据外源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功并计算待测样品种中转基因成分的含量;根据转基因成分的含量判断待测样品中是否含有转基因成分。该方法能够同时定量检测待测样品中的多种转基因成分。

    一种棉花转基因成分的检测方法

    公开(公告)号:CN105567835A

    公开(公告)日:2016-05-11

    申请号:CN201610066274.X

    申请日:2016-01-29

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了一种棉花转基因成分的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括:确定转基因成分、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;进行抽样并混合,得到混合样品;提取混合样品的基因组并加入外源标准基因,得到混合核酸;构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;获得待测样品中转基因成分的测序片段的数量、内源标准基因的测序片段的数量和外源标准基因的测序片段的数量;根据外源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功并计算待测样品种中转基因成分的含量;根据转基因成分的含量判断待测样品中是否含有转基因成分。该方法能够同时定量检测待测样品中的任意多种转基因成分。

    miRNA169h基因预报水稻白叶枯病的方法

    公开(公告)号:CN104141008A

    公开(公告)日:2014-11-12

    申请号:CN201410309783.1

    申请日:2014-06-30

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了miRNA169h基因预报水稻白叶枯病的方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:选取待测水稻和对照水稻,选取的所述对照水稻为未感染白叶枯病但与待测水稻在相同条件下栽培的水稻;分别分离所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因;分别检测所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因中的miRNA169h基因的表达量,所述miRNA169h基因的序列如序列表中SEQ ID NO:1所示;根据所述待测水稻和所述对照水稻中的miRNA169h基因的表达量,判断实验是否成功,若成功,进一步判定所述待测植株是否感染白叶枯病。本发明提供的预测方法获得了成功,可以在水稻白叶枯病症出现前数天实现准确预报,为早防早治赢得了时间,减少了白叶枯病对水稻造成的损失。