用于扩增免疫球蛋白重链CDR3编码序列的引物组合物及其用途

    公开(公告)号:CN103184216A

    公开(公告)日:2013-07-03

    申请号:CN201110444740.0

    申请日:2011-12-27

    Abstract: 本发明涉及用于扩增免疫球蛋白重链CDR3编码序列的引物组合物,富集免疫球蛋白重链CDR3编码序列的方法,构建免疫球蛋白重链CDR3编码序列的测序文库的方法,确定免疫球蛋白重链CDR3编码序列的序列信息的方法,确定个体免疫状态的方法,确定个体免疫状态的系统。该引物组合物包括第一引物组,所述第一引物组由至少一种V区引物组成,所述至少一种V区引物的每一种均包含与至少一个V基因片段互补的序列;以及第二引物组,所述第二引物组由至少一种J区引物组成,所述至少一种J区引物的每一种均包含与至少一个J基因片段互补的序列。利用该引物组合物,能够有效地对免疫球蛋白重链CDR3编码序列进行富集,从而为对CDR3进行深入研究提供了便利的工具。

    一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统

    公开(公告)号:CN101794346B

    公开(公告)日:2011-11-23

    申请号:CN200910252465.5

    申请日:2009-12-11

    Abstract: 本发明适用于基因工程领域,提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统,所述方法包括下述步骤:将参考基因集中的参考基因定位到目标基因组上,形成基因拷贝座位;根据所述基因拷贝座位,将重叠的基因拷贝聚类到一起,形成模糊位点基因代表座位;根据所述模糊位点代表基因座位,利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域,且敏感度高,复杂度低,避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。

    一种单核苷酸多态性检测方法

    公开(公告)号:CN101539967B

    公开(公告)日:2010-12-01

    申请号:CN200810218343.X

    申请日:2008-12-12

    Abstract: 本发明适用于生物工程领域,提供了一种单核苷酸多态性检测方法,所述方法包括下述步骤:将高通量测序技术得到的测序片段比对到参考基因组序列上;根据测序得到的待测基因组中每个碱基的测序质量分数,得到待测基因组上对应位点的各种基因型的似然概率;根据所述似然概率和为每种基因型预设的先验概率,计算参考基因组上每个位点上每种基因型的后验概率,并将后验概率最高的基因型确定为待测基因组对应位点最有可能正确的基因型,得到待测基因组的一致序列;检测待测基因组的一致序列中与参考基因组序列不一致的位点,得到待测基因组中的多态性位点。本发明实施例由于考虑了先验概率对单核苷酸多态性检测结果的影响,从而使检测结果更准确。

    一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统

    公开(公告)号:CN101794346A

    公开(公告)日:2010-08-04

    申请号:CN200910252465.5

    申请日:2009-12-11

    Abstract: 本发明适用于基因工程领域,提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统,所述方法包括下述步骤:将参考基因集中的参考基因定位到目标基因组上,形成基因拷贝座位;根据所述基因拷贝座位,将重叠的基因拷贝聚类到一起,形成模糊位点基因代表座位;根据所述模糊位点代表基因座位,利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域,且敏感度高,复杂度低,避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。

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