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公开(公告)号：CN113166756B
公开(公告)日：2023-10-13
申请号：CN201980082604.6
申请日：2019-02-13
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
摘要： 一种用于三代测序建库的融合引物、建库方法、测序方法和建库试剂盒。融合引物从5’端至3’端依次包括同源重组序列、标签序列和特异性扩增引物序列，其中同源重组序列用于将融合引物的扩增产物进行同源重组拼接，标签序列用于区分不同的扩增产物，特异性扩增引物序列用于与靶标序列结合以进行引物延伸。使用融合引物扩增靶标序列，对扩增产物进行同源重组拼接，增加测序芯片上样本数量，降低测序成本。
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公开(公告)号：CN111855982B
公开(公告)日：2022-07-22
申请号：CN201910339303.9
申请日：2019-04-25
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： G01N33/487 , G01N33/53
摘要： 一种检测核酸片段长度的方法，包括：将待检测核酸稀释至预定浓度；分别取等量体积的核酸与梯度倍数用量的磁珠结合；通过磁力装置吸附结合了核酸的磁珠，并去除上清；使用等量体积的洗脱缓冲液回溶磁珠上结合的核酸，并检测回溶核酸浓度；计算核酸与磁珠结合前后的浓度差异，并形成浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的曲线关系；将曲线关系与标准品曲线进行比对得到待检测核酸的片段长度，其中标准品曲线包括预定浓度的不同片段长度的核酸标准品与梯度倍数用量的磁珠结合前后的浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的对应关系。本发明的方法基于同种磁珠不同浓度倍数对核酸片段偏向性筛选的特性，结合数据分析对核酸片段的长度进行简易高效的检测。
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公开(公告)号：CN112824534A
公开(公告)日：2021-05-21
申请号：CN201911141638.6
申请日：2019-11-20
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06 , C12Q1/6869
摘要： 本发明涉及基因测序领域，具体涉及一种对核酸的目标区域进行扩增的方法、建库和测序方法。所提供的对核酸的目标区域进行扩增的方法包括：(1)利用转座酶将UMI序列插入到所述核酸上，以便获得融合产物，所述融合产物含有所述UMI序列和所述目标区域序列；(2)利用引物对所述融合产物进行扩增，以便获得含有目标区域序列和UMI序列的扩增产物。还提供了对核酸的目标区域建库的方法和测序方法。通过本发明所提供的方法可以缩短建库测序的时间；还可以降低生产成本，有效提高数据利用率。
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公开(公告)号：CN111855982A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN201910339303.9
申请日：2019-04-25
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： G01N33/487 , G01N33/53
摘要： 一种检测核酸片段长度的方法，包括：将待检测核酸稀释至预定浓度；分别取等量体积的核酸与梯度倍数用量的磁珠结合；通过磁力装置吸附结合了核酸的磁珠，并去除上清；使用等量体积的洗脱缓冲液回溶磁珠上结合的核酸，并检测回溶核酸浓度；计算核酸与磁珠结合前后的浓度差异，并形成浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的曲线关系；将曲线关系与标准品曲线进行比对得到待检测核酸的片段长度，其中标准品曲线包括预定浓度的不同片段长度的核酸标准品与梯度倍数用量的磁珠结合前后的浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的对应关系。本发明的方法基于同种磁珠不同浓度倍数对核酸片段偏向性筛选的特性，结合数据分析对核酸片段的长度进行简易高效的检测。
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公开(公告)号：CN111462818A
公开(公告)日：2020-07-28
申请号：CN201910058957.4
申请日：2019-01-22
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
摘要： 一种测序产量预测方法和建立测序产量预测模型的方法及装置，测序产量预测方法包括：获取测序过程中的测序数据，包括BIC、ESR和ACCGRR，或BIC、FIT、ESR和光强；根据测序数据和测序产量预测模型公式，预测测序完成时的测序产量；和输出预测出的测序完成时的测序产量。本发明能够有效预测测序平台的测序产量，通过实时监控测序过程中的测序仪参数变化，实现测序产量早预测、测序异常早发现，从而缩短生产交付周期，并及时向前端反馈测序进展。
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公开(公告)号：CN111073960A
公开(公告)日：2020-04-28
申请号：CN201811231237.5
申请日：2018-10-22
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12M1/34
摘要： 本申请公开了一种测序仪激光扩束器的调试方法及装置，调试方法，检测激光扩束器发射激光的同一个焦面上若干位置的激光光强值；根据若干个位置的激光光强值计算出扩束器的偏离系数，并计算出调节角度值；根据计算出的调节角度值调节激光扩束器上的调节旋钮，进行对焦调试。由于检测发射激光在同一焦面上的不同位置的光强大小，再通过进行计算分析得到激光光强的均一性，并且计算出调节的角度值，调试人员可根据计算出的调节角度值对测序仪激光扩束器进行对焦调节，实现测序仪激光扩束器的均一性调试，本调试方法及装置借助设备完成，调试的精度高和效率高。
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公开(公告)号：CN109022444A
公开(公告)日：2018-12-18
申请号：CN201710436649.1
申请日：2017-06-12
申请人： 湖北华大基因研究院 , 武汉华大医学检验所有限公司
CPC分类号： C07K14/47 , A01K67/0275 , A01K2267/03 , C12N15/85 , C12Q1/6883 , C12Q2600/156
摘要： 本发明公开了TTC21B基因突变体及其应用，具体涉及分离的编码TTC21B突变体的核酸，分离的多肽，筛选易患肾单位肾痨12型的生物样品的系统，用于筛选易患肾单位肾痨12型的生物样品的试剂盒，以及构建药物筛选模型的方法。其中，该分离的编码TTC21B突变体的核酸，与SEQ ID NO：1相比，同时具有c.1552T>C突变和c.895T>C突变。通过检测该新突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易患肾单位肾痨12型。
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公开(公告)号：CN107164464A
公开(公告)日：2017-09-15
申请号：CN201710288996.4
申请日：2017-04-27
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
CPC分类号： C12Q1/686 , C12Q2563/101
摘要： 本申请公开了一种检测测序平台索引序列污染的方法及引物。本申请的检测测序平台索引序列污染的方法，包括采用污染索引序列的特异性引物，对存在污染的测序通道的所有子文库分别进行PCR扩增，根据PCR扩增结果中是否有特异性扩增，判断相应的子文库是否存在索引序列污染，从而检测出测序平台索引序列的污染源。本申请的测序平台索引序列污染检测方法，为测序平台索引序列污染的检测提供了一种全新的方案和思路，能够快速对索引序列污染来源进行特异性检测，且成本低、准确度高、操作简单方便，易于推广和使用。
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公开(公告)号：CN111073960B
公开(公告)日：2024-01-12
申请号：CN201811231237.5
申请日：2018-10-22
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12M1/34
摘要： 本申请公开了一种测序仪激光扩束器的调试方法及装置，调试方法，检测激光扩束器发射激光的同一个焦面上若干位置的激光光强值；根据若干个位置的激光光强值计算出扩束器的偏离系数，并计算出调节角度值；根据计算出的调节角度值调节激光扩束器上的调节旋钮，进行对焦调试。由于检测发射激光在同一焦面上的不同位置的光强大小，再通过进行计算分析得到激光光强的均一性，并且计算出调节的角度值，调试人员可根据计算出的调节角度值对测序仪激光扩束器进行对焦调节，实现测序仪激光扩束器的均一性调试，本调试方法及装置借助设备完成，调试的精度高和效率高。
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公开(公告)号：CN113584126A
公开(公告)日：2021-11-02
申请号：CN202010362435.6
申请日：2020-04-30
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6869
摘要： 本发明公开了一种核酸提取方法及其在ONT纳米孔测序中的应用。该核酸提取方法依次包括如下步骤：采用NI buffer消化裂解样本，得到样本裂解液；NI buffer中含有Spermidine、Spermine、蔗糖、KCl和Tris base；琼脂糖包埋；采用EPS buffer裂解；所述EPS buffer中含有蛋白酶和十二烷基肌氨酸钠；融化，之后纯化，获得样本的核酸。实验证明，采用该方法提取的核酸具有如下优点：提高了核酸的长度和纯度；提高了ONT测序平台N50长度；操作简单，耗时短(仅4h)；能够用于ONT纳米孔测序。本发明具有重要的应用价值。
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