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公开(公告)号:CN117074691B
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202311022320.2
申请日:2023-08-14
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明公开了一种检测CTC抵抗NK细胞杀伤的试剂盒及其应用。本发明基于RNA‑seq技术结合QRT‑PCR技术检测发现,血小板可上调CTC表面CD155表达;通过体内实验,进一步发现CD155高表达促进肝癌细胞免疫逃逸,NK细胞的功能下降,且杀伤能力减弱。因此,本发明提出一种通过直接检测CTC上粘附性的血小板以及CTC表面CD155表达,而无需将NK细胞及肿瘤细胞共培养,即可评估CTC抵抗NK细胞杀伤的能力的试剂盒。本发明试剂盒可用于直接检测免疫逃逸型CTC,尤其是检测逃避NK细胞杀伤的CTC,通过对CTC上CD155染色即可进行评估,无需与NK细胞共培养,大大减少了试剂成本及操作时间。
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公开(公告)号:CN118351407A
公开(公告)日:2024-07-16
申请号:CN202410443022.9
申请日:2024-04-12
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 南京大学
IPC: G06V10/80 , G06V10/82 , G06V10/764 , G06V10/778 , G06V10/774 , G06N3/04 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开一种融合多模态学习的免疫固定电泳(IFE)图谱分析方法。免疫固定电泳图像由六条区带组成,并且在横向上可以分为四个区域。区带在某个横向区域的匹配标志了异常蛋白的位置信息。在进行免疫固定电泳的同时,通常会进行血清电泳检测,血清电泳图像包含了异常蛋白的位置信息。本方法通过将同一患者对应的血清电泳图像和免疫固定电泳图像同时作为输入进行多模态模型学习,来进行IFE图谱的阴阳性分类和区带分类。针对少量且类别不平衡现象较为严重的样例数据,引入专家知识,对样例数据进行处理和标注;对两种模态数据进行特征提取和融合,训练高效且准确的分类器模型。与传统的单模态方法相比,多模态方法在阴阳二分类和区带分类的性能上都有显著的提升。通过综合利用血清电泳和免疫固定电泳图像的信息,该方法能够提高阴阳分类和区带分类的准确率,有望在免疫病理学的临床诊断中发挥重要作用。
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公开(公告)号:CN118308477A
公开(公告)日:2024-07-09
申请号:CN202410518835.X
申请日:2024-04-28
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6883 , C40B50/06 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种马凡综合征相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和应用,属于基因检测技术领域。本发明中的捕获探针组序列如SEQ ID No.1~SEQ ID No.149所示,能针对性捕获目标基因FBN1,并进行测序,使测序目标基因精准,测序成本降低。包含该捕获探针组的试剂盒能够有效捕获目的基因,并可降低其检测成本、提高检测灵敏度。使用该捕获探针组的文库构建方法通过基于液相杂交的序列捕获技术对目标基因进行富集,能对目标基因进行有效富集,降低样本量的要求,同时也能更好地控制测序成本。本发明中的产品和方法可有效应用到相关基因的筛查中,并对其进行更加深入地研究。
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公开(公告)号:CN117612163A
公开(公告)日:2024-02-27
申请号:CN202311730723.2
申请日:2023-12-15
Applicant: 南京大学 , 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明公开一种结合反绎学习与深度学习的免疫固定电泳图像识别方法,首先,获取免疫固定电泳图像及相关联的标记信息;针对少量且类别不平衡现象较为严重的样例数据,结合反绎学习引入专家知识,依照人工识别规则对样例数据进行切分和重新组合,从而实现免疫固定电泳图像的自动生成和标注;结合专家知识库,利用多任务学习范式和注意力机制设计神经网络结构,构建深度学习模型,对经反绎学习增广后的数据进行训练,获得高效且准确的分类模型;将所得到的分类模型应用于免疫固定电泳图像的识别中,准确、高效地实现免疫固定电泳图像的自动识别。
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公开(公告)号:CN117448452A
公开(公告)日:2024-01-26
申请号:CN202311381171.9
申请日:2023-10-24
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , G16B25/10 , G16B5/00 , G16H50/30 , G16H70/40
Abstract: 本发明属于医学生物检测技术领域,具体涉及一种肝细胞肝癌(HCC)的检测分子标志物及其在制备检测HCC的产品中的应用。本发明提供的一种HCC的检测分子标志物,包括如下的与DNA损伤修复(DDR)相关的长链非编码RNA(lncRNA)基因中的一种或几种组合:AC012073.1、AL031985.3、AL355574.1、LINC01224和SNHG4。本发明提供的一种HCC的检测分子标志物,不仅稳定存在于组织和血浆中,且参与DDR的生物学过程,与HCC的发生发展有关。本发明通过对数据库中HCC和正常组织的基因和lncRNA表达数据进行差异分析,筛选出一组能够用于预测HCC患者预后的高灵敏、高特异性的DDR相关的lncRNA基因组合。
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公开(公告)号:CN110728315B
公开(公告)日:2023-09-15
申请号:CN201910943578.3
申请日:2019-09-30
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: G06F18/24 , G06F18/214 , G16H10/20
Abstract: 本发明提供一种实时质量控制方法,通过获取检验样本数据,基于检验样本数据产生一个或多个适用于检测检验样本数据系统误差的分类器,将分类器部署至实时质量控制平台,接收实时检验数据以完成检验质量的实时控制,本发明通过模拟引入正负误差数据组训练样本,从而提高分类器的分类准确率,同时采用ROC曲线下面积AUC对所述含最优模型参数的模型进行评价完成分类器的训练,从而对检测数据进行监控,可进一步提高对检测设备质检性能,降低了实验室的失控风险。
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公开(公告)号:CN116629668A
公开(公告)日:2023-08-22
申请号:CN202310471072.3
申请日:2023-04-26
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: G06Q10/0639 , G06Q10/0635 , G16H50/70 , G16H10/40 , G06F18/24
Abstract: 本发明提供一种基于实时质量控制的风险评估方法、系统和设备,首先根据特定失控状态下最大报告错误的患者数量MaxE(Nu)确定室内质控规则下的样本最大批次长度M;其次根据室内质控规则下的样本最大批次长度M确定实时质量控制下的最大报告错误的患者数量MaxE(Nu);如实时质量控制下的最大报告错误的患者数量MaxE(Nu)小于室内质控规则下的最大可接受的报告错误患者数,则在室内质控基础上应用实时质控模型,并执行监控策略,本发明的目的在于实时评估在不同的条件下实验室的实时质量控制模型的风险和实用性,实现实验室室内质控和实时质控的合用,提高实验室质控效率。
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公开(公告)号:CN116629224A
公开(公告)日:2023-08-22
申请号:CN202310532317.9
申请日:2023-05-11
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: G06F40/186 , G06F40/174 , G06F16/25
Abstract: 本发明提供一种低学习成本、可配置化、支持自定义的实验室记录表格在线填写方法,简单、灵活、高效、智能地满足实验室管理需求,包括:记录表格模板设计,基于办公软件预设格式的表格,在需要填写内容的部分单元格建立批注,将批注内容作为记录内容存储的字段名;配置模板字段映射,自动解析批注,将批注内容及其字段名添加到所述表格模板的字段映射对照表;记录表格填写,根据表格所对应的模板及其配置的字段映射对照表,自动生成网页格式的记录表单,用户填写内容后自动保存到数据库中。
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公开(公告)号:CN116125078A
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202310079684.8
申请日:2023-01-17
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明公开了一种检测CTC抵抗NK细胞杀伤的试剂盒及其应用。本发明基于RNA‑seq技术结合QRT‑PCR技术检测发现,血小板可上调CTC表面CD155表达;通过体内实验,进一步发现CD155高表达促进肝癌细胞免疫逃逸,NK细胞的功能下降,且杀伤能力减弱。因此,本发明提出一种通过直接检测CTC上粘附性的血小板以及CTC表面CD155表达,而无需将NK细胞及肿瘤细胞共培养,即可评估CTC抵抗NK细胞杀伤的能力的试剂盒。本发明试剂盒可用于直接检测免疫逃逸型CTC,尤其是检测逃避NK细胞杀伤的CTC,通过对CTC上CD155染色即可进行评估,无需与NK细胞共培养,大大减少了试剂成本及操作时间。
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公开(公告)号:CN115541742A
公开(公告)日:2022-12-30
申请号:CN202211127805.3
申请日:2022-09-16
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: G01N30/02 , G01N30/04 , G01N30/72 , G01N30/86 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明一种肝细胞癌预后诊断试剂盒,包括用于检测N‑乙酰‑2‑氨基己二酸、丙酮酸、N‑硬脂酰鞘氨醇(d18:1/18:0)、棕榈酰二氢鞘磷脂(d18:0/16:0)、1‑硬脂酰‑2‑油酰‑GPC(18:0/18:1)、棕榈酰鞘磷脂(d18:1/16:0)浓度所需的内标标准品。将HCC患者组织外泌体中的N‑乙酰‑2‑氨基己二酸、丙酮酸、N‑硬脂酰鞘氨醇(d18:1/18:0)、棕榈酰二氢鞘磷脂(d18:0/16:0)、1‑硬脂酰‑2‑油酰‑GPC(18:0/18:1)、棕榈酰鞘磷脂(d18:1/16:0)浓度带入回归方程中,当数值超过6.73E+05时,认为患者预后不佳。本发明通过对获取的组织外泌体进行代谢组学分析,筛选出一组能够用于诊断HCC患者预后的高灵敏、高特异性的外泌体代谢物组合。
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